本文關(guān)鍵詞：湖北2013年部分柯薩奇A16型腸道病毒VP1基因分子特征分析

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【摘要】：目的全面研究和了解2013年湖北省柯薩奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型別及分子進(jìn)化分析。方法對(duì)2013年湖北省21株CVA16病毒流行株進(jìn)行VP1區(qū)全長(zhǎng)基因序列測(cè)定,并對(duì)核苷酸及氨基酸序列進(jìn)行同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果2013年湖北省21株CVA16型病毒流行株的VP1區(qū)核苷酸序列全長(zhǎng)均為891bp,VP1區(qū)核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分別為90.0%~100.0%和96.3%~100.0%。VP1區(qū)基因系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,湖北CVA16流行株主要位于ligeage1和3分支上,分屬于B1a和B1b基因亞型。結(jié)論 2013年湖北省21株CVA16型流行株主要為B1b基因亞型,其次為B1a基因亞型,在同一地區(qū)有兩種基因亞型的CVA 16病毒同時(shí)存在,在不同的地區(qū)存在同一種亞型的CVA16病毒。
【作者單位】： 湖北省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 柯薩奇病毒CVA型 VP區(qū) 基因特征
【基金】：國(guó)家科技重大專項(xiàng)課題(No.2012ZX10004207)~~
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 國(guó)家科技重大專項(xiàng)課題(No.2012ZX10004207)手足口病(Hand-Foot-Mouth disease,HFMD)是由腸道病毒引起的傳染病,多發(fā)生于5歲以下兒童。引發(fā)手足口病的腸道病毒有20多種(型),以柯薩奇病毒A16型(CVA16)和腸道病毒71型(EV 71)最為常見(jiàn)[1]。雖然CVA16與EV71型病毒在遺傳上有一定的

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