用于單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)聚類分析的方法比較
本文關(guān)鍵詞:用于單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)聚類分析的方法比較
更多相關(guān)文章: 單核苷酸多態(tài)性 聚類分析 基因 數(shù)據(jù)挖掘
【摘要】:對(duì)于目前用于單核苷酸多態(tài)性(SNPs)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析的統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行了比較說(shuō)明,并在其中遴選出了5種具有代表性的統(tǒng)計(jì)方法 ,分別對(duì)每種方法具體進(jìn)行分析。在每種聚類方法的論述過(guò)程中,均分為該方法的原理、計(jì)算方法和公式、優(yōu)點(diǎn)與缺陷幾個(gè)部分。并且在討論部分對(duì)各種方法進(jìn)行了總結(jié)歸納,提出了今后針對(duì)SNPs數(shù)據(jù)聚類計(jì)算方法的發(fā)展方向預(yù)測(cè)。
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;北京市豐臺(tái)區(qū)南苑社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心;
【關(guān)鍵詞】: 單核苷酸多態(tài)性 聚類分析 基因 數(shù)據(jù)挖掘
【分類號(hào)】:R394
【正文快照】: 在人類的基因組中存在各種形式的變異,其中,單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs),即單個(gè)的核苷酸變異所引發(fā)的DNA鏈序列的多態(tài)性,是這些變異中最普遍的形式。根據(jù)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),在人類含有不低于30億個(gè)含氮堿基對(duì)數(shù)量的基因組中,SNP出現(xiàn)的概率在1/1000左右[1]。
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 董國(guó)君;哈力木拉提·買買提;;基于隨機(jī)退火的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)算法及其應(yīng)用[J];計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用;2010年19期
2 符保龍;陳如云;;分類回歸樹(shù)在高校計(jì)算機(jī)聯(lián)考數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[J];計(jì)算機(jī)時(shí)代;2010年01期
3 張學(xué)工;關(guān)于統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)理論與支持向量機(jī)[J];自動(dòng)化學(xué)報(bào);2000年01期
4 劉崇林;;人口時(shí)間序列的支持向量機(jī)預(yù)測(cè)模型[J];寧夏大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2006年04期
5 袁芳;劉盼盼;徐進(jìn);費(fèi)麗娟;郝玲妹;邱旭君;張莉娜;;基因-基因(環(huán)境)交互作用分析方法的比較[J];寧波大學(xué)學(xué)報(bào)(理工版);2012年04期
6 徐學(xué)琴;孫寧;徐玉芳;;基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的河南省甲乙類法定報(bào)告?zhèn)魅静☆A(yù)測(cè)研究[J];中華疾病控制雜志;2014年06期
7 胡潔;曾祥金;;一種快速且全局收斂的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)算法[J];系統(tǒng)科學(xué)與數(shù)學(xué);2010年05期
8 王立柱,趙大宇;用分類與回歸樹(shù)算法進(jìn)行人才識(shí)別[J];沈陽(yáng)師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2005年01期
9 溫小霓;蔡汝駿;;分類與回歸樹(shù)及其應(yīng)用研究[J];統(tǒng)計(jì)與決策;2007年23期
10 張晶;;BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在圖書館信息處理中的應(yīng)用研究[J];蘭臺(tái)世界;2014年26期
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 干娟;;基于決策樹(shù)算法的學(xué)生綜合測(cè)評(píng)系統(tǒng)的設(shè)計(jì)[J];安徽電子信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào);2011年04期
2 李玲玲;辛浩;;FCM算法及其有效性度量方法[J];安徽電子信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào);2011年05期
3 王東霞;張楠;路曉麗;;基于育種算法的SVM參數(shù)優(yōu)化[J];安徽大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2009年04期
4 楊緒兵,韓自存;ε不敏感的核Adaline算法及其在圖像去噪中的應(yīng)用[J];安徽工程科技學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2003年04期
5 陶秀鳳,唐詩(shī)忠,周鳴爭(zhēng);基于支持向量機(jī)的軟測(cè)量模型及應(yīng)用[J];安徽工程科技學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年02期
6 許高程;張文君;王衛(wèi)紅;;支持向量機(jī)技術(shù)在遙感影像滑坡體提取中的應(yīng)用[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年06期
7 程偉;張燕平;趙姝;;支持向量機(jī)在糧食產(chǎn)量預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年08期
8 武素華;;基于最小二乘支持向量機(jī)的土壤含水量檢測(cè)的研究與分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年09期
9 陳念;沈佐民;;基于化學(xué)成分檢測(cè)和SVM分類的茶葉品質(zhì)鑒定[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年15期
10 郭立萍;唐家奎;米素娟;張成雯;趙理君;;基于支持向量機(jī)遙感圖像融合分類方法研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年17期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 ;An effective procedure exploiting unlabeled data to build monitoring system[A];中國(guó)科學(xué)院地質(zhì)與地球物理研究所第11屆(2011年度)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集(下)[C];2012年
2 宋海鷹;桂衛(wèi)華;陽(yáng)春華;;基于核偏最小二乘的簡(jiǎn)約最小二乘支持向量機(jī)及其應(yīng)用研究[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
3 ;A Novel Kernel PCA Support Vector Machine Algorithm with Feature Transition Function[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
4 ;A Novel Proximal Support Vector Machine and Its Application in Radar Target Recognition[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
5 周炎濤;唐劍波;王家琴;;基于信息熵的改進(jìn)TFIDF特征選擇算法[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
6 顧小軍;楊世錫;錢蘇翔;;基于支持向量機(jī)的旋轉(zhuǎn)機(jī)械多類故障識(shí)別研究[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
7 呂蓬;柳亦兵;馬強(qiáng);魏于凡;;支持向量機(jī)在齒輪智能故障診斷中的應(yīng)用研究[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
8 姜明輝;袁緒川;;基于GA優(yōu)化的個(gè)人信用評(píng)估SVM模型[A];第二十六屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2007年
9 韓露;余正濤;鄧錦輝;章程;毛存禮;郭劍毅;;領(lǐng)域知識(shí)關(guān)系對(duì)領(lǐng)域文本分類的影響[A];第二十七屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2008年
10 ;Fault Pattern Recognition of Rolling Bearings Based on Wavelet Packet and Support Vector Machine[A];第二十七屆中國(guó)控制會(huì)議論文集[C];2008年
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 母麗華;煤礦安全預(yù)警系統(tǒng)的方法研究[D];哈爾濱工程大學(xué);2010年
2 殷志偉;基于統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)理論的分類方法研究[D];哈爾濱工程大學(xué);2009年
3 朱廣平;混響干擾中的信號(hào)檢測(cè)技術(shù)研究[D];哈爾濱工程大學(xué);2009年
4 孔凡芝;引線鍵合視覺(jué)檢測(cè)關(guān)鍵技術(shù)研究[D];哈爾濱工程大學(xué);2009年
5 鄭大騰;柔性坐標(biāo)測(cè)量機(jī)空間誤差模型及最佳測(cè)量區(qū)研究[D];合肥工業(yè)大學(xué);2010年
6 張昌明;新疆漢族、維吾爾族及哈薩克族食管癌血清蛋白質(zhì)指紋圖譜研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2010年
7 王曉明;基于統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)的模式識(shí)別幾個(gè)問(wèn)題及其應(yīng)用研究[D];江南大學(xué);2010年
8 李先鋒;基于特征優(yōu)化和多特征融合的雜草識(shí)別方法研究[D];江蘇大學(xué);2010年
9 劉衛(wèi)紅;垃圾郵件檢測(cè)與過(guò)濾關(guān)鍵技術(shù)研究[D];華南理工大學(xué);2010年
10 汪春梅;癲癇腦電信號(hào)特征提取與自動(dòng)檢測(cè)方法研究[D];華東理工大學(xué);2011年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 展慧;基于多源信息融合技術(shù)的板栗分級(jí)檢測(cè)方法研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年
2 杜二玲;擬概率空間上等均值噪聲下統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)理論的理論基礎(chǔ)[D];河北大學(xué);2007年
3 李金華;基于SVM的多類文本分類研究[D];山東科技大學(xué);2010年
4 朱耿峰;支持向量機(jī)在沖擊地壓預(yù)測(cè)模型中的應(yīng)用研究[D];山東科技大學(xué);2010年
5 安文娟;Fisher和支持向量綜合分類器[D];遼寧師范大學(xué);2010年
6 姜成玉;基于支持向量機(jī)的時(shí)間序列預(yù)測(cè)[D];遼寧師范大學(xué);2010年
7 蔡浩;基于Web使用挖掘的協(xié)同過(guò)濾推薦算法研究[D];浙江理工大學(xué);2010年
8 姜念;區(qū)間自適應(yīng)粒子群算法研究及其應(yīng)用[D];鄭州大學(xué);2010年
9 李翠;基于車輛自動(dòng)識(shí)別的智能計(jì)重監(jiān)控系統(tǒng)的研究與設(shè)計(jì)[D];鄭州大學(xué);2010年
10 李朋勇;基于全矢高階譜的故障診斷方法及其應(yīng)用研究[D];鄭州大學(xué);2010年
【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 陳華友;基于L_1范數(shù)的加權(quán)幾何平均組合預(yù)測(cè)方法[J];安徽大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年04期
2 張蓬濤;周雁;劉曉莊;秦嶺;;人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在農(nóng)業(yè)自然資源研究中的應(yīng)用[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年27期
3 張利;;高校圖書館員工離職傾向關(guān)系模型的建立[J];圖書與情報(bào);2009年03期
4 李雪燕;辛濤;;特質(zhì)焦慮的潛類別分析[J];北京師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2006年06期
5 周萬(wàn)隆;姚艷;;支持向量機(jī)在股票價(jià)格短期預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[J];商業(yè)研究;2006年06期
6 吳侃,靳建明,王卷樂(lè);開(kāi)采沉陷時(shí)序預(yù)測(cè)技術(shù)[J];測(cè)繪工程;2001年04期
7 賴靜;王清;孫東立;;人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在材料研究中的應(yīng)用[J];材料工程;2006年S1期
8 于寧鋒;楊化超;鄧喀中;張書畢;;基于PSO和SVM的礦區(qū)地表下沉系數(shù)預(yù)測(cè)[J];遼寧工程技術(shù)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2008年03期
9 袁仁茂;馬鳳山;鄧清海;徐錫偉;;基于Elman型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的金川二礦地表巖移時(shí)序預(yù)測(cè)模型[J];工程地質(zhì)學(xué)報(bào);2008年01期
10 聶永紅;判定樹(shù)歸納分類法在畢業(yè)生就業(yè)預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[J];廣西科學(xué)院學(xué)報(bào);2003年02期
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 趙玉;中國(guó)兒童在平衡秤任務(wù)上規(guī)則使用的潛類別分析[D];江西師范大學(xué);2008年
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 李進(jìn);高箬遠(yuǎn);陳俊羽;李天明;;單核苷酸多態(tài)性與肺癌關(guān)系的研究進(jìn)展[J];云南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2013年04期
2 趙春霞,石先哲,張巖,馬堅(jiān)妹,牟紅梅,呂申,許國(guó)旺;一種同時(shí)檢測(cè)多個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的新方法[J];分析化學(xué);2003年08期
3 何凱,張琴,趙勝;單核苷酸多態(tài)性研究進(jìn)展[J];西南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年05期
4 鄧艷,魏東霞,朱興全;單核苷酸多態(tài)性及其檢測(cè)方法[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2005年05期
5 張效萌,韓金祥;單核苷酸多態(tài)性的檢測(cè)及其在醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用[J];生命的化學(xué);2001年04期
6 蘇暢,劉敬忠;微測(cè)序技術(shù)分析人類單核苷酸多態(tài)性[J];生物技術(shù);2003年04期
7 李進(jìn);王兵;李勝男;;試述單核苷酸多態(tài)性的研究進(jìn)展[J];云南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2007年06期
8 羅懷容,施鵬,張亞平;單核苷酸多態(tài)性的研究技術(shù)[J];遺傳;2001年05期
9 蘇智廣,張思仲;變性高效液相色譜技術(shù)在單核苷酸多態(tài)性研究中的應(yīng)用[J];生命的化學(xué);2003年02期
10 李艷杰,龍火生,李影,楊公社;單核苷酸多態(tài)性(SNP)的研究進(jìn)展和應(yīng)用[J];畜牧獸醫(yī)雜志;2003年04期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 張細(xì)權(quán);聶慶華;楊關(guān)福;劉德武;雷明明;;動(dòng)物單核苷酸多態(tài)性研究[A];中國(guó)的遺傳學(xué)研究——中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)第七次代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要匯編[C];2003年
2 曾振武;梁大開(kāi);曾捷;杜艷;;單核苷酸多態(tài)性及一種新的檢測(cè)方法[A];江蘇省計(jì)量測(cè)試學(xué)會(huì)2005年論文集[C];2005年
3 周雪雪;卓陽(yáng);;人類單核苷酸多態(tài)性的研究進(jìn)展及應(yīng)用[A];2011年浙江省整形美容學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2011年
4 孫雪皎;鐘小寧;;慢性阻塞性肺疾病單核苷酸多態(tài)性改變研究的意義[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)年會(huì)——2013第十四次全國(guó)呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年
5 梁艷;張進(jìn)安;;維生素D受體基因單核苷酸多態(tài)性與自身免疫性甲狀腺病的相關(guān)性[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十二次全國(guó)內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年
6 王紅娜;張英杰;劉月琴;任立坤;楊少華;;單核苷酸多態(tài)性及其在羊育種中的應(yīng)用[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)羊?qū)W分會(huì)2012年全國(guó)養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會(huì)議論文集[C];2012年
7 陳麗君;許旺;黃曉波;陳曉莉;;環(huán)氧化酶-2-765位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與寧夏人群慢性阻塞性肺疾病的相關(guān)性研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)年會(huì)——2013第十四次全國(guó)呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年
8 鄭涓;;SIRT1單核苷酸多態(tài)性與中國(guó)武漢地區(qū)漢族人群超重的相關(guān)性研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十次全國(guó)內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2011年
9 陳臨琪;李世芹;王瑩;謝蓉蓉;吳海英;張學(xué)蘭;王鳳云;;ISS患兒GHR基因外顯子4、610單核苷酸多態(tài)性的研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十五次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編(上冊(cè))[C];2010年
10 宋榮華;張進(jìn)安;;TNFAIP3基因的單核苷酸多態(tài)性與Graves'病的相關(guān)性[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十二次全國(guó)內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年
中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條
1 記者 白毅;單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)生物傳感器開(kāi)發(fā)成功[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2012年
2 李山;三個(gè)與冠心病有關(guān)的基因得到確認(rèn)[N];科技日?qǐng)?bào);2009年
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 張莉;單核苷酸多態(tài)性與肺癌放射治療后損傷及生存的相關(guān)因素研究[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年
2 袁錕;GDF5單核苷酸多態(tài)性與退變性腰椎間盤疾病的相關(guān)研究[D];蘇州大學(xué);2014年
3 龔虹云;GNAS1 T393C單核苷酸多態(tài)性與肺癌生存及放化療副反應(yīng)相關(guān)性研究[D];武漢大學(xué);2012年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條
1 張倩怡;CTLA4基因CT60 A/G單核苷酸多態(tài)性與Graves病的相關(guān)性研究[D];吉林大學(xué);2013年
2 方慧;ACTA2啟動(dòng)子區(qū)的單核苷酸多態(tài)性與2型糖尿病患者冠狀動(dòng)脈狹窄程度的關(guān)聯(lián)性研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2014年
3 蔣華新;低密度脂蛋白受體3′非翻譯區(qū)單核苷酸多態(tài)性對(duì)黃連素調(diào)節(jié)低密度脂蛋白受體表達(dá)的影響[D];南京醫(yī)科大學(xué);2009年
4 孫玉亮;基于聚類的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)質(zhì)量控制方法研究[D];湖南大學(xué);2013年
5 陳俊宇;染色體9p21單核苷酸多態(tài)性與冠心病遺傳易感性研究[D];昆明醫(yī)科大學(xué);2014年
6 鄒景峰;喉癌易感基因PTEN單核苷酸多態(tài)性的研究[D];吉林大學(xué);2006年
7 左洪鵬;單核苷酸多態(tài)性與冠心病遺傳易感性的研究[D];同濟(jì)大學(xué);2006年
8 黃萍;IL-2基因啟動(dòng)子區(qū)單核苷酸多態(tài)性與特發(fā)性擴(kuò)張型心肌病的相關(guān)性研究[D];四川大學(xué);2007年
9 郭敏;東鄉(xiāng)族嬰幼兒維生素D受體基因單核苷酸多態(tài)性與維生素D缺乏性佝僂病的相關(guān)性研究[D];蘭州大學(xué);2012年
,本文編號(hào):904162
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/904162.html