柯薩奇病毒A16型VP1基因和病毒生物物理學(xué)分析
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更多相關(guān)文章: 手足口病 柯薩奇A組型 種系發(fā)生樹(shù)
【摘要】:目的分析柯薩奇病毒A組16型(CoxA16)西安分離株VP1基因序列,探討西安分離株基因亞型以及病毒顆粒的生物學(xué)特性。方法采集臨床診斷為手足口病患兒的糞便標(biāo)本,RTPCR方法檢測(cè)糞便標(biāo)本,CoxA16核酸檢測(cè)陽(yáng)性的糞便標(biāo)本經(jīng)處理后接種于RD細(xì)胞分離病毒。擴(kuò)增CoxA16分離株VP1基因序列并測(cè)序。利用DNA Man、ClustalX 1.83和MEGA 4.0軟件分析VP1基因和氨基酸序列。純化CoxA16病毒顆粒,福爾馬林滅活后電鏡觀(guān)察病毒顆粒的形狀。結(jié)果成功從糞便標(biāo)本中分離CoxA16病毒株,并獲得CoxA16分離株VP1基因序列,該核苷酸編碼區(qū)序列長(zhǎng)度為891 bp,編碼297個(gè)氨基酸序列;VP1基因比對(duì)顯示,該分離株與其他不同地區(qū)的代表株核苷酸和氨基酸同源性分別為76.76%~97.57%和92.16%~100.0%;種系進(jìn)化分析顯示分離株屬于B1a基因亞型的一個(gè)分支,與BJ10-03同屬一個(gè)分支。透射電鏡下病毒顆粒為20面體立體對(duì)稱(chēng),病毒顆粒大小均勻,直徑為20~30nm。結(jié)論西安CoxA16分離株屬于B1a基因亞型,分離株在形態(tài)上與其他腸道病毒相似。
【作者單位】: 陜西省人民醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)室;陜西省人民醫(yī)院兒科;
【關(guān)鍵詞】: 手足口病 柯薩奇A組型 種系發(fā)生樹(shù)
【基金】:“傳染病監(jiān)測(cè)技術(shù)平臺(tái)”項(xiàng)目(No.2013ZX10004202-001-002)
【分類(lèi)號(hào)】:R373
【正文快照】: 手足口病是由腸道病毒引起的感染性疾病,1:1、1%胎牛血清)。接種COXA16病毒陽(yáng)性分離上1957年首次在新西蘭報(bào)道,5歲以下兒童普遍易感。清0.5 ml,置于35°C、5%(:02的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),柯薩奇病毒A組16型(CoxA16)和腸道病毒71 每天用倒置顯微鏡觀(guān)察細(xì)胞形態(tài),當(dāng)CPE達(dá)到型(EV71)是
【參考文獻(xiàn)】
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