本文關(guān)鍵詞：家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽defensin基因的克隆、表達(dá)、純化及抑菌、抑腫瘤活性研究

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【摘要】：實(shí)驗(yàn)?zāi)康?1.在實(shí)驗(yàn)研究過(guò)程中我們對(duì)家蠅抗菌肽防御素(defensin)基因進(jìn)行生物信息學(xué)的分析；并應(yīng)用分子生物學(xué)方法從家蠅幼蟲(chóng)體內(nèi)提取抗菌肽防御素(defensin)基因，并對(duì)該基因進(jìn)行克隆、表達(dá)與純化。 2.鑒定已純化的家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素成熟肽(MD)部分對(duì)大腸桿菌E.coliK12D31的抑制作用；觀察抗菌肽防御素成熟肽(MD)對(duì)腫瘤細(xì)胞HepG2,SIHA,SW480和對(duì)人正常心肌細(xì)胞H9C2的抑制及殺傷作用；比較該防御素成熟肽(MD)與羥基脲分別對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2的作用效果。 3.觀察家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素成熟肽(MD)對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞周期的影響；觀察家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素成熟肽(MD)對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞凋亡的影響；觀察家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素成熟肽(MD)對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2凋亡蛋白半胱天冬氨酸蛋白酶-3(caspase-3)的影響，從而探究抗菌肽防御素成熟肽(MD)殺傷肝癌細(xì)胞HepG2的作用機(jī)制與原理。 實(shí)驗(yàn)方法 我們對(duì)家蠅抗菌肽防御素(defensin)基因的主要特性進(jìn)行生物信息學(xué)的分析。應(yīng)用蛋白質(zhì)分析專家系統(tǒng)（ExPASy）上的SOSUI、 ProtParam、HNN、TMHMM、MotifScan和NCBI上的ORF finder、Bcepred等生物信息學(xué)在線分析軟件進(jìn)行分析，并結(jié)合DNAman、Gene Runner等生物信息學(xué)分析軟件進(jìn)行分析、預(yù)測(cè)家蠅抗菌肽防御素defensin蛋白的可溶性及理化性質(zhì)、翻譯后修飾位點(diǎn)、跨膜區(qū)、親（疏）水性、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)及同源性分析，以及遺傳關(guān)系的比對(duì)等。 在Genbank中檢索家蠅defensin基因，根據(jù)其設(shè)計(jì)特異性引物，我們?cè)诩蚁売紫x(chóng)組織中提取RNA,并通過(guò)PCR聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增defensin基因成熟肽部分(Mature defensin, MD)，并將該基因與原核質(zhì)粒表達(dá)載體pGEX-6P-1進(jìn)行質(zhì)粒重組，構(gòu)建家蠅抗菌肽重組蛋白pGEX-6P-1/MD。通過(guò)雙酶切鑒定證明目的片段已穩(wěn)定融合到載體pGEX-6P-1中并將其轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中，經(jīng)25℃IPTG誘導(dǎo)在大腸桿菌E.Coli DH5ɑ中表達(dá)，用GST-Sefinose親和層析純化蛋白，表達(dá)產(chǎn)物經(jīng)15%SDS-PAGE分析鑒定。 應(yīng)用四甲基偶氮噻唑藍(lán)(MTT)法求出不同濃度抗菌肽MD對(duì)SW480，SIHA，HepG2腫瘤細(xì)胞的抑制率及對(duì)人心肌細(xì)胞H9C2的抑制作用。用MTT法對(duì)不同濃度抗菌肽防御素作腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線。采用MTT比色法分別求出不同濃度抗菌肽防御素與羥基脲對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2的抑制率，依據(jù)藥物濃度和抑制率用SPSS軟件求出防御素和羥基脲的半數(shù)抑制率(median inhibitory concentration，IC50)和回歸方程。我們采用AnnexinV-Fitc-PI雙染凋亡檢測(cè)試劑盒檢測(cè)抗菌肽防御素MD，檢測(cè)它能否引起肝癌細(xì)胞HepG2的細(xì)胞凋亡。我們用流式細(xì)胞儀檢測(cè)抗菌肽防御素MD，觀察它對(duì)肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞周期及凋亡的影響。本實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用caspase-3檢測(cè)試劑盒與酶標(biāo)測(cè)定儀檢測(cè)該蛋白caspase-3酶的活性。 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 我們通過(guò)生物信息學(xué)分析defensin蛋白由92個(gè)氨基酸組成，該蛋白的分子式為C435H670N126O124S9,它的分子質(zhì)量單位為9.9374ku，計(jì)算它的等電點(diǎn)理論值為8.75，檢測(cè)波長(zhǎng)280nm時(shí)的吸光度（A）值為0.637，半衰期為30h，該蛋白具有4個(gè)翻譯后修飾位點(diǎn)。家蠅防御素與其他三種蠅科昆蟲(chóng)防御素同源性較近。 以家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素成熟肽MD的cDNA為摸板進(jìn)行擴(kuò)增后獲得的堿基長(zhǎng)度為142bp的defensin基因片段，本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建重組質(zhì)粒pGEX-6P-1/MD;之后菌液通過(guò)IPTG誘導(dǎo)后進(jìn)行SDS-PAGE膠進(jìn)行分析，實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示了在大腸桿菌BL21（DE3）中防御素成熟肽MD基因片段高效表達(dá)，它的相對(duì)分子量（Mr）約30kDa。 本實(shí)驗(yàn)抑菌實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素對(duì)大腸桿菌E. coli K12D31有抑殺作用；我們用MTT法檢測(cè)顯示六種不同濃度（30μg/ml,60μg/ml,120μg/ml,360μg/ml,680μg/ml,1000μg/ml）抗菌肽防御素MD對(duì)SW480，SIHA，HepG2腫瘤細(xì)胞均有不同程度的抑制作用，實(shí)驗(yàn)結(jié)果與正常對(duì)照組比較結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)；這六種不同濃度抗菌肽防御素對(duì)人心肌細(xì)胞H9C2均無(wú)較明顯抑制作用，其實(shí)驗(yàn)結(jié)果與正常對(duì)照組相比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)；三種腫瘤細(xì)胞SW480，SIHA，HepG2在不同濃度抗菌肽防御素MD作用下生長(zhǎng)受到明顯抑制，，防御素濃度和作用時(shí)間對(duì)細(xì)胞的抑制作用呈劑量反應(yīng)關(guān)系；經(jīng)計(jì)算防御素與羥基脲的回歸方程分別為=-1.566+0.529x和=-2.342+0.597x，它們的IC50半數(shù)抑制率分別是909μg/ml和8416μg/ml，結(jié)果顯示兩者的IC50相差較大，那么表明防御素的細(xì)胞增殖抑制作用比羥基脲高。 用流式細(xì)胞儀檢測(cè)抗菌肽防御素MD對(duì)人肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞周期的影響結(jié)果：結(jié)果顯示GI期與M期的細(xì)胞比例有所增加，而S期細(xì)胞比例反而下降。顯示結(jié)果中只有GI期和S期與PBS對(duì)照組相比具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.01)，說(shuō)明抗菌肽防御素MD使HepG2細(xì)胞周期在GI期停滯致使S期DNA的合成受到抑制。SW480，SIHA，HepG2這幾種腫瘤細(xì)胞之間的增殖抑制率在不同濃度組抗菌肽防御素MD作用下均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)�？咕姆烙豈D對(duì)HepG2細(xì)胞caspase-3含量的影響結(jié)果：防御素組caspase-3的含量高于PBS對(duì)照組，兩者比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)論 通過(guò)生物信息學(xué)發(fā)現(xiàn)家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素defensin基因具有其特定的結(jié)構(gòu)，可能具有抗菌活性及其他生物學(xué)活性；家蠅抗菌肽融合蛋白pGEX-6P-1/MD被成功克隆和表達(dá)，證明這三種腫瘤細(xì)胞SW480，SIHA，HepG2都能被純化蛋白MD抑制殺傷，這為以后研發(fā)家蠅抗菌肽防御素類藥物提供了依據(jù)。 抗菌肽防御素MD能夠抑制大腸桿菌生長(zhǎng)繁殖活性；SW480，SIHA，HepG2三種腫瘤細(xì)胞均能被抗菌肽MD所抑制，但正常人體心肌細(xì)胞H9C2不能被其抑制；抗菌肽防御素比羥基脲對(duì)HepG2細(xì)胞具有更好的增殖抑制作用；SW480，SIHA，HepG2腫瘤細(xì)胞的抑制作用與抗菌肽MD呈劑量效應(yīng)關(guān)系；將傳統(tǒng)抗腫瘤藥物與家蠅抗菌肽防御素MD比較，家蠅抗菌肽MD既能有效殺傷腫瘤細(xì)胞，又不損傷正常人體心肌細(xì)胞H9C2；家蠅抗菌肽MD可能通過(guò)兩種途徑發(fā)揮抑制腫瘤作用：肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞周期受到抑制S期DNA的合成的影響；經(jīng)線粒體途徑誘導(dǎo)肝癌細(xì)胞HepG2細(xì)胞凋亡。
【關(guān)鍵詞】：防御素 生物信息學(xué)分析 基因克隆 原核表達(dá) 蛋白純化 羥基脲 細(xì)胞周期 細(xì)胞凋亡 SW480 SIHA HepG2
【學(xué)位授予單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R384.2;Q78
【目錄】：

• 縮略詞6-8
• 中文摘要8-12
• ABSTRACT12-17
• 第一章 綜述17-31
• 參考文獻(xiàn)27-31
• 第二章 家蠅防御素 DEFENSIN 生物信息學(xué)分析31-43
• 摘要31
• Abstract31-32
• 材料與方法32-33
• 結(jié)果33-39
• 討論39-41
• 參考文獻(xiàn)41-43
• 第三章 家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽防御素基因的克隆原核表達(dá)、純化及抑菌、抑腫瘤活性鑒定43-66
• 摘要43
• Abstract43-44
• 前言44-45
• 材料與方法45-54
• 結(jié)果54-62
• 討論62-64
• 參考文獻(xiàn)64-66
• 第四章 家蠅幼蟲(chóng)抗菌肽 MD 對(duì) SW480，SIHA，HEPG2 等腫瘤細(xì)胞的抑制作用研究66-84
• 摘要66-67
• abstract67-69
• 前言69-70
• 材料與方法70-74
• 結(jié)果74-79
• 討論79-82
• 參考文獻(xiàn)82-84
• 附錄84-95
• 已發(fā)文章95-96
• 致謝96-97
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷97

【參考文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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本文編號(hào)：630076