人細(xì)小病毒B19非結(jié)構(gòu)蛋白NS1核輸出機(jī)制研究
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更多相關(guān)文章: 細(xì)小病毒B19 NS1 NES CRM1
【摘要】:人細(xì)小病毒B19(B19)在1974年首次被發(fā)現(xiàn),是細(xì)小病毒科(Parvoviridae)中已知的兩種感染人的病毒之一。B19病毒在人群中分布廣泛,感染后的臨床癥狀隨宿主的免疫系統(tǒng)和血液狀況的不同而不同,它主要引起兒童的傳染性紅斑和成年人的急性對(duì)稱關(guān)節(jié)炎,也能引發(fā)胎兒死亡、胎兒水腫、胎兒先天性貧血。目前主要的檢測(cè)手段是特異性抗體及病毒DNA檢測(cè),免疫球蛋白能有效緩解病情。 B19病毒是無(wú)囊膜的單鏈DNA病毒,基因組全長(zhǎng)5.4kb,兩端有發(fā)卡結(jié)構(gòu)。非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的編碼序列全長(zhǎng)2013bp(nt435-2448),共編碼671個(gè)氨基酸,分子量為74kDa。研究報(bào)道,NS1能直接與病毒p6啟動(dòng)子結(jié)合并反式激活p6啟動(dòng)子調(diào)控病毒DNA的復(fù)制,NS1也能反式激活一些細(xì)胞啟動(dòng)子從而調(diào)控腫瘤壞死因子(TNF)-a和白介素(IL)-6的表達(dá)。與此同時(shí),NS1能引起細(xì)胞周期阻滯,讓細(xì)胞停留在G1期和S期,還能引起紅血細(xì)胞的凋亡。種種跡象均表明,NSl既能進(jìn)入細(xì)胞核與DNA結(jié)合并調(diào)控其啟動(dòng)子的活性,也能在細(xì)胞質(zhì)中與相關(guān)的蛋白結(jié)合從而調(diào)控細(xì)胞因子和凋亡相關(guān)蛋白的表達(dá)。前期有研究表明,NS1在敏感細(xì)胞系主要定位在細(xì)胞核,少量分布在細(xì)胞質(zhì);另有研究稱,NS1在非敏感細(xì)胞系中全部定位在細(xì)胞質(zhì);而相關(guān)文獻(xiàn)也證實(shí)NS1是一種核質(zhì)穿梭蛋白。但關(guān)于NS1的核質(zhì)穿梭機(jī)制研究甚少,因此本文將從以下幾個(gè)方面對(duì)NS1的這種核質(zhì)穿梭機(jī)制進(jìn)行初步研究: (1)確定NS1的核質(zhì)穿梭現(xiàn)象。用B19的感染性克隆pB19-4244轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞,24小時(shí)后用LMB處理轉(zhuǎn)染后細(xì)胞,觀察NS1定位是否發(fā)生改變。隨后用NS1-pEFGP-N1的重組載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞并進(jìn)行相似處理及結(jié)果分析。 (2)利用相關(guān)軟件對(duì)NS1蛋白序列進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)可能存在的核輸出信號(hào)(Nuclear Export Signal, NES)序列。根據(jù)軟件預(yù)測(cè)結(jié)果設(shè)計(jì)系列截短方案,構(gòu)建野生型NS1及系列截短突變的NS1與pEGFP-N1的重組載體。將重組克隆轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞,熒光顯微鏡下觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果,分析數(shù)據(jù),初步確定NES在NS1上的分布情況。 (3)將初步確定的NES信號(hào)序列單獨(dú)與EGFP融合,轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,熒光顯微鏡下觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果,分析數(shù)據(jù),進(jìn)一步確定NES是否都有活性。對(duì)有活性的NES進(jìn)行關(guān)鍵位點(diǎn)的點(diǎn)突變,并同時(shí)在NS1全長(zhǎng)上將對(duì)應(yīng)氨基酸位點(diǎn)進(jìn)行突變,觀察突變是否改變蛋白定位。 (4)用LMB處理轉(zhuǎn)染后細(xì)胞,確定NES序列是CRM1依賴型還是CRM1非依賴型,然后用哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)檢測(cè)NS1與CRM1的相互作用。 通過(guò)對(duì)pB19-4244轉(zhuǎn)染293T后的細(xì)胞進(jìn)行LMB處理,觀察到NS1從細(xì)胞質(zhì)中轉(zhuǎn)移到了細(xì)胞核中,NS1-pEGFP-N1轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行相同處理得到類似結(jié)果,從而確定NS1是可以進(jìn)行核質(zhì)穿梭并且NS1的出核是依賴于CRM1的。其后,通過(guò)系列截短突變及關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的點(diǎn)突變,確定兩個(gè)新的有生物活性的NES信號(hào),即NES1與NES2,并且LMB處理實(shí)驗(yàn)初步證明NES2為CRM1依賴型而NES1為CRM1非依賴型,同時(shí)NS1上還存在其他的NES信號(hào)序列。最后,通過(guò)哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng),我們檢測(cè)到NS1與CRM1的直接相互作用,進(jìn)一步說(shuō)明NS1的這種出核轉(zhuǎn)運(yùn)是依賴于CRM1的。本研究初步闡明了NS1的核質(zhì)穿梭機(jī)制,為NS1的功能研究提供一定的理論基礎(chǔ)及依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:細(xì)小病毒B19 NS1 NES CRM1
【學(xué)位授予單位】:華中師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R373
【目錄】:
- 摘要6-8
- Abstract8-12
- 第一章 前言12-26
- 1.1 人細(xì)小病毒B1912-16
- 1.1.1 人細(xì)小病毒B19的發(fā)現(xiàn)及歷史12
- 1.1.2 人細(xì)小病毒B19的分類學(xué)、形態(tài)學(xué)及基因組學(xué)研究12-14
- 1.1.3 人細(xì)小病毒B19的病原學(xué)及病理學(xué)研究14-15
- 1.1.4 人細(xì)小病毒B19的臨床表征15-16
- 1.1.5 人細(xì)小病毒B19的診斷及治療16
- 1.2 細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的核質(zhì)穿梭機(jī)制研究16-20
- 1.2.1 蛋白質(zhì)的入核轉(zhuǎn)運(yùn)18-19
- 1.2.2 蛋白質(zhì)的出核轉(zhuǎn)運(yùn)19-20
- 1.3 人細(xì)小病毒B19非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的核質(zhì)穿梭機(jī)制研究20-22
- 1.3.1 人細(xì)小病毒B19非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的結(jié)構(gòu)及基本性質(zhì)20-21
- 1.3.2 細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白的核質(zhì)穿梭機(jī)制研究21
- 1.3.3 人細(xì)小病毒B19 NS1的核質(zhì)穿梭機(jī)制研究21-22
- 1.4 哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)22-24
- 1.4.1 哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)簡(jiǎn)介22-24
- 1.4.2 哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)在本實(shí)驗(yàn)中的具體應(yīng)用24
- 1.5 本研究目的和意義24-26
- 第二章 實(shí)驗(yàn)材料及方法26-35
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料26-27
- 2.1.1 菌株及其培養(yǎng)基26
- 2.1.2 質(zhì)粒及其提取試劑26-27
- 2.1.3 細(xì)胞系及其培養(yǎng)基27
- 2.1.4 其他27
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法27-35
- 2.2.1 引物設(shè)計(jì)29-30
- 2.2.2 重組載體的構(gòu)建30-32
- 2.2.3 高純質(zhì)粒的提取32-33
- 2.2.4 細(xì)胞培養(yǎng)及質(zhì)粒轉(zhuǎn)染33
- 2.2.5 LMB處理33-34
- 2.2.6 制片及共聚焦顯微鏡觀察34
- 2.2.7 哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)的具體實(shí)驗(yàn)方案34-35
- 第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析35-49
- 3.1 NS1的亞細(xì)胞定位35-37
- 3.1.1 免疫熒光檢測(cè)NS1的細(xì)胞內(nèi)定位35
- 3.1.2 NS1-EGFP融合蛋白的細(xì)胞內(nèi)定位35-36
- 3.1.3 NS1與其他細(xì)胞器的共定位研究36-37
- 3.2 NS1的核輸出過(guò)程依賴于CRM137-39
- 3.2.1 免疫熒光檢測(cè)NS1的定位改變37-38
- 3.2.2 NS1-EGFP融合蛋白的定位改變38-39
- 3.3 NS1核輸出信號(hào)(NES)的初步確定39-43
- 3.3.1 不含NLS/NES的NS1截短突變蛋白的定位39-40
- 3.3.2 含三個(gè)NES的NS1截短突變蛋白的定位40
- 3.3.3 含兩個(gè)NES的NS1截短突變蛋白的定位40-41
- 3.3.4 含一個(gè)NES的NS1截短突變蛋白的定位41-42
- 3.3.5 NES介導(dǎo)EGFP的出核轉(zhuǎn)運(yùn)42-43
- 3.4 依賴于CRM1的核輸出信號(hào)(NES)的確定43-44
- 3.4.1 NS1截短突變蛋白的定位改變43-44
- 3.4.2 NS1-NES-EGFP融合蛋白的定位改變44
- 3.5 NES關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的確定44-47
- 3.5.1 NS1-NES關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的突變44-46
- 3.5.2 NS1全長(zhǎng)上NES關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的突變46-47
- 3.6 哺乳動(dòng)物雙雜交系統(tǒng)檢測(cè)NS1與CRM1的直接相互作用47-49
- 第四章 討論及展望49-52
- 4.1 討論49-50
- 4.2 展望50-52
- 參考文獻(xiàn)52-57
- 附錄57-58
- 致謝58
【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):961908
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