【摘要】： TTV有著不同于其它DNA病毒的不尋常程度的基因異質(zhì)性。為了研究TTV 的新變種，我們收集了中國大陸不同地區(qū)的不同人群的血清，利用TTV原型TA278 的引物，經(jīng)PCR擴(kuò)增，得到約3244bp的片段。12株ORF1的核苷酸序列進(jìn)行最大 同源性的對準(zhǔn)比較，得到了這12株TTV的無根進(jìn)化樹。按照它們的遺傳距離，這 12株分屬于8個(gè)不同的組（A—H），其中TCHNH1屬于TTV基因1a型，TCHNA 與GENEBANK注冊的TUS01遺傳距離最近，TCHNG2與GENEBANK注冊的 SANBAN遺傳距離最近。這些TTV新變種與TA278的遺傳距離超過0.41（TCHNH1 除外）；TCHNA、TCHNB與TUS01遺傳距離分別為0.22、0.41；TCHNF、TCHNG1、 TCHNG2與SANBAN的遺傳距離分別是0.36、0.30、0.11；各小組間的遺傳距離 （TCHNC1與TCHNC2、TCHND1與TCHND2、TCHNE1與TCHNE2、TCHNG1 與TCHNG2）分別為0.30、0.22、0.04、0.30。ORF1編碼426～780個(gè)氨基酸，ORF2 編碼141～156個(gè)氨基酸。ORF1 ATG啟始密碼子附近有類似真核蛋白質(zhì)翻譯起始的 共同序列（ACCATGG），ORF1終止密碼子的下游都有一個(gè)保守的真核mRNA的 polyA加尾信號序列（AATAA）。12株ORF1與TA278的核苷酸序列同源性為 48.3-55.0％（TCHNH1除外）；ORF1氨基酸與TA278的同源性為36.2-48.9％ （TCHNH1為96.0％），ORF2氨基酸與TA278的同源性為40.0％-46.2％（TCHNH1 為94.0％），氨基酸同源性低于核苷酸序列同源性。ORF1的前65個(gè)氨基酸富含精 氨酸，同源性也高達(dá)56.5％～70.0％；第286～403氨基酸區(qū)域是一高變區(qū)，同源性只 有17.7％～27.0％；與TA278相比，ORF1氨基酸許多位點(diǎn)存在缺失或者插入，只有 65-273，401-491和611-674位點(diǎn)之間沒有缺失或插入。盡管氨基酸同源性非常低， 但是所有ORF1蛋白和ORF2蛋白都有非常相似的親水性特征。所有ORF1蛋白有 1～9個(gè)糖基化位點(diǎn)，一個(gè)YXXK的復(fù)制酶基序（亞單位結(jié)構(gòu)域），多個(gè)激酶磷酸化 位點(diǎn)，，ORF1蛋白可能為TTV的核衣殼蛋白；而ORF2蛋白有類似CAV ORF2的 基序（W-X7-H-X3-C-X1-C-X5-H）。總之，盡管這些序列的高度異質(zhì)性，但是它們 都有相似的基因組結(jié)構(gòu)，相似的閱讀框，相似的親水性特征和共同的基序（亞單位 結(jié)構(gòu)域），因此這些不同的TTV或者TTV-like病毒可能屬于我們至今仍不甚了解 的新的病毒家族。 我們曾經(jīng)報(bào)道過TTV可能通過腸道傳播引起類似肝炎的疾病暴發(fā)，我們也在 猴子的實(shí)驗(yàn)感染中證實(shí)了TTV的腸道傳播。為了確定TTV的特異的組織嗜性，在 感染了TTV的猴子病毒血癥期間，收集猴子的各種組織，通過單/雙鏈探針的斑點(diǎn) 雜交，檢測病毒DNA在各種組織中的存在形式。由于病毒DNA的極性，正義DNA 可能是病毒的復(fù)制中間體。在斑點(diǎn)雜交實(shí)驗(yàn)中，我們檢測到猴于的肝臟、小腸和骨 髓組織有正義 DNA。而且我們檢測到肝臟中病毒量是血清中的 13．2～78＊倍。因此 肝、骨髓和小腸可能是病毒的復(fù)制場所，故TTV可能具嗜肝性。
【學(xué)位授予單位】：第一軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2001
【分類號】：R373

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2601970