本文關(guān)鍵詞：霍亂弧菌中VSP-Ⅰ島的分布和變異特征研究

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【摘要】：目的探討霍亂第7次大流行基因島1(VSP-Ⅰ)在霍亂弧菌中的分布和變異特征。方法從美國國立生物技術(shù)信息中心的Gen Bank數(shù)據(jù)庫中下載所有霍亂弧菌基因組數(shù)據(jù),以霍亂第7次大流行代表菌株N16961的VSP-Ⅰ作為參考序列,篩查所下載霍亂弧菌基因組中的VSP-Ⅰ。使用MUMmer軟件進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析,Orth MCL軟件進(jìn)行同源基因分析,BLAST軟件進(jìn)行序列結(jié)構(gòu)變異分析和功能注釋。結(jié)果 VSP-Ⅰ廣泛存在于霍亂弧菌中,其中霍亂第7次大流行的105株菌株中均攜帶VSP-Ⅰ,且其序列高度保守;其中94株菌的VSP-Ⅰ完全一致,僅在11株菌中分別存在1~14個(gè)SNP位點(diǎn)。而2株非O1非O139群菌株攜帶VSP-Ⅰ,但和大流行菌株相比,存在插入缺失等序列變異。同時(shí),VSP-Ⅰ有9個(gè)共有保守基因,VC0183雖在所有菌株中均存在,但在2株非O1非O139菌株中長度發(fā)生改變。此外,VSP-Ⅰ攜帶5個(gè)與該島的轉(zhuǎn)移和整合相關(guān)的基因(VC0181~VC0185),VC0178編碼馬鈴薯糖蛋白類似物,VC0180編碼蛋白水解酶,二者可能與毒力相關(guān)。結(jié)論作為霍亂第7次大流行菌株中的特異性基因簇,VSP-Ⅰ已轉(zhuǎn)移至非O1非O139群菌株中,并發(fā)生序列的變異。
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】： 霍亂弧菌 VSP-Ⅰ島 分布 變異
【基金】：國家傳染病重大專項(xiàng)(No.2012ZX10004215)~~
【分類號(hào)】：R378.3
【正文快照】： 霍亂是一種烈性腸道傳染病,在我國作為法定甲類傳染病進(jìn)行管理。其病原體為霍亂弧菌(Vibriocholerae)。目前已發(fā)現(xiàn)霍亂弧菌有超過200個(gè)血清群,其中只有O1和O139血清群能引起霍亂暴發(fā)[1]。歷史上已有7次世界性霍亂大流行,其中前6次由O1血清群古典生物型引起,目前所處的第7次大

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本文編號(hào)：954103