發(fā)布時(shí)間：2017-09-22 17:14

  本文關(guān)鍵詞：沙眼衣原體多態(tài)膜蛋白PmpF基因克隆及生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 沙眼衣原體 PmpF基因 克隆 序列測(cè)定 生物信息學(xué)分析

【摘要】：目的克隆沙眼衣原體的多態(tài)膜蛋白PmpF基因,分析其生物學(xué)特征。方法以沙眼衣原體L2菌株DNA為模板,PCR擴(kuò)增PmpF基因,克隆后測(cè)序,采用生物信息軟件、數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)其進(jìn)行同源性比對(duì),并分析其編碼蛋白的主要化學(xué)特征、結(jié)構(gòu)功能以及B細(xì)胞抗原表位。結(jié)果 PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)株沙眼衣原體PmpF基因核苷酸序列長(zhǎng)度為3 099bp,該菌株與同一生物型同源性≥99.97%,與不同生物型同源性89.32%;與同一生物型氨基酸序列同源性≥99.90%,與不同生物型同源性達(dá)89.25%。編碼蛋白的分子質(zhì)量單位為112.538 2ku,等電點(diǎn)為9.15,該蛋白具有信號(hào)肽和2個(gè)結(jié)構(gòu)域。對(duì)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)和柔性區(qū)、氨基酸的親水性、抗原指數(shù)及表面可及性預(yù)測(cè)結(jié)果分析,推測(cè)該蛋白含有14個(gè)優(yōu)勢(shì)B細(xì)胞抗原表位。結(jié)論本研究克隆了沙眼衣原體PmpF基因,推測(cè)其表達(dá)蛋白含B細(xì)胞抗原表位。為研究此基因的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 河北北方學(xué)院病原生物學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 沙眼衣原體 PmpF基因 克隆 序列測(cè)定 生物信息學(xué)分析
【基金】：河北北方學(xué)院創(chuàng)新人才項(xiàng)目(No.CXRC1317) 河北北方學(xué)院青年基金項(xiàng)目(No.Q2013030)
【分類號(hào)】：R374.1
【正文快照】： ***沙眼衣原體(Chlamydia trachomatis,Ct)引起性傳播疾病最常見(jiàn)的病原體之一,其中性病淋巴肉芽腫生物型(lymphogranuloma venereum,LGV)引起的性病淋巴肉芽腫與梅毒、淋病和軟下疳統(tǒng)稱為經(jīng)典性病。LGV包括L1、L2和L3三個(gè)血清型,其中血清型L2侵襲力最強(qiáng),感染者不僅治療療程長(zhǎng)

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：902054