基于HLA三維結(jié)構(gòu)模建預(yù)測GVHD的基礎(chǔ)與臨床應(yīng)用研究
【圖文】:
)區(qū)域圖2-6. HLA-II分子RMSD計算(左)及RMSD-Revised計算(右)區(qū)域2.4 HLA三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫的采集整理及分析運(yùn)算結(jié)果包括整體RMSD值及Revised值,后臺數(shù)據(jù)用Microsoft OfficeAccess數(shù)據(jù)庫軟件管理,目前有160余萬條記錄。同時,我們用VC語言編制了數(shù)據(jù)庫管理工具——HLAStrucMark系統(tǒng),能夠快捷簡便的進(jìn)行HLA-A、B、C、DRB1、DQB1、DPB1位點(diǎn)之間任意兩個分子的整體均方差距離的查詢。還能夠展示HLA分子之間不匹配氨基酸殘基的詳細(xì)資料,如:在分子中所處的具體位置,在該位置的氨基酸的功能,是否處于錨定殘基結(jié)合袋內(nèi),是否于呈遞肽段結(jié)合以及是否與TCR結(jié)合等具體資料。這些資料在評價分子間的功能差異時,可以用作很重要的參考
201044圖2-7A. HLAStrucMark系統(tǒng)及后臺數(shù)據(jù)圖2-7B. HLAStrucMark系統(tǒng)及后臺數(shù)據(jù)2.5 HLA分子間均方根偏差分布整理HLA-A、-B、Cw、-DRB1、-DPB1及-DQB1位點(diǎn)計算的RMSD及RMSD-Revised數(shù)據(jù),不同位點(diǎn)的結(jié)果分布各有特征,詳見圖2-8、2-9、2-10、2-11、2-12及2-13。各個位點(diǎn)修正后的RMSD值普遍減小,尤其是HLA-Cw位點(diǎn)較突出,而HLA-DRB1的計算結(jié)果經(jīng)過修正后整體分布并沒有太多改變。15.6%20.0%6.5%27.6%24.6%5.7%0
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號】:R392
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,本文編號:2585255
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