本文關(guān)鍵詞：云南新分離四株流行性乙型腦炎病毒全基因組序列特征研究

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【摘要】：目的對(duì)云南省2009年和2010年分離的4株流行性乙型腦炎(乙腦)病毒進(jìn)行全基因組序列測(cè)定和分析,闡明近期乙腦病毒流行株的分子生物學(xué)特征及基因型。方法通過反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)和核苷酸序列測(cè)定方法獲得病毒全基因組序列,采用Clustal X、DNAstar和Mega等生物學(xué)軟件進(jìn)行核苷酸和推導(dǎo)氨基酸序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果 2009年和2010年在云南省中部和西部地區(qū)三帶喙庫蚊(Culex tritaeriorhynchus)中分離到4株乙腦病毒,其中YN09M57株基因組全長(zhǎng)10 967 bp,DH10M865、DH10M978和DHL10M62株基因組全長(zhǎng)均為10 965 bp,均編碼3432個(gè)氨基酸。這4株病毒核苷酸和氨基酸同源性分別為98.3%~99.9%和99.5%~99.9%,與來自Gen Bank的7株基因Ⅰ型乙腦病毒核苷酸和氨基酸同源性分別為98.3%~99.9%和99.7%~99.9%;與基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ型參考株核苷酸和氨基酸同源性分別在78.7%~89.7%和91.4%~98.4%;與乙腦減毒活疫苗SA14-14-2株在E蛋白編碼區(qū)有15個(gè)氨基酸位點(diǎn)差異,均位于抗原關(guān)鍵位點(diǎn)之外�；贓基因、全基因組系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示云南4株乙腦病毒均為基因Ⅰ型,并形成2個(gè)進(jìn)化分支,分別與相鄰省份和東南亞流行株進(jìn)化關(guān)系較近。結(jié)論云南新分離4株乙腦病毒屬基因Ⅰ型,雖然它們之間及其與該型參考株核苷酸和氨基酸位點(diǎn)存在某些差異,但決定病毒毒力和抗原性的關(guān)鍵位點(diǎn)未見明顯變化。本研究提示這些乙腦病毒流行株具有穩(wěn)定的遺傳特性和地域特征。
【作者單位】： 云南省地方病防治所/云南省自然疫源性疾病防控技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;大理大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 流行性乙型腦炎病毒 全基因組 同源性分析 系統(tǒng)進(jìn)化分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.30560142)~~
【分類號(hào)】：R373.21
【正文快照】： 流行性乙型腦炎(Janpanese encephalitis,乙腦)是一種蚊媒傳播的急性中樞神經(jīng)系統(tǒng)傳染病,主要流行于亞洲及太平洋地區(qū)[1]。在我國,幾乎所有省(直轄市和自治區(qū))均有本病流行[2]。云南省地處我國西南邊境地區(qū),與東南亞諸國接壤,屬于熱帶、亞熱帶氣候,適宜蚊蟲和蚊媒病毒傳播,乙

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5 孫初陽;雞傳染性支氣管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因組序列分析及弱毒疫苗對(duì)其保護(hù)性的研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

6 于作;牛腺病毒3型中國分離株的鑒定及全基因組序列分析[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2011年

7 吳永平;中國株J亞群禽白血病病毒全基因組序列的測(cè)定與分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

8 朱紫祥;我國2008-2009年5株P(guān)RRSV的分離鑒定及全基因組序列測(cè)定分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年

9 宋翥遠(yuǎn);傳染性支氣管炎病毒變異株全基因組序列測(cè)定與分析[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

10 胡博;豬源乙腦病毒分離株的細(xì)胞傳代及其全基因組序列分析[D];吉林大學(xué);2014年

本文編號(hào)：747989