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廣西毛南族12個(gè)X-STR基因座的遺傳多態(tài)性

發(fā)布時(shí)間:2017-11-11 09:13

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【摘要】:目的:為了獲取廣西毛南族12個(gè)X-STR基因座(DXS7133、DXS8378、DXS981、DXS7424、DXS6789、DXS10159、GATA165B12、DXS101、DXS7423、GATA31E08、DXS10164和DXS10162)的等位基因頻率分布、基因型頻率分布、單倍型等相關(guān)群體遺傳多態(tài)性指標(biāo),并利用相關(guān)指標(biāo)計(jì)算廣西毛南族人群與國內(nèi)已有文獻(xiàn)報(bào)道的其他民族人群的遺傳距離,初步探討廣西毛南族人群與這些民族人群之間的親緣關(guān)系。 方法:(1)樣本采集:采集廣西環(huán)江縣下南鄉(xiāng)三代以上均為毛南族的117名(女55,男62)健康無關(guān)個(gè)體的靜脈血樣2ml置入5ml枸櫞酸鈉抗凝管中,-20℃冰箱內(nèi)保存?zhèn)溆谩#?)實(shí)驗(yàn)方法:采用Chelex-100法提取DNA,應(yīng)用AGCU X12STR擴(kuò)增體系經(jīng)9700型PCR儀擴(kuò)增后,在3130型遺傳分析儀上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,然后用GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行分析。(3)數(shù)據(jù)處理:采用直接計(jì)數(shù)法觀察12個(gè)基因座的等位基因頻率、基因型頻率和單倍型頻率,利用在線軟件(http://www.chrx-str.org)計(jì)算多態(tài)信息含量,采用χ2檢驗(yàn)對(duì)女性基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗(yàn)。用Phylip3.69軟件統(tǒng)計(jì)不同群體之間的Nei氏遺傳距離,并根據(jù)該遺傳距離用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(UPGMA法)。 結(jié)果:(1)在廣西毛南族12個(gè)X-STR基因座上分別檢出4、5、10、7、9、6、5、11、3、7、8和6個(gè)等位基因;其中55名女性樣本中共檢出5、9、23、19、18、16、7、25、5、17、12和15個(gè)基因型,12個(gè)X-STR基因座的女性基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05);共檢出男性樣本DXS10159-DXS10162-DXS10164與DXS101-DXS7424兩組連鎖基因座單倍型為34、28種,單倍型多樣性分別為0.9714和0.9228;12個(gè)X-STR基因座的累積男性個(gè)體識(shí)別率為0.99999954,累積女性個(gè)體識(shí)別率為0.99999999,累積三聯(lián)體非父排除率為0.99999798,累積二聯(lián)體非父排除率為0.99986322。(2)廣西毛南族人群與其他不同民族人群之間進(jìn)行遺傳距離和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析后發(fā)現(xiàn),廣西毛南族與浙江漢族的遺傳距離最小,為0.0060;與濰坊漢族的遺傳距離次之,為0.0211;而與內(nèi)蒙古達(dá)斡爾族的遺傳距離相對(duì)最遠(yuǎn),為0.2665。 結(jié)論:12個(gè)X-STR基因座在廣西毛南族人群中具有高度的遺傳多態(tài)性,在法醫(yī)學(xué)個(gè)人識(shí)別、親權(quán)鑒定及群體遺傳學(xué)等領(lǐng)域的研究中具有重要應(yīng)用價(jià)值。遺傳距離和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析發(fā)現(xiàn),在用于比較的7個(gè)民族范圍內(nèi),,廣西毛南族人群與浙江漢族、濰坊漢族人群的親緣關(guān)系較為密切,與內(nèi)蒙古達(dá)斡爾族則較疏遠(yuǎn)。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R394

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本文編號(hào):1170728

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