本文關(guān)鍵詞：基于tdh1基因變異的大流行副溶血性弧菌鑒別方法的建立

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【摘要】：目的基于副溶血性弧菌tdh1 DNA序列中特異性變異位點,建立新的大流行株鑒別方法。方法通過對多種型別菌株的tdh序列進行比對,查找大流行株特異性變異位點,并基于該位點設(shè)計位點特異性PCR體系和檢測方法。以GS-PCR和tdh基因聯(lián)合檢測為參照方法,用已知大流行株、非大流行株和2014年收集的1 067株副溶血性弧菌對新方法進行驗證。結(jié)果 3株菌株的6條tdh全序列存在26個多態(tài)性位點,其中tdh1基因的第368位堿基的變異[G/A]能用于鑒別大流行株,本研究基于此位點建立了tdh1_368位點特異性PCR。該變異能將1996年后的大流行O3∶K6型菌株與1996前的進行區(qū)分,也能將大流行株其他血清型變種與非流行菌株進行區(qū)分。對2014年的1 067株菌株的檢測結(jié)果顯示,tdh1_368位點特異性PCR與參考方法檢測結(jié)果完全一致。結(jié)論本研究以副溶血性弧菌tdh基因的多態(tài)性位點建立檢測大流行菌型的試驗方法,從對1 067株菌株的實測結(jié)果來看,tdh1_368位點特異性PCR與既往報道的方法具有高度的一致性,且指標更為直接。
【作者單位】： 上海市疾病預防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 副溶血性弧菌 tdh PCR 食源性致病菌 鑒別方法
【基金】：國家“十二五”科技國家科技重大專項(2013ZX10004216-001-004)
【分類號】：R378
【正文快照】： 副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)最初發(fā)現(xiàn)于1950年的一起食物中毒事件,盡管多種血清型的VP能致人感染,但1996年之后出現(xiàn)的O3∶K6型及其血清型變種被認為是導致世界范圍內(nèi)VP腹瀉暴發(fā)和流行的主導菌型[1-3]。眾多研究者對大流行株的鑒別進行了大量的工作,Matsumoto等[

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