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用于單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)聚類分析的方法比較

發(fā)布時間:2017-09-23 08:15

  本文關鍵詞:用于單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)聚類分析的方法比較


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【摘要】:對于目前用于單核苷酸多態(tài)性(SNPs)數(shù)據(jù)進行聚類分析的統(tǒng)計方法進行了比較說明,并在其中遴選出了5種具有代表性的統(tǒng)計方法 ,分別對每種方法具體進行分析。在每種聚類方法的論述過程中,均分為該方法的原理、計算方法和公式、優(yōu)點與缺陷幾個部分。并且在討論部分對各種方法進行了總結歸納,提出了今后針對SNPs數(shù)據(jù)聚類計算方法的發(fā)展方向預測。
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院;北京市豐臺區(qū)南苑社區(qū)衛(wèi)生服務中心;
【關鍵詞】單核苷酸多態(tài)性 聚類分析 基因 數(shù)據(jù)挖掘
【分類號】:R394
【正文快照】: 在人類的基因組中存在各種形式的變異,其中,單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs),即單個的核苷酸變異所引發(fā)的DNA鏈序列的多態(tài)性,是這些變異中最普遍的形式。根據(jù)數(shù)據(jù)統(tǒng)計,在人類含有不低于30億個含氮堿基對數(shù)量的基因組中,SNP出現(xiàn)的概率在1/1000左右[1]。

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本文編號:904162

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