本文關鍵詞：南京市2012年-2013年腸道病毒71型分離株VP1基因特性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的了解南京地區(qū)腸道病毒71型流行株的遺傳學背景。方法采集2012年-2013年手足口病患者咽拭子樣本,經(jīng)特異性逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈式反應(RT-PCR)鑒定EV71病毒核酸陽性者進行細胞接種分離病毒。選取陽性分離株擴增其VP1完整編碼區(qū)全長基因并進行序列測定,利用生物信息學軟件對序列加以分析,構建序列遺傳親緣關系樹。結果共分離得到14株EV71毒株,經(jīng)VP1全長基因測序分析發(fā)現(xiàn),所分離病毒VP1區(qū)核苷酸與EV71病毒A型代表株同源性為79.6%~81.3%,與B型代表株的同源性為81.7%~84.7%,而與C型代表株的同源性明顯較高,為86.0%~95.2%,其中與C4代表株(AY895144)的同源性最高,為93.8%~95.2%。進化樹分析發(fā)現(xiàn)本地流行株與上海、安徽等地區(qū)流行株的親緣較近,而與臺灣地區(qū)流行株親緣較遠。相應的氨基酸位點分析也表明符合C基因型的氨基酸模式。結論南京地區(qū)2012年-2013年腸道病毒71型的流行株主要為C4亞型,與上海和安徽地區(qū)流行株親緣較近,可能具有同一來源。
【作者單位】： 南京市疾病預防控制中心;
【關鍵詞】： 腸道病毒型 手足口病 外殼蛋白VP 基因型
【基金】：南京市醫(yī)學科技發(fā)展專項資金(YKK11052)
【分類號】：R373.25
【正文快照】： 腸道病毒71型(EV71)是小RNA病毒科腸道病毒屬成員,其感染主要引起手足口病(HFMD)。手足口病是一類急性傳染病,主要表現(xiàn)為發(fā)熱和手、足、口腔及臀部等部位的皮疹及潰瘍,個別患者甚至會出現(xiàn)較為嚴重的并發(fā)癥,如無菌性腦炎、腦膜炎、肺水腫等[1]。自1969年EV71病毒首次從美國加利

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 葉予;;研究獲得腸道病毒71型精確結構[J];前沿科學;2013年01期

2 陳姝蒙;丁崢嶸;趙智嫻;羅梅;田炳均;湯晶晶;張杰;陸林;;云南省2012年邊境地區(qū)健康兒童腸道病毒監(jiān)測及基因特征分析[J];中國病毒病雜志;2013年03期

3 馬子行;沈美s，

本文編號：466000