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篩選與CVB3 VP3蛋白相互作用的人細(xì)胞蛋白

發(fā)布時(shí)間:2017-08-06 13:29

  本文關(guān)鍵詞:篩選與CVB3 VP3蛋白相互作用的人細(xì)胞蛋白


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【摘要】:目的: 從人心臟cDNA文庫(kù)中篩選出與CVB3VP3蛋白相互作用的人細(xì)胞蛋白。 方法: 1.采用PCR技術(shù)擴(kuò)增出VP3基因,將其插入到真核表達(dá)質(zhì)粒pGBKT7中構(gòu)建重組誘餌質(zhì)粒pGBKT7-VP3; 2.采用乙酸鋰法將pGBKT7-VP3轉(zhuǎn)化至酵母菌AH109中,通過(guò)表型鑒定、PCR法驗(yàn)證質(zhì)粒pGBKT7-VP3是否轉(zhuǎn)化至酵母菌中; 3.利用Western blot檢測(cè)酵母菌AH109[pGBKT7-VP3]中VP3蛋白的表達(dá); 4.利用營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基以及酶底物X-α-Gal的變化情況檢測(cè)VP3基因?qū)?bào)告基因(HIS3、ADE2和MEL1)的轉(zhuǎn)錄自激活作用; 5.經(jīng)小規(guī)模配合試驗(yàn)檢測(cè)VP3蛋白對(duì)酵母菌配合功能的影響; 6.利用大規(guī)模酵母配合實(shí)驗(yàn)篩選人心臟cDNA文庫(kù); 7.經(jīng)陽(yáng)性克隆的表型確定、PCR擴(kuò)增cDNA插入片段和Alu I酶切等試驗(yàn)將陽(yáng)性克隆歸類,并進(jìn)行測(cè)序和同源性比對(duì)分析; 8.采用α-半乳糖苷酶定量分析VP3蛋白與各陽(yáng)性蛋白之間相互作用的強(qiáng)弱; 9.利用營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基以及酶底物X-α-Gal的變化情況檢測(cè)陽(yáng)性文庫(kù)質(zhì)粒pGADT7-ADx對(duì)報(bào)告基因(HIS3、ADE2和MEL1)的轉(zhuǎn)錄自激活作用; 10.利用回返配合試驗(yàn)對(duì)篩出的各陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白的相互作用再次進(jìn)行驗(yàn)證。 結(jié)果: 1.雙酶切及序列分析提示VP3基因已成功插入pGBKT7載體的多克隆位點(diǎn),并且閱讀框與病毒VP3基因一致; 2.表型鑒定和PCR法驗(yàn)證pGBKT7-VP3質(zhì)粒已成功轉(zhuǎn)入酵母菌AH109中; 3. Western blot證實(shí)酵母菌AH109[pGBKT7-VP3]能表達(dá)VP3蛋白; 4.營(yíng)養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基和酶底物X-α-Gal變化情況顯示VP3蛋白對(duì)報(bào)告基因無(wú)轉(zhuǎn)錄自激活作用; 5.小規(guī)模配合試驗(yàn)表明VP3蛋白在AH109的表達(dá)基本不影響酵母菌正常的配合功能。 6.以CVB3VP3為誘餌蛋白,從人心臟cDNA文庫(kù)中篩選到50個(gè)陽(yáng)性候選克; 7.經(jīng)陽(yáng)性候選克隆的初步分析將陽(yáng)性克隆歸為10類,,并經(jīng)測(cè)序和同源性比對(duì),最后共獲得10種不同類別的陽(yáng)性蛋白:線粒體乙醛脫氫酶2(ALDH2)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間室蛋白1(ERGIC1)、真核翻譯起始因子4A2(EIF4A2)、肌鈣蛋白I3型(TNNI3)、平滑肌蛋白3(LMOD3)、羥酰輔酶A脫氫酶三官能蛋白轉(zhuǎn)錄變體3(HADHB)、門(mén)冬酰胺酶同系物(ASPG)、3-磷酸甘油醛脫氫酶(GAPDH)、肌肉型肌酸激酶(CKM)、骨骼肌α1肌動(dòng)蛋白(ACTA1)。 8. α-半乳糖苷酶定量試驗(yàn)進(jìn)一步證明了篩選出的10種陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白均有較強(qiáng)的相互作用; 9.篩選出的10種陽(yáng)性蛋白對(duì)報(bào)告基因無(wú)轉(zhuǎn)錄自激活作用; 10.回返配合試驗(yàn)再次驗(yàn)證10種陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白存在相互作用。 結(jié)論: 1.成功構(gòu)建了重組質(zhì)粒pGBKT7-VP3; 2. CVB3VP3蛋白是一個(gè)適合用于酵母雙雜交系統(tǒng)的誘餌蛋白; 3.以CVB3VP3為誘餌蛋白,應(yīng)用大規(guī)模酵母配合實(shí)驗(yàn),從人心臟cDNA文庫(kù)中獲得10種與VP3蛋白發(fā)生相互作用的人細(xì)胞蛋白:ALDH2、ERGIC1、EIF4A2、TNNI3、 GAPDH、LMOD3、HADHB、ASPG、CKM、ACTA1;
【關(guān)鍵詞】:柯薩奇病毒 VP3 質(zhì)粒構(gòu)建 酵母雙雜交系統(tǒng)
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R363
【目錄】:
  • 摘要3-5
  • ABSTRACT5-10
  • 中英文縮略詞表10-12
  • 第1章 引言12-17
  • 1.1 柯薩奇病毒 B 組 3型(Coxsackievirus group B type 3,CVB3)12-14
  • 1.2 VP3 蛋白14
  • 1.3 酵母雙雜交系統(tǒng)(Yeast two-hybrid system,YTS)14-16
  • 1.4 本論文研究基礎(chǔ)和研究意義16-17
  • 第2章 材料與方法17-41
  • 2.1 材料17-25
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法25-41
  • 2.2.1 pGBKT7-VP3 重組質(zhì)粒的構(gòu)建(如圖 2.1)25-31
  • 2.2.2 pGBKT7-VP3 重組質(zhì)粒在酵母菌 AH109 中的表達(dá)31-33
  • 2.2.3 檢測(cè) DNA-BD-c-Myc-VP3 融合蛋白對(duì)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄自激活33-34
  • 2.2.4 檢測(cè) DNA-BD-c-Myc-VP3 融合蛋白對(duì)酵母菌配合的影響34
  • 2.2.5 大規(guī)模酵母配合實(shí)驗(yàn)34-36
  • 2.2.6 陽(yáng)性候選克隆的初步分析36-38
  • 2.2.7 α-半乳糖苷酶定量分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的強(qiáng)弱38-40
  • 2.2.8 檢測(cè)篩選出的 10種陽(yáng)性蛋白對(duì)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄自激活作用40
  • 2.2.9 回返配合實(shí)驗(yàn)40-41
  • 第3章 結(jié)果41-53
  • 3.1 VP3 基因的擴(kuò)增41
  • 3.2 重組質(zhì)粒 pGBKT7-VP3 的酶切分析41-42
  • 3.3 重組質(zhì)粒 pGBKT7-VP3 的基因測(cè)序42
  • 3.4 AH109 菌株的表型驗(yàn)證42
  • 3.5 陽(yáng)性酵母菌 AH109[pGBKT7-VP3]的表型驗(yàn)證42-43
  • 3.6 陽(yáng)性酵母菌 AH109[pGBKT7-VP3]中 VP3 基因的驗(yàn)證43
  • 3.7 VP3 融合蛋白表達(dá)的檢測(cè)43-44
  • 3.8 檢測(cè) VP3 融合蛋白對(duì)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄自激活作用44-45
  • 3.9 DNA-BD-c-Myc-VP3 蛋白對(duì)酵母配合功能影響的檢測(cè)45
  • 3.10 人心臟 cDNA 文庫(kù)滴定45
  • 3.11 陽(yáng)性候選克隆酶切歸類45-46
  • 3.12 DNA序列測(cè)定和同源性分析46-48
  • 3.13 VP3 蛋白與 10種陽(yáng)性蛋白相互作用強(qiáng)弱的分析48-50
  • 3.14 篩選出的 10種陽(yáng)性蛋白對(duì)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄自激活作用50-52
  • 3.15 VP3 蛋白與 10種陽(yáng)性蛋白相互作用的進(jìn)一步驗(yàn)證52-53
  • 第4章 討論53-60
  • 4.1 質(zhì)粒構(gòu)建載體的選擇53-54
  • 4.2 VP3 蛋白作為誘餌蛋白的可行性54
  • 4.3 研究與 VP3 蛋白相互作用蛋白的方法選擇54-55
  • 4.4 與 VP3相互作用的 10 種人細(xì)胞蛋白55-60
  • 4.4.1 TNNI355-56
  • 4.4.2 ALDH256-57
  • 4.4.3 ERGIC157
  • 4.4.4 CKM57-58
  • 4.4.5 EIF4A258
  • 4.4.6 ACTA158
  • 4.4.7 LMOD358-59
  • 4.4.8 HADHB59
  • 4.4.9 GAPDH59
  • 4.4.10 ASPG59-60
  • 第5章 結(jié)論與展望60-61
  • 5.1 結(jié)論60
  • 5.2 展望60-61
  • 致謝61-62
  • 參考文獻(xiàn)62-69
  • 附圖69-70
  • 攻讀學(xué)位期間的研究成果70-71
  • 綜述71-78
  • 參考文獻(xiàn)76-78

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 劉發(fā)娣;余克花;羅達(dá)亞;徐秋芳;莫冰;羅軍;劉晶星;黃孝天;;酵母雙雜交技術(shù)篩選與CVB3 VP1直接作用的細(xì)胞蛋白[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2009年10期

2 陳婉南;劉玲玲;吳云麗;焦伯延;林萬(wàn)松;林旭;;酵母雙雜交篩選與乙型肝炎病毒表面抗原中蛋白相互作用的肝細(xì)胞蛋白[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2010年10期

3 張國(guó)壽;羅順?lè)?吳燕斌;池閩輝;劉景豐;;酵母雙雜交法篩選與受翻譯調(diào)節(jié)的腫瘤蛋白相互作用的蛋白[J];腫瘤;2011年09期

4 李柏巖,喬國(guó)芬,周宏,李文漢,黃志剛,周令望;細(xì)胞內(nèi)游離鈣與柯薩奇病毒B_3誘導(dǎo)的大鼠培養(yǎng)心肌細(xì)胞凋亡(英文)[J];Acta Pharmacologica Sinica;1999年05期



本文編號(hào):630063

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