鼠疫耶爾森氏菌候選疫苗靶標的篩選與初步驗證
本文選題:鼠疫菌 + 反向疫苗學; 參考:《中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院》2008年博士論文
【摘要】: 背景鼠疫是由鼠疫耶爾森氏菌(Yersinia pestis)(簡稱鼠疫菌)引起的一種甲類傳染病,多重耐藥菌株的產(chǎn)生以及鼠疫菌可以用做生物武器的可能給鼠疫的預防、治療帶來了困難。有效的疫苗接種能阻斷鼠疫的傳播,達到最終消滅鼠疫的目的。但是,迄今為止,還沒有一種能夠在大范圍內(nèi)使用并且切實有效的鼠疫疫苗。滅活及減毒活疫苗在20世紀亞洲鼠疫流行地區(qū)中的應用十分廣泛,免疫原性與反應性的變異及短期的保護力意味著通過在整個疫區(qū)接種這類疫苗來防御鼠疫并不可行。鼠疫亞單位疫苗和DNA疫苗的研究主要集中在鼠疫菌已知的兩個主要保護性抗原F1(莢膜抗原)和LcrV(V抗原)上。基于F1和LcrV抗原基礎(chǔ)上的疫苗對腺型鼠疫具有理想的保護效果,但這類疫苗對肺型鼠疫的保護效果不甚理想。另外,鼠疫自然疫源地中存在的F1-菌株也能引起人類感染,而V抗原存在血清學變異。因此尋找其它的具有免疫保護作用的蛋白并將其與F1和LcrV抗原聯(lián)合免疫或制備多亞單位疫苗是鼠疫疫苗研究的一個方向。除體液免疫外,細胞免疫是鼠疫免疫的一個重要組成部分,同時能夠刺激機體產(chǎn)生體液免疫和細胞免疫的疫苗將能更有效地預防鼠疫。目前,關(guān)于鼠疫菌感染后細胞免疫的研究還很少,最近的研究發(fā)現(xiàn),鼠疫菌在感染過程中產(chǎn)生的T細胞免疫不只是針對F1和LcrV抗原,還有其它蛋白在對鼠疫菌細胞免疫保護過程中起著作用。本課題的研究目的就是通過蛋白芯片和Elispot技術(shù)對鼠疫菌感染后機體體液免疫和細胞免疫反應進行檢測從而尋找在鼠疫菌感染過程中能夠刺激體液和/或細胞免疫反應的蛋白,并對部分篩選出來的蛋白進行免疫保護性的初步評價。 方法通過PSORTb、SignalP和ProtcompB等生物信息學軟件對鼠疫菌CO92株基因組所有編碼蛋白的細胞定位進行預測,并利用TopPred軟件分析蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域,挑選出所有跨膜區(qū)少于4個的鼠疫菌的膜相關(guān)性蛋白或分泌性蛋白。結(jié)合現(xiàn)階段對鼠疫菌毒力、進化、疫苗以及對其它微生物的疫苗等相關(guān)研究,挑選出所有鼠疫菌已知的、推測的毒力相關(guān)基因以及與在其它微生物的具有免疫保護性蛋白具有同源性的相關(guān)基因。利用Gateway重組克隆技術(shù)或限制性內(nèi)切酶酶切克隆技術(shù)將要表達的基因克隆至表達載體pDEST17或pET32a上并在大腸桿菌BL21(DE3)中表達,在大腸桿菌中表達的目的蛋白通過Ni-NTA層析柱純化。利用Elispot試驗檢測重組表達蛋白體外刺激鼠疫菌EV76減毒活疫苗株免疫小鼠的脾細胞中分泌IFN-γ的細胞數(shù),從而尋找能夠刺激明顯T淋巴細胞反應的鼠疫菌蛋白。同時利用所有體外重組表達的鼠疫菌蛋白所構(gòu)建的蛋白芯片,檢測感染鼠疫菌的貓、狗、人血清中抗鼠疫菌蛋白的抗體種類和反應強度,并通過對不同溫度(26°C和37°C)培養(yǎng)條件下的鼠疫菌吸收后的患者血清抗體譜的分析尋找鼠疫菌可能的毒力相關(guān)或膜相關(guān)性蛋白。將部分挑選出的具有體液免疫和/或細胞免疫功能的蛋白免疫小鼠進行蛋白免疫保護功能的檢測,被初步證明具有免疫保護功能的蛋白將作為候選疫苗靶標進行進一步的研究。 結(jié)果通過生物信息學分析并結(jié)合目前對鼠疫菌的研究,共挑選出261個鼠疫菌基因作為篩選鼠疫菌疫苗亞單位的靶標。利用Array Designer軟件設(shè)計相應的引物,片段800bp的基因盡量表達全長,大于800bp的基因通過DNAStar軟件分析后表達預測抗原性較好的片段。通過Gateway重組克隆技術(shù)或限制性內(nèi)切酶酶切克隆技術(shù)將要表達的基因克隆至表達載體pDEST17或pET32a上,根據(jù)重組大腸桿菌克隆的SDS-PAGE電泳結(jié)果,有174個重組克隆能夠在大腸桿菌中表達相應的鼠疫菌蛋白。由于所挑選基因編碼蛋白大多數(shù)為膜相關(guān)性蛋白,通過Ni-NTA純化和PBS透析后最終只有101個鼠疫菌重組蛋白的濃度與純度滿足進行細胞免疫功能檢測的要求。利用Elispot試驗檢測EV76疫苗株免疫小鼠后小鼠針對鼠疫菌的細胞免疫反應情況,34個鼠疫菌蛋白體外能夠明顯的刺激EV76免疫小鼠的脾細胞分泌IFN-γ,這些蛋白被認為能夠刺激T細胞免疫反應。另一方面,構(gòu)建了包括218個鼠疫菌蛋白的蛋白芯片,通過對蛋白芯片與鼠疫菌感染的貓、狗和患者血清反應的抗體譜的分析,發(fā)現(xiàn)了20個可能在鼠疫菌侵入機體后為適應機體環(huán)境或者其它壓力條件而特異性合成的蛋白,這些蛋白可能與細菌在人體內(nèi)的毒力相關(guān)。結(jié)合體液免疫和細胞免疫的結(jié)果,初步對28個蛋白的免疫保護性進行檢測,結(jié)果有9個蛋白能夠?qū)?0LD50鼠疫菌201株的攻擊產(chǎn)生部分保護力。 結(jié)論通過對鼠疫菌感染后機體體液免疫與細胞免疫反應情況的分析,對28個能刺激體液和/或細胞免疫反應的蛋白的免疫保護性進行了檢測,初步證明了9個蛋白能夠?qū)Φ蛣┝渴笠呔?01株的攻擊提供部分保護力。通過本課題的研究建立了鼠疫菌反向疫苗學研究的技術(shù)路線,縮短了鼠疫菌疫苗研究的時間,為后續(xù)鼠疫菌疫苗研究提供了靶標。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2008
【分類號】:R392
【相似文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 楊林,林紀春,徐秉臣;ELISA雙抗體夾心法檢測FI抗原在鼠疫菌鑒定中的初步應用[J];地方病通報;1987年03期
2 小次仁,陳虹,于德江;自尸體一手指骨檢出鼠疫菌的報告[J];西藏醫(yī)藥雜志;1993年02期
3 董興齊;鼠疫菌質(zhì)粒種類功能及在流行病學中的應用進展[J];預防醫(yī)學情報雜志;1994年03期
4 顧峰,申晶,宋志忠,楊桂榮,趙銘山;感染鼠疫菌的植物作為傳染源的研究[J];中國地方病防治雜志;1998年03期
5 汪立茂,宋曉玉,薛梅,李富忠,蔣和柱,王曉;四川省首次檢出鼠疫菌情況分析[J];中國地方病防治雜志;1999年05期
6 谷春廣,張春華,叢顯斌,閆衛(wèi)東,徐國鑫,王忠惠,岳明祥,趙銘山,張晶仁;吉林西北部草原鼠疫菌表型性狀的研究[J];中國地方病防治雜志;2000年04期
7 王忠惠,谷春廣,張春華,閆衛(wèi)東,叢顯斌,徐國鑫,岳明祥,張晶仁;吉林西北部草原鼠疫菌外膜蛋白的研究[J];中國地方病防治雜志;2001年04期
8 戴瑞霞,金麗霞,祁芝珍;西藏藏南地區(qū)鼠疫菌某些生物學特征及流行病學分析[J];中國地方病防治雜志;2001年06期
9 孫利仁,張春華,叢顯斌,劉振才;鼠疫菌質(zhì)粒及變異分析[J];中國地方病防治雜志;2002年03期
10 徐成,房靜,孫啟庭,孫鑫廣,張鐵軍;蚤與鼠疫菌之間的生物學關(guān)系[J];中國地方病防治雜志;2002年06期
相關(guān)會議論文 前10條
1 熱娜·吐爾地;徐秉臣;阿扎提·熱合木;孫石;雷剛;;酶免疫染色法快速檢驗鼠疫菌[A];新世紀預防醫(yī)學面臨的挑戰(zhàn)——中華預防醫(yī)學會首屆學術(shù)年會論文摘要集[C];2002年
2 董興齊;張洪英;彭和碧;Chu C.May;;鼠疫菌—新質(zhì)粒的限制性酶切圖譜[A];西部大開發(fā) 科教先行與可持續(xù)發(fā)展——中國科協(xié)2000年學術(shù)年會文集[C];2000年
3 宋亞軍;;鼠疫耶爾森氏菌比較與進化基因組學研究[A];2006中國微生物學會第九次全國會員代表大會暨學術(shù)年會論文摘要集[C];2006年
4 薛強;王靜;鄒明強;李錦豐;王楠;周朋;邱月明;陳彥長;;應用微流控芯片快速檢測血清中鼠疫抗體[A];第三屆全國微全分析系統(tǒng)學術(shù)會議論文集[C];2005年
5 葉楓;李俊勇;尹家祥;;云南省南部及東南部鼠疫菌質(zhì)粒圖譜分析及其流行病學意義[A];西部大開發(fā) 科教先行與可持續(xù)發(fā)展——中國科協(xié)2000年學術(shù)年會文集[C];2000年
6 陳雷;隋傳宇;陳虹;邵東華;楊健美;苑純秀;馮新港;林矯矯;;日本血吸蟲分泌型和跨膜蛋白分子T輔助細胞表位的預測與鑒定[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜寄生蟲學分會第六次代表大會暨第十次學術(shù)研討會論文集[C];2009年
7 張濤;;鼠疫研究與控制措施(綜述)[A];第八屆粵港澳臺預防醫(yī)學學術(shù)交流會議論文匯編[C];2008年
8 吳小紅;李豫川;嚴格;曹軍田;王翠娥;;鼠疫耶爾森氏菌感染小鼠的病理學觀察[A];第六屆全國生物醫(yī)學體視學學術(shù)會議暨第九屆全軍軍事病理學學術(shù)會議、第五屆全軍定量病理學學術(shù)會議論文匯編[C];2005年
9 季恒青;賈慶良;汪新麗;蘇培學;吳國輝;毛德強;張春華;;三峽庫區(qū)重慶段鼠疫預警研究[A];重慶市預防醫(yī)學會2009年論文集[C];2009年
10 戴二黑;;鼠疫耶爾森菌基因組重排譜分型的研究[A];第五次全國中青年檢驗醫(yī)學學術(shù)會議論文匯編[C];2006年
相關(guān)重要報紙文章 前10條
1 王雪飛;鼠疫檢測新技術(shù)身手不凡 30分鐘內(nèi)鎖定鼠疫菌及抗體[N];健康報;2007年
2 李偉;中蒙聯(lián)手開展鼠疫等病原監(jiān)測研究[N];中國國門時報;2007年
3 本報記者 何秀麗;731部隊核心隊員揭露活體解剖[N];哈爾濱日報;2008年
4 王秀華;細菌戰(zhàn)犯元兇石井四郎逃脫國際審判揭秘[N];中國檔案報;2005年
5 《中華人民共和國鼠疫與環(huán)境圖集》研制組;按圖索“鼠” 辨疫知因[N];健康報;2001年
6 中國預防醫(yī)學科學院流行病學微生物學研究所 研究員 張見麟;“恐怖微生物”——炭疽、鼠疫、天花[N];健康報;2001年
7 本報記者 劉安平 郝廣福;嚴把國門 聯(lián)防聯(lián)控[N];中國國門時報;2006年
8 崔尚金;聚焦老而不朽的人畜共患。菏笠遊N];中國畜牧獸醫(yī)報;2005年
9 本報記者 龔保華;他與歷史見證人對話[N];吉林日報;2005年
10 自治區(qū)地方病防治研究所供稿;提高防護意識 消除鼠疫危害[N];西藏日報;2003年
相關(guān)博士學位論文 前10條
1 李蓓;鼠疫耶爾森氏菌候選疫苗靶標的篩選與初步驗證[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2008年
2 譚亞芳;鼠疫耶爾森氏菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)效應蛋白YopK在致病機制中的作用研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2011年
3 陳澤良;鼠疫耶爾森氏菌密度感應系統(tǒng)與毒力關(guān)系研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2005年
4 趙忠鵬;布魯氏菌毒力、免疫相關(guān)分子的篩選研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2008年
5 周蕾;鼠疫耶爾森氏菌密度感應系統(tǒng)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2007年
6 劉麗娜;基于全基因組序列分析篩選豬鏈球菌2型保護性抗原及其實驗驗證[D];第三軍醫(yī)大學;2008年
7 柯躍華;鼠疫菌蛋白YpkA和人蛋白VASP的相互作用和功能研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2011年
8 洪文艷;UPT十通道免疫層析試紙盤檢測技術(shù)平臺的建立及其在鼠疫菌抗體譜篩查中的應用[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2010年
9 王斌;甲型副傷寒沙門菌CMCC 50973的基因表達譜及外膜蛋白BtuB的保護性研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2012年
10 王鵬;鼠疫診斷潛在靶點的篩選[D];中國疾病預防控制中心;2010年
相關(guān)碩士學位論文 前10條
1 汪潔英;鼠疫雙組分疫苗的免疫學評價[D];福建醫(yī)科大學;2011年
2 劉軼然;示蹤鼠疫菌構(gòu)建及吞噬細胞對其吞噬能力的觀察[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2011年
3 尚帥;載鼠疫亞單位疫苗的多孔微球[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2010年
4 王旺;鼠疫亞單位疫苗的制備及其在獼猴中的免疫保護作用評價[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2010年
5 姜慧;1942年河套地區(qū)鼠疫研究[D];內(nèi)蒙古大學;2012年
6 尤敬民;1911年直隸鼠疫防治研究[D];河北師范大學;2012年
7 王娜;中國鼠疫菌單核苷酸多態(tài)性研究[D];中國疾病預防控制中心;2011年
8 岳明祥;用于食品中鼠疫耶爾森菌的納米膠體金快速檢測技術(shù)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2006年
9 譚亞芳;肽核酸(PNA)探針檢測鼠疫耶爾森氏菌的研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2006年
10 王棠;鼠疫菌天然F1與重組rV270抗原的制備及其免疫保護作用的研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2008年
,本文編號:1756972
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/1756972.html