本文關鍵詞：霍亂弧菌中VSP-Ⅰ島的分布和變異特征研究

  更多相關文章： 霍亂弧菌 VSP-Ⅰ島 分布 變異

【摘要】：目的探討霍亂第7次大流行基因島1(VSP-Ⅰ)在霍亂弧菌中的分布和變異特征。方法從美國國立生物技術信息中心的Gen Bank數(shù)據(jù)庫中下載所有霍亂弧菌基因組數(shù)據(jù),以霍亂第7次大流行代表菌株N16961的VSP-Ⅰ作為參考序列,篩查所下載霍亂弧菌基因組中的VSP-Ⅰ。使用MUMmer軟件進行單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析,Orth MCL軟件進行同源基因分析,BLAST軟件進行序列結(jié)構(gòu)變異分析和功能注釋。結(jié)果 VSP-Ⅰ廣泛存在于霍亂弧菌中,其中霍亂第7次大流行的105株菌株中均攜帶VSP-Ⅰ,且其序列高度保守;其中94株菌的VSP-Ⅰ完全一致,僅在11株菌中分別存在1~14個SNP位點。而2株非O1非O139群菌株攜帶VSP-Ⅰ,但和大流行菌株相比,存在插入缺失等序列變異。同時,VSP-Ⅰ有9個共有保守基因,VC0183雖在所有菌株中均存在,但在2株非O1非O139菌株中長度發(fā)生改變。此外,VSP-Ⅰ攜帶5個與該島的轉(zhuǎn)移和整合相關的基因(VC0181~VC0185),VC0178編碼馬鈴薯糖蛋白類似物,VC0180編碼蛋白水解酶,二者可能與毒力相關。結(jié)論作為霍亂第7次大流行菌株中的特異性基因簇,VSP-Ⅰ已轉(zhuǎn)移至非O1非O139群菌株中,并發(fā)生序列的變異。
【作者單位】： 中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所;
【關鍵詞】： 霍亂弧菌 VSP-Ⅰ島 分布 變異
【基金】：國家傳染病重大專項(No.2012ZX10004215)~~
【分類號】：R378.3
【正文快照】： 霍亂是一種烈性腸道傳染病,在我國作為法定甲類傳染病進行管理。其病原體為霍亂弧菌(Vibriocholerae)。目前已發(fā)現(xiàn)霍亂弧菌有超過200個血清群,其中只有O1和O139血清群能引起霍亂暴發(fā)[1]。歷史上已有7次世界性霍亂大流行,其中前6次由O1血清群古典生物型引起,目前所處的第7次大

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 范剛,王忠,孫暉;6株O139霍亂弧菌的實驗研究[J];江蘇預防醫(yī)學;2000年04期

2 穆艷良,李旭光,唐雅清,康健生;城市污水排放口檢出O_(139)霍亂弧菌的報告[J];實用預防醫(yī)學;2000年04期

3 李偉賢,李成歡,羅君;介紹一種霍亂弧菌檢測的快速方法[J];實用預防醫(yī)學;2000年06期

4 陳昭斌;O139霍亂弧菌的毒素和耐藥性[J];現(xiàn)代預防醫(yī)學;2000年01期

5 王愛芳,趙敬友;安慶市食品中非01群霍亂弧菌檢驗報告[J];安徽預防醫(yī)學雜志;2001年01期

6 李翠云,權怡,王鳴柳,譚冬梅,佘尚楊,雷時美;廣西首次分離O139群霍亂弧菌的病原學特征[J];廣西預防醫(yī)學;2001年04期

7 張玉瓊,呂太富,潘忠倫,姚光海,田克誠,王昭孝,穆世惠;貴州省環(huán)境因素與霍亂弧菌生存關系的研究[J];貴州醫(yī)藥;2001年09期

8 林業(yè)杰,歐劍鳴,王曉萍;O139群霍亂弧菌L型誘導實驗觀察[J];海峽預防醫(yī)學雜志;2001年03期

9 龔華治,周正亮,易艷軍,陳子君,肖學成;一株O_(139)群霍亂弧菌的檢出報告[J];實用預防醫(yī)學;2001年01期

10 郭浠敏,王靜,曾詠梅;1例O_(139)型霍亂弧菌的分離報告[J];實用預防醫(yī)學;2001年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 陳守義;胡玉山;李孝權;鄧志愛;龐杏林;;非可培養(yǎng)狀態(tài)下霍亂弧菌01群稻葉型的蛋白質(zhì)譜特征分析[A];2008年中國微生物學會學術年會論文摘要集[C];2008年

2 李孝權;鄧小玲;鄧志愛;張欣強;吳新偉;陳守義;王鳴;;廣州地區(qū)小川型霍亂弧菌的脈沖場凝膠電泳分析[A];2010廣東省預防醫(yī)學會學術年會資料匯編[C];2010年

3 劉彥晶;孟福強;吳大成;孫洋;馮書章;;霍亂弧菌及腸出血性大腸桿菌多重PCR檢測方法的建立[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學分會第三次學術研討會論文集[C];2012年

4 潘勁草;葉榕;汪皓秋;張蔚;于新芬;孟冬梅;何浙生;;IncA/C質(zhì)粒在多重耐藥O139群霍亂弧菌菌株中的發(fā)現(xiàn)[A];浙江省醫(yī)學會醫(yī)學微生物與免疫學及醫(yī)學病毒學學術年會論文匯編[C];2009年

5 張培培;李俊;俞盈;胡偉昭;陳健舜;吳蓓蓓;;浙江省舟山地區(qū)水產(chǎn)品及其養(yǎng)殖環(huán)境中霍亂弧菌污染狀況調(diào)查[A];中國畜牧獸醫(yī)學會食品衛(wèi)生學分會第十一次學術研討會論文集[C];2010年

6 李毅;李小春;章樂怡;洪程基;;近六年溫州市霍亂弧菌流行特征及毒力基因檢測的分析研究[A];2012年浙江省醫(yī)學微生物與免疫學及醫(yī)學病毒學學術年會暨革蘭陰性菌感染論壇論文集[C];2012年

7 李柏生;譚海玲;王多春;鄧小玲;陳經(jīng)雕;王曉梅;鐘豪杰;柯碧霞;;霍亂病例與環(huán)境來源霍亂弧菌的耐藥和分子分型研究[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點研討會論文集[C];2010年

8 楊彬;王國永;王梅;孫林;段玉芹;;山東省霍亂弧菌毒力基因分布初步檢測[A];新世紀預防醫(yī)學面臨的挑戰(zhàn)——中華預防醫(yī)學會首屆學術年會論文摘要集[C];2002年

9 郎中凱;郭敏;;O139群霍亂弧菌對13種抗菌藥物的耐藥性分析[A];重慶市預防醫(yī)學會2005年學術交流會論文集[C];2005年

10 黃海;徐海英;周登仁;王瓊妹;葉樺;;霍亂弧菌快速檢測試劑對不同類型樣本的檢測效果分析[A];2009年海南省微生物學檢測及質(zhì)量保證研討會論文集[C];2009年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 韋辰;小心霍亂弧菌趁熱作“亂”[N];科技日報;2006年

2 記者 陳靜瑩;汕頭附近海域未被霍亂弧菌污染[N];汕頭日報;2008年

3 記者 王艷紅;霍亂弧菌基因組測序完成[N];人民日報;2000年

4 記者 葉明e，

本文編號：954103