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以多肽組分特異性和GC含量分類細菌的有效性分析

發(fā)布時間:2017-08-20 03:21

  本文關(guān)鍵詞:以多肽組分特異性和GC含量分類細菌的有效性分析


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【摘要】:本文研究了細菌的蛋白質(zhì)多肽組分統(tǒng)計特征與基因組GC(Guanine+Cytosine)含量的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)當多肽長度較小時多肽組分特異性與GC含量存在著很強的關(guān)聯(lián);隨著多肽長度增加,上述關(guān)聯(lián)發(fā)生突變,關(guān)聯(lián)迅速喪失.這一結(jié)果表明,基于組分特異性確定細菌親緣關(guān)系的方法的確給出了不同于GC含量的信息,從而能實現(xiàn)有效分類.
【作者單位】: 陜西師范大學物理學與信息技術(shù)學院;廈門大學物理系;
【關(guān)鍵詞】種系基因組學 非序列比對 多肽組分矢量 GC含量
【基金】:國家自然科學基金(批準號:11147020) 中央高�;究蒲袠I(yè)務(wù)費專項資金(編號:GK201102028)資助項目
【分類號】:R394
【正文快照】: 引用格式:李靜珂,金濤,趙鴻.以多肽組分特異性和GC含量分類細菌的有效性分析.中國科學:物理學力學天文學,2015,45:050501Li J K,Jin T,Zhao H.Validity of peptide composition and GC-content for classifying bacteria(in Chinese).Sci Sin-Phys Mech Astron,2015,45:*聯(lián)系

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本文編號:704392


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