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人心肌特異的新蛋白激酶p93在心臟發(fā)育、結構性心臟病中的功能與機制研究

發(fā)布時間:2020-07-22 04:43
【摘要】:心血管系統(tǒng)的發(fā)育、生理、病理等一系列過程主要由構成心血管系統(tǒng)基因組的20,900-27,160個基因控制(劉宗正教授,個人交流)。克隆與鑒定心血管系統(tǒng)疾病相關基因不但對我們了解心血管系統(tǒng)的發(fā)育及生理、病理機制具有重要意義,并可為臨床心血管疾病的治療提供基礎。 伴隨人類基因組計劃發(fā)展起來的生物信息學給尋找、研究心血管系統(tǒng)的重要功能和/或疾病相關基因帶來了新的契機。本研究在構建成人心臟cDNA文庫并進行新ESTs(expressed sequence tags)分離的基礎上,綜合數(shù)據(jù)庫及生物信息學分析,克隆出某些與心血管系統(tǒng)疾病相關的基因,并進一步進行功能鑒定。本文介紹其中兩條新全長cDNA,即心肌特異的蛋白激酶p93和肌組織特異的細胞骨架調(diào)節(jié)蛋白NELIN,現(xiàn)將主要研究結果概述如下: 一、我們在1p31-p21的房室間隔缺損區(qū)克隆到一新的蛋白激酶基因(GenBankac.AF116826),該基因cDNA全長約3420bp,含一個2505bp的完整閱讀框,可編碼835個氨基酸分子量約為93kD的蛋白質(zhì),故將其命名為p93。結構域分析表明p93含三種結構域:N端為7個錨蛋白重復(ankyrin repeats)結構域,中間為一激酶結構域,C末端為富含絲氨酸結構域。同源性分析提示p93為整合素連接激酶(integrin-linked kinase,ILK)的遠源同源基因。種系發(fā)生分析發(fā)現(xiàn)p93與ILK等可能同屬MAPKKKs家族成員。 用胎兒6種組織、成人8種組織的Northern Blot(Clontech)結果表明,p93僅只在胎兒和成人心臟表達一全長約3.42kb的轉錄本,而其它組織未見表達。經(jīng)76種組織的多組織點陣膜(Clontech MTE)雜交也證實,p93僅在成人及胎兒的心臟表達。在成人心臟各個部位的表達有以下特點:室間膈、心尖最強,右心房及右心室次之,左心室較弱,左心房最弱,其它各種組織未見表達。說明p93確為心臟特異表達的基因。 用核酸免疫法制備了兔抗p93的多克隆抗體,其抗體效價及特異性經(jīng)原核表達的蛋白進行了檢測。心肌免疫組化結果顯示,p93主要在成人與胎兒心肌細胞核內(nèi)表達,胞漿也有少量表達,心肌內(nèi)的血管平滑肌和內(nèi)皮細胞呈陰性。 用重疊延伸點突變PCR法構建p93(K490R)突變體,并對真核表達的p93及其突變體進行了激酶活性體外分析。結果顯示,僅野生型p93能自我磷酸化,而突變體及空載體未顯示相應的磷酸化蛋白條帶。 以C-端(第716-833aa)為誘餌,經(jīng)酵母雙雜交篩選預轉化的心臟cDNA文庫,結果發(fā)現(xiàn)p93能與下列三類蛋白發(fā)生相互作用:①屬肌小節(jié)蛋白的cTnI、MyBP-C、
【學位授予單位】:中國協(xié)和醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2002
【分類號】:R346
【圖文】:

心臟發(fā)育,生物信息學分析,心血管系統(tǒng),心臟病


為克隆心血管系統(tǒng)重要功能基因,我們構建了成人心臟的DcNA文庫,并在新ESTs分離基礎上,結合生物信息學分析,克隆了兩個可能與結構性心臟病和心臟發(fā)育有關的新基因夕刃、八乞Z,NI并對p93進行了功能鑒定。圖1是本文的研究策略。

示意圖,重組腺病毒,流程,示意圖


.1.重組腺病毒制備、純化利用pAdEasy系統(tǒng)產(chǎn)生重組腺病毒技術線路見圖3〔44]:9.1.1將目的基因p93克隆入pAdEasy轉移載體.考慮到將來細胞功能實驗時,為使p93蛋白的表達最高,設計引物,使讀碼框的第一個起始密碼AGT周圍序列為叢衛(wèi)AT巡,符合Kozak序列:即一3位是A,+4位是G。以PcNDA4一p93為模板,用高保真的puf酶將基因的整個讀碼框亞克隆入pUC18,序列經(jīng)測序準確無誤后,再用人》刀工和Hz’nd工H雙酶切將其亞克隆至腺病毒穿梭載體pAdTraek一CMV。PCR擴增條件如下:94Co4min:94℃455,55Colmin

房室間隔缺損,1號染色體,外顯子


所以本研究所克隆的p93的第四外顯子應該還缺3obp;冖佗诳紤],即p93的5’UTR還缺約36Obp,恰好相當于三個外顯子長度,所以p93應該有28個外顯子。p93的定位見圖5。2)轉錄起始位點、啟動子區(qū)及上游調(diào)控序列在p93上游確實發(fā)現(xiàn)了負責調(diào)控心臟特異基因表達的轉錄因子GATA結合位點鬧。然而由于生物體有一套基于外顯子(而非內(nèi)含子)的剪切機制,以至于外顯子的長度即使在不同種屬間(例如線蟲和果蠅)也比較保守,但內(nèi)含子的長度變異較大。而且由于真核生物的基因,其調(diào)控序列跨度較大,所以p93真正的起始位點及其啟動子區(qū)比較難以估計。所以研究刀刃轉錄調(diào)控機制還有待實驗的進一步研究。

【共引文獻】

相關期刊論文 前10條

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本文編號:2765341

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