目的運(yùn)用生物信息學(xué)方法預(yù)測分析結(jié)核分枝桿菌Rv2145c基因編碼蛋白Wag31的結(jié)構(gòu)與功能。方法由NCBI數(shù)據(jù)庫中獲得Rv2145c基因及蛋白Wag31的編碼序列,運(yùn)用ProtParam及ProtScale對Wag31蛋白的基本理化特性及親疏水性進(jìn)行預(yù)測分析;運(yùn)用NetPhos、TMHMM及SignalP 4.1分析Wag31的磷酸化位點(diǎn)、跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)及信號肽;分別運(yùn)用SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred以及SYFPEITHI等工具預(yù)測Wag31蛋白的二級、三級結(jié)構(gòu)以及抗原表位;運(yùn)用STRING預(yù)測Wag31蛋白的相互作用蛋白,并進(jìn)行富集分析。結(jié)果細(xì)胞壁合成蛋白Wag31由260個(gè)氨基酸組成,分子式為C₁₂₀₀H₁₉₄₆N₃₇₀O₄₁₀S₅,相對分子質(zhì)量28.277 18×10³,屬于不穩(wěn)定蛋白,具有親水性;蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析顯示,無規(guī)則卷曲(Cc)占24.23%,α-螺旋(Hh)、β-折疊(Ee)和β-轉(zhuǎn)角(Tt)含量分別占73.08%、1....

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【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
    2 方法
        2.1 Wag31蛋白的基本理化性質(zhì)分析
        2.2 Wag31蛋白的信號肽、跨膜區(qū)及磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
        2.3 Wag31蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.4 Wag31蛋白的抗原表位預(yù)測
        2.5 Wag31蛋白質(zhì)相互作用蛋白預(yù)測及富集分析
結(jié) 果
    1 Wag31蛋白的理化性質(zhì)
    2 Wag31蛋白的親疏水性
    3 Wag31蛋白信號肽、跨膜區(qū)及磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測
    4 Wag31蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    5 Wag31蛋白的三級結(jié)構(gòu)
    6 Wag31蛋白的抗原表位
    7 Wag31相互作用蛋白預(yù)測及富集分析
討 論



本文編號：3864469