珠海市2013年手足口病患兒柯薩奇病毒A2型分離株基因特征分析
發(fā)布時(shí)間:2017-10-05 14:30
本文關(guān)鍵詞:珠海市2013年手足口病患兒柯薩奇病毒A2型分離株基因特征分析
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【摘要】:目的分析2013年珠海市手足口病患兒柯薩奇病毒A2(CV-A2)5′UTR-VP4-VP2區(qū)基因特征,探討其與國(guó)內(nèi)外其他地區(qū)CV-A2分離株的關(guān)系。方法采集2013年珠海市手足口病患兒糞便標(biāo)本,提取病毒RNA,用半巢式RT-PCR方法擴(kuò)增5′UTR-VP4-VP2區(qū),通過測(cè)序和Blast比對(duì)確定病毒型別,并利用DNAStar軟件和MEGA4.1軟件分別對(duì)珠海市CV-A2分離株進(jìn)行核苷酸序列分析和遺傳進(jìn)化樹分析。結(jié)果共鑒定出4株CV-A2,核苷酸序列分析表明CV-A2珠海株與2012年中國(guó)香港株在5′UTR-VP4-VP2區(qū)有最高的同源性,達(dá)97.4%~98.2%;進(jìn)化樹分析顯示4株CV-A2珠海株與2012年中國(guó)香港株共同構(gòu)成A進(jìn)化樹分支,Bootstrap值為99%。結(jié)論珠海市4株CV-A2與2012年中國(guó)香港株在5′UTR-VP4-VP2區(qū)具有較高的同源性,且進(jìn)化關(guān)系密切。
【作者單位】: 珠海市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 手足口病 柯薩奇病毒A 進(jìn)化分析
【基金】:珠海市衛(wèi)生局醫(yī)學(xué)科技項(xiàng)目(2014064)
【分類號(hào)】:R373.23
【正文快照】: 手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)是世界范圍流行的兒童常見傳染病,是我國(guó)法定報(bào)告管理的丙類傳染病。臨床上以發(fā)熱和手、足、口腔等部位的皮疹或皰疹為主要特征。引起HFMD的病原體屬于小RNA病毒科腸道病毒屬,包括柯薩奇病毒A組2、4、5、7、9、10、16型等,B組1、2、3、
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
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3 柯昌文;王s閼,
本文編號(hào):977335
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