中國人外源化合物反應(yīng)相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性研究
發(fā)布時(shí)間:2020-07-14 00:22
【摘要】: 單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是基因組多態(tài)性的主要形式,SNP計(jì)劃是人類基因組計(jì)劃的重要組成部分,對(duì)復(fù)雜疾病基因組學(xué)和藥物基因組學(xué)有重要應(yīng)用價(jià)值。外源化合物反應(yīng)系統(tǒng)介導(dǎo)了藥物毒物等的代謝、處置和效應(yīng),對(duì)這些基因群SNP的發(fā)掘和關(guān)聯(lián)或相關(guān)性研究,是著眼于個(gè)體化治療的遺傳藥理學(xué)和著眼于人群預(yù)防的腫瘤遺傳流行病學(xué)的重要內(nèi)容。 本研究是中國人SNP計(jì)劃的遺傳藥理學(xué)子項(xiàng)目,包括三個(gè)層次的研究?jī)?nèi)容:基于中國人群參考樣本和PCR-Resequencing的SNP發(fā)掘技術(shù)平臺(tái),建立候選基因SNP系統(tǒng)目錄,同時(shí),著眼于連鎖不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)模式和單倍型結(jié)構(gòu),建立基于SNP數(shù)據(jù)的遺傳分析方法;通過基因型與藥動(dòng)學(xué)表型的相關(guān)性分析,研究重要藥物反應(yīng)相關(guān)基因的遺傳藥理學(xué);通過基于醫(yī)院的病例對(duì)照研究,分析外源化合物處置相關(guān)基因SNP與我國常見腫瘤的易感性的關(guān)聯(lián)。 在本研究論文中,我們首先建立了中國人20個(gè)重要外源化合物反應(yīng)相關(guān)基因的SNP系統(tǒng)目錄,共發(fā)掘了271個(gè)SNP,并對(duì)候選基因的SNP分布、核苷酸與單倍型多態(tài)性,以及LD模式進(jìn)行了初步描述;其中,我們解析了兩個(gè)ABC轉(zhuǎn)運(yùn)體基因的LD模式和單倍型結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)盡管基因內(nèi)重組等使LD模式很不規(guī)則,但均可解析出單倍型多態(tài)性較低的少數(shù)LD模塊,說明LD和單倍型分析可為遺傳關(guān)聯(lián)研究的標(biāo)記選擇和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供重要信息。這樣,通過SNP發(fā)現(xiàn)和多態(tài)性數(shù)據(jù)遺傳分析的平臺(tái),為整個(gè)項(xiàng)目奠定了研究材料和方法的基礎(chǔ)。在遺傳藥理學(xué)方面,通過對(duì)組胺甲基轉(zhuǎn)移酶基因HNMT表型已知人群的SNP篩查和基因型與表型的相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)調(diào)控區(qū)的幾個(gè)常見SNP與酶活表型在女性中有相關(guān)性,提示HNMT可能受雌激素等調(diào)控,從而深入了對(duì)HNMT的遺傳藥理學(xué)和表達(dá)調(diào)控的認(rèn)識(shí);在腫瘤易感性方面,通過大規(guī)模的病例對(duì)照研究,發(fā)現(xiàn)煙氣主要致癌物NNK的代謝酶基因CYP2A13的一個(gè)功能SNP與肺癌尤其是其中的腺癌風(fēng)險(xiǎn)降低顯著關(guān)聯(lián),首次在群體水平證實(shí)了該基因在肺癌病因?qū)W中的作用。
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2003
【分類號(hào)】:Q987
本文編號(hào):2754192
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2003
【分類號(hào)】:Q987
【參考文獻(xiàn)】
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1 杜若甫;對(duì)開展中國人類基因組多樣性研究的思考[J];中國科學(xué)院院刊;1997年06期
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