本文關(guān)鍵詞：剛地弓形蟲(chóng)ROP18基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的對(duì)剛地弓形蟲(chóng)RH株的棒狀體蛋白18(TgROP18)基因進(jìn)行克隆,同時(shí)采用生物信息學(xué)分析TgROP18蛋白序列。方法提取剛地弓形蟲(chóng)RH株速殖子總RNA,根據(jù)TgROP18基因(GenBank登陸號(hào)為AM075204)的開(kāi)放閱讀框設(shè)計(jì)引物,采用逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)擴(kuò)增ROP18基因,并對(duì)其產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序;采用在線生物軟件預(yù)測(cè)TgROP18蛋白的結(jié)構(gòu)與功能。結(jié)果 TgROP18基因RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物與預(yù)期一致,大小為1 665bp;測(cè)序分析顯示,ROP18基因序列與GenBank上已發(fā)表的序列完全一致。TgROP18蛋白含有554個(gè)氨基酸,分子式為C2753H4405N801O811S20,分子質(zhì)量單位為62.34ku,理論等電點(diǎn)為9.34;在TgROP18蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)中,α-螺旋、β-折、β-轉(zhuǎn)角、無(wú)規(guī)則卷曲所占比例分別為41.52%、19.13%、7.76%和31.59%;TgROP18蛋白含有10個(gè)親水性較高的區(qū)域(臨界值為2.0),28個(gè)表面可及性較高的區(qū)域(臨界值為1.9),10個(gè)保守結(jié)構(gòu)區(qū)域,7個(gè)翻譯后修飾位點(diǎn),21個(gè)B細(xì)胞抗原表位,21個(gè)CTL抗原表位及26個(gè)Th抗原表位有。結(jié)論生物信息學(xué)分析表明,TgROP18蛋白具有良好的免疫原性,這將為弓形蟲(chóng)疫苗的研究提供基礎(chǔ)資料。
【作者單位】： 河北北方學(xué)院病原生物與免疫學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 剛地弓形蟲(chóng) ROP 克隆 真核表達(dá)質(zhì)粒 生物信息學(xué)分析
【基金】：河北省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.H2013405091) 河北省高等學(xué)�？茖W(xué)技術(shù)研究重點(diǎn)項(xiàng)目(No.ZH2012010) 河北北方學(xué)院校級(jí)重大課題(No.ZD201312)
【分類號(hào)】：R382.5
【正文快照】： *?**?剛地弓形蟲(chóng)(Toxoplasma gondii)是一種專性細(xì)胞內(nèi)寄生原蟲(chóng),且宿主群廣泛,能感染包括人類在內(nèi)的200多種動(dòng)物[1]。弓形蟲(chóng)感染一般為隱性感染,一旦機(jī)體免疫功能受到抑制或損害時(shí),如艾滋病患者、使用免疫抑制劑患者、接受器官移植患者等,則可出現(xiàn)急性感染,嚴(yán)重者可導(dǎo)致死亡。

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9 來(lái)松濤;非洲爪蟾76#新基因完整ORF克隆，，生物信息學(xué)分析及其在胚胎發(fā)育中表達(dá)情況的實(shí)驗(yàn)研究[D];四川大學(xué);2006年

10 晏瑾;超級(jí)雜交稻兩優(yōu)培九EREBP cDNA的生物信息學(xué)分析與克隆[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

本文編號(hào)：1002493