本文關(guān)鍵詞：甘肅省228株臨床分離結(jié)核分枝桿菌DNA分型初步研究

  更多相關(guān)文章： 結(jié)核分枝桿菌 基因分型 多位點(diǎn)串聯(lián)重復(fù)序列分析 間隔區(qū)寡核苷酸分型

【摘要】：目的了解目前甘肅結(jié)核分枝桿菌流行株的基因型特征,并評(píng)價(jià)兩種基因分型方法的應(yīng)用價(jià)值。方法收集甘肅省結(jié)核分枝桿菌臨床分離菌株,分別采用多位點(diǎn)數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列分析(multiple-locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)和間隔區(qū)寡核苷酸分型(spacer oligonucleotide typing,Spoligotyping)技術(shù)進(jìn)行基因分型,用BioNumerics軟件進(jìn)行聚類(lèi)分析后,進(jìn)行結(jié)果綜合分析、比對(duì)。結(jié)果利用MLVA分型方法,228株結(jié)核分枝桿菌被分為4大基因群,7個(gè)主要基因型;Spoligotyping可將228株結(jié)核分枝桿菌分為4個(gè)基因群,8個(gè)主要基因型,其中最大的基因型為北京家族基因型。兩種方法在基因型分型方面經(jīng)卡方檢驗(yàn)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.06,P0.05)。結(jié)論兩種方法對(duì)結(jié)核分枝桿菌的分型效果良好,重復(fù)性高,操作簡(jiǎn)便,可試用于大規(guī)模分子流行病學(xué)調(diào)查。北京家族是甘肅最主要的流行基因群。
【作者單位】： 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;甘肅省蘭州市肺科醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 基因分型 多位點(diǎn)串聯(lián)重復(fù)序列分析 間隔區(qū)寡核苷酸分型
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30771853) 甘肅省蘭州市重點(diǎn)科研項(xiàng)目(07-1-94)
【分類(lèi)號(hào)】：R378.911
【正文快照】： 分子生物學(xué)方法廣泛應(yīng)用于各種傳染病的流行病學(xué)調(diào)查、診斷和鑒別診斷、發(fā)病機(jī)理以及耐藥性等多方面的研究[1]。近年來(lái),分子生物學(xué)方法也被大量應(yīng)用于結(jié)核病病原學(xué)研究,其中以PCR為基礎(chǔ)的分子生物學(xué)方法,以其操作簡(jiǎn)便、快速、成本低、敏感性高等優(yōu)點(diǎn),正逐步受到大家的青睞。ML

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 石荔;楊敏;Christine Pourcel;董海燕;尼瑪彭多;張嬡媛;朗珍;呂冰;蔣毅;魏淑貞;范昕建;萬(wàn)康林;;MLVA和Spoligotyping用于西藏地區(qū)216株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的基因分型研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2007年08期

2 劉飛鷹;劉志廣;王喜文;趙秀琴;董海燕;劉潔;呂冰;董柏青;萬(wàn)康林;;Spoligotyping對(duì)廣西地區(qū)208株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的基因分型[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2007年12期

3 曹曉慧;劉志廣;趙秀芹;呂冰;張媛媛;萬(wàn)康林;;220株結(jié)核分枝桿菌北京臨床分離株的基因分型研究[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2008年05期

4 劉志廣;張選民;張媛媛;曾令城;呂冰;王西臨;趙秀芹;杜新玲;韓躍玲;萬(wàn)康林;;結(jié)核分枝桿菌西安分離株北京家族基因型檢測(cè)及其耐藥相關(guān)性研究[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2008年05期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 王均;黃延風(fēng);張愛(ài)華;許紅梅;;兒童結(jié)核病101例臨床分離結(jié)核分枝桿菌多位點(diǎn)串聯(lián)重復(fù)序列分型[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2011年13期

2 王勐;劉志廣;趙秀琴;董海燕;劉潔;張媛媛;呂冰;萬(wàn)康林;;間隔區(qū)寡核苷酸分型法用于99株結(jié)核分枝桿菌杭州臨床分離株的基因分型研究[J];疾病監(jiān)測(cè);2008年05期

3 鄭曉靜;鄭素華;杜博平;賈紅彥;李衛(wèi)民;丁北川;王u&民;張宗德;;多位點(diǎn)可變數(shù)量串聯(lián)重復(fù)序列分析在北京家族結(jié)核分枝桿菌基因分型中的應(yīng)用及位點(diǎn)篩選[J];臨床肺科雜志;2010年07期

4 趙玉玲;趙東陽(yáng);李輝;楊洪毅;馬曉光;趙國(guó)強(qiáng);;河南省結(jié)核分枝桿菌基因分型與耐藥性分析[J];臨床檢驗(yàn)雜志;2011年03期

5 邢進(jìn);趙玉玲;;河南省結(jié)核分枝桿菌間隔區(qū)寡核苷酸分型技術(shù)的應(yīng)用研究[J];河南預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2014年05期

6 同重湘;劉志廣;馬建軍;趙秀琴;曹文靜;楊永紅;呂冰;姜元;萬(wàn)康林;;甘肅省228株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株Spoligotyping分型研究[J];實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué);2010年04期

7 劉潔;同重湘;李君蓮;姜元;綦迎成;趙秀芹;劉海燦;萬(wàn)康林;;中國(guó)西北部?jī)墒^(qū)結(jié)核分枝桿菌臨床分離株Spoligotyping分型初步分析[J];實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué);2014年05期

8 于梅;許國(guó)章;董紅軍;車(chē)洋;楊薇娜;余易;;寧波市90株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株MLVA基因分型研究[J];衛(wèi)生研究;2010年05期

9 趙玉玲;李輝;徐吉英;趙東陽(yáng);楊洪毅;馬曉光;;河南省結(jié)核分枝桿菌北京家族基因型及耐藥分析[J];中國(guó)公共衛(wèi)生;2011年07期

10 柳正衛(wèi);呂冰;王曉萌;董海燕;何海波;趙秀芹;萬(wàn)康林;;71株浙江省結(jié)核分枝桿菌臨床分離株MLVA基因分型研究[J];中國(guó)預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2008年12期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 姜曉穎;北京地區(qū)結(jié)核分枝桿菌基因分型及與耐藥性關(guān)系的研究[D];北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所;2012年

2 李桂蓮;天津市耐藥結(jié)核病危險(xiǎn)因素及結(jié)核分枝桿菌耐藥分子機(jī)制研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2010年

3 呂冰;中國(guó)結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)化MLVA分型技術(shù)及MLST分型的研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2010年

4 劉潔;中國(guó)西北兩省區(qū)結(jié)核分枝桿菌臨床分離株基因多態(tài)性研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2014年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條

1 李靜;上海地區(qū)一線抗結(jié)核藥物耐藥肺結(jié)核病患者二線藥物耐藥現(xiàn)況及細(xì)菌分子生物學(xué)特征的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2011年

2 吳長(zhǎng)東;結(jié)核分枝桿菌新疆臨床分離株“北京家族”的鑒定及與耐藥的相關(guān)性研究[D];石河子大學(xué);2010年

3 趙玉玲;河南省結(jié)核分枝桿菌基因分型與耐藥性和地區(qū)分布關(guān)系的研究[D];鄭州大學(xué);2011年

4 張思潮;湖州市結(jié)核分枝桿菌基因分型特征研究[D];浙江大學(xué);2009年

5 劉巧;江蘇省耐藥結(jié)核病影響因素及分子流行病學(xué)研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2012年

6 劉彬彬;北京地區(qū)結(jié)核分枝桿菌的基因分型及北京家族進(jìn)化的初步研究[D];中南大學(xué);2012年

7 黃根成;hsp65-、rpoB-PCR-RFLP用于非結(jié)核分枝桿菌菌種鑒定的研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2012年

8 李卓林;462例肺結(jié)核患者結(jié)核分枝桿菌MLVA基因分型的研究[D];吉林大學(xué);2013年

9 高詩(shī)會(huì);結(jié)核分枝桿菌新核酸標(biāo)識(shí)的ISSR分型篩選及在鑒別檢測(cè)中的初步應(yīng)用[D];蘇州大學(xué);2013年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

1 ;結(jié)核病診斷細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程[J];中國(guó)防癆雜志;1996年01期

2 全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組;2000年全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J];中國(guó)防癆雜志;2002年02期

3 劉敬華,Christine Pourcel,趙秀芹,萬(wàn)康林,劉志廣,張媛媛,王慶,譚云洪,許衛(wèi)國(guó);7個(gè)VNTRs用于65株中國(guó)分離的結(jié)核分枝桿菌基因多態(tài)性研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2004年09期

4 董海燕,王慶,劉志廣,趙秀芹,萬(wàn)康林;VNTR技術(shù)用于安徽省耐藥結(jié)核分支桿菌基因分型的初步研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2005年08期

5 石荔;楊敏;Christine Pourcel;董海燕;尼瑪彭多;張嬡媛;朗珍;呂冰;蔣毅;魏淑貞;范昕建;萬(wàn)康林;;MLVA和Spoligotyping用于西藏地區(qū)216株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的基因分型研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2007年08期

6 蔣毅;張麗水;趙秀芹;黃明翔;劉志廣;王琳;董海燕;萬(wàn)康林;;MLVA技術(shù)用于福建105株結(jié)核分枝桿菌基因分型的初步研究[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2007年01期

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 徐振波;徐小平;梁浩暉;嚴(yán)冰;江鵬飛;石磊;;分離自環(huán)境與臨床患者耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的基因分型[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2007年04期

2 蘇敏;張麗穎;王鳳云;李振華;李保雙;唐旭東;;幽門(mén)螺桿菌基因分型的研究進(jìn)展[J];遼寧中醫(yī)雜志;2014年02期

3 黃祖瑚，，周東輝，查文章，孫南雄，唐保元，賈輔忠;南京地區(qū)職業(yè)供血員、丙型肝炎及肝癌患者HCV基因分型初步研究[J];南京醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);1994年01期

4 杜紹財(cái),王宇,朱浚,陳紅松;HCV基因5′-末端非編碼區(qū)酶切分型與核心區(qū)基因分型初步比較[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;1995年02期

5 楊光;崔金環(huán);司建華;;乙肝病毒基因分型技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)情報(bào);2003年10期

6 張山鷹;肖方震;許龍善;黃江宏;;間日瘧原蟲(chóng)裂殖子表面蛋白3α基因分型及序列分析[J];海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2007年04期

7 白石山,李秀霞,夏桂枝,苑宏,鄭文艷,王紅;福氏2a志賀氏菌腸毒素基因分型[J];中華流行病學(xué)雜志;2000年04期

8 吳書(shū)一,譚春澤,趙曉武,趙興華,劉文剛,王志余,李哲先;SSOP基因分型對(duì)HLA-AB血清學(xué)純合型結(jié)果的校證[J];醫(yī)藥論壇雜志;2004年07期

9 區(qū)映研;楊海紅;曾文鋌;朱科倫;馬佩球;;乙肝病毒基因分型的臨床意義[J];廣州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2005年06期

10 諸欣平,周蕾,劉強(qiáng),高欣;云南省惡性瘧原蟲(chóng)裂殖子表面蛋白1基因分型及測(cè)序[J];中國(guó)寄生蟲(chóng)學(xué)與寄生蟲(chóng)病雜志;1999年03期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 荀鵬程;陳峰;董晨;錢(qián)國(guó)華;賴德建;孟繼宏;;HEV基因分型代表性片段篩選的記分法[A];中國(guó)現(xiàn)場(chǎng)統(tǒng)計(jì)研究會(huì)第十三屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2007年

2 李生斌;;我國(guó)漢回藏維吾爾人群STR基因分型與遺傳結(jié)構(gòu)[A];面向21世紀(jì)的科技進(jìn)步與社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展（下冊(cè)）[C];1999年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 衣曉峰;黑龍江域內(nèi)漢族人群HLA基因分型完成[N];健康報(bào);2007年

2 衣曉峰;黑龍江省漢族人群HLA基因分型明確[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2007年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 孫永濤;漢坦病毒的基因分型、變異及其檢測(cè)的分子生物學(xué)研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);1996年

2 吳慶剛;國(guó)內(nèi)分離的致腎盂腎炎大腸埃希菌papA和papG基因分型的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2003年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 翟理杰;戊型肝炎病毒基因分型的標(biāo)準(zhǔn)化[D];東南大學(xué);2004年

2 陳俊;鸚鵡熱嗜衣原體禽鳥(niǎo)株的分離、鑒定與基因分型[D];南華大學(xué);2012年

3 王曄;兒童耐萬(wàn)古霉素腸球菌的表型測(cè)定與基因分型[D];南昌大學(xué);2006年

4 鞠海英;血小板抗原基因分型的研究[D];吉林大學(xué);2006年

5 王彤;應(yīng)用寡核苷酸芯片進(jìn)行HLA-DQA1基因分型的初步研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2004年

6 莊燕;分子分型方法在結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群分離株中的研究和應(yīng)用[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2007年

7 田麗麗;結(jié)核分枝桿菌利福平依賴表型與基因型變異研究及甘肅省臨夏回族自治州結(jié)核分枝桿菌分子流行病學(xué)研究[D];蘭州大學(xué);2011年

8 李曉迎;北京譜系結(jié)核分枝桿菌分型和相關(guān)臨床研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年

本文編號(hào)：891220