衣原體噬菌體衣殼蛋白3的結(jié)構(gòu)、免疫原性及臨床價(jià)值研究
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更多相關(guān)文章: 微病毒屬 衣原體科 蛋白質(zhì)類 生物信息學(xué) 結(jié)構(gòu) 免疫
【摘要】:分析衣原體微病毒Vp3蛋白在分子重組、分子進(jìn)化及病毒野生株篩查的作用并挖掘生物信息,揭示其臨床研究價(jià)值。以ProteinBlast的Multriple alignment程序比對各株衣原體微病毒衣殼蛋白Vp3序列;以Distance tree(ProteinBlast)程序完成種系發(fā)生樹。以比對獲得的高保守區(qū)的氨基酸序列為目標(biāo),應(yīng)用Karplus-schulz法進(jìn)行柔性區(qū)域分析;通過Gamier-robson法和Chou-fasman法分析該序列的二級結(jié)構(gòu);使用Emini法完成表位的表面可及性分析,并用Kyte-Doolittle法和Hopp-woods法完成蛋白親水性研究;應(yīng)用Jameson-Wolf法完成表位的抗原指數(shù)分析。6株衣原體微病毒Vp3蛋白序列高度保守,差異主要在Chp1與其他5株微病毒的Vp3蛋白之間。各株微病毒的Vp3蛋白均有以α螺旋為主的結(jié)構(gòu),蛋白序列高保守區(qū)存在多個(gè)細(xì)胞表位。Vp3蛋白結(jié)構(gòu)性質(zhì)保守,也是衣原體噬菌體衣殼的重要組分。其蛋白分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜,高保守區(qū)有較強(qiáng)的免疫原性,在分子重組、沙眼衣原體微病毒野生株篩查研究中有實(shí)際研究價(jià)值。
【作者單位】: 天津市中醫(yī)藥研究院附屬醫(yī)院;安徽醫(yī)科大學(xué);
【關(guān)鍵詞】: 微病毒屬 衣原體科 蛋白質(zhì)類 生物信息學(xué) 結(jié)構(gòu) 免疫
【基金】:天津市中醫(yī)藥管理局基礎(chǔ)研究資助項(xiàng)目(編號:13017)
【分類號】:R374
【正文快照】: 衣原體是一類細(xì)胞內(nèi)寄生菌,感染宿主細(xì)胞后難以清除[1],不但直接損傷宿主細(xì)胞誘發(fā)局部癥狀,還可引起免疫異常出現(xiàn)多系統(tǒng)損害,新的研究顯示衣原體感染增加了癌癥風(fēng)險(xiǎn)[2]。目前微病毒/噬菌體相關(guān)研究異軍突起[3-4],相應(yīng)地衣原體微病毒即衣原體噬菌體也成為研究熱點(diǎn)[5]。從20世紀(jì)
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