本文關(guān)鍵詞：丙型副傷寒沙門氏菌噬菌體SPC-P1在不同血清型中的分布及整合位點(diǎn)分析

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【摘要】：目的:確定丙型副傷寒沙門氏菌(Salmonella paratyphi C,SPC)噬菌體SPC-P1在其他血清型中是否存在,并確定其在宿主菌基因組中的整合位點(diǎn)。方法:以丙型副傷寒沙門氏菌RKS4594基因組中SPC-P1為模板,設(shè)計(jì)6對(duì)引物,分別在11株傷寒沙門氏菌、11株甲型副傷寒沙門氏菌、12株乙型副傷寒沙門氏菌和23株丙型副傷寒沙門氏菌中進(jìn)行SPC-P1片段的擴(kuò)增。同時(shí)下載美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中全基因組序列完成的100株20個(gè)血清型的沙門氏菌全基因組序列,通過(guò)Mauve 2.3.1軟件進(jìn)行比對(duì),以確定SPC-P1在各個(gè)血清型中的分布。根據(jù)SPC-P1在RKS4594基因組中的整合位點(diǎn),設(shè)計(jì)引物,對(duì)10株SPC-P1陽(yáng)性的丙型副傷寒沙門氏菌進(jìn)行擴(kuò)增,并對(duì)產(chǎn)物測(cè)序,根據(jù)測(cè)序結(jié)果分析SPC-P1整合情況。結(jié)果:SPC-P1廣泛存在于丙型副傷寒沙門氏菌基因組中,14株能夠擴(kuò)增到所有的6個(gè)片段,2株擴(kuò)增到3~5個(gè)片段,所有擴(kuò)增陽(yáng)性的片段與預(yù)期大小吻合。在傷寒沙門氏菌、甲型副傷寒沙門氏菌和乙型副傷寒沙門氏菌中,6個(gè)片段均陰性或僅存在1~2個(gè)片段,并且片段均比預(yù)期小。Mauve比對(duì)結(jié)果顯示,僅在與丙型副傷寒沙門氏菌進(jìn)化關(guān)系較近的豬霍亂沙門氏菌中存在接近完整SPC-P1的片段,但序列相似性存在差異。SPC-P1在丙型副傷寒沙門氏菌基因組中的整合位點(diǎn)是固定的,位于兩個(gè)相鄰基因pgt E和yfd C之間。結(jié)論:SPC-P1是丙型副傷寒沙門氏菌獨(dú)特的致病因子,其存在可能使得丙型副傷寒沙門氏菌的宿主范圍、致病性大小等功能方面有別于其他沙門氏菌。
【作者單位】： 北京大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】： 沙門菌 丙型副傷寒 細(xì)菌噬菌體 序列分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31100134)資助~~
【分類號(hào)】：R378.22
【正文快照】： 沙門氏菌屬是腸桿菌科中寄居于人類和動(dòng)物腸道的重要病原菌,目前已被確定有2 600多個(gè)血清型,大部分血清型引起自限性腸胃炎,少部分血清型(包括傷寒沙門氏菌,甲、乙、丙型副傷寒沙門氏菌)卻可以引起嚴(yán)重的系統(tǒng)感染,導(dǎo)致傷寒或副傷寒[1]。近幾年我國(guó)的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示,副傷寒沙門氏

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 戴婧;;一起由丙型副傷寒沙門氏菌引起食物中毒的報(bào)告[J];青海醫(yī)藥雜志;2012年07期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 陳瓊;李晶;唐雨德;魏德江;周東明;梁洪軍;孫軍紅;;一起食源性疾病暴發(fā)的病原學(xué)研究[J];東南國(guó)防醫(yī)藥;2013年04期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 陸幸兒;一起沙門菌引起食物中毒的報(bào)告[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2002年01期

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本文編號(hào)：787233