外周全血中與老化相關(guān)的DNA甲基化標(biāo)記的來源
發(fā)布時間:2017-08-15 19:06
本文關(guān)鍵詞:外周全血中與老化相關(guān)的DNA甲基化標(biāo)記的來源
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【摘要】:機(jī)體老化與癌癥、神經(jīng)退行性疾病等許多復(fù)雜疾病相關(guān)。目前,研究者已在外周全血中識別了大量的與老化相關(guān)的DNA甲基化標(biāo)記,這些標(biāo)記可能反映外周血白細(xì)胞在機(jī)體老化過程中發(fā)生的變化,也可能反映外周血中與年齡相關(guān)的細(xì)胞構(gòu)成比例的變化。文章利用3組正常個體外周全血DNA甲基化譜,采用Spearman秩相關(guān)分析識別了與老化相關(guān)的Cp G甲基化位點(diǎn)(age-related DNA methylation Cp G sites,ar Cp Gs)并評價了其可重復(fù)性;利用去卷積算法估計了各外周血樣本中髓性和淋巴性細(xì)胞的比例并分析了其與年齡的相關(guān)性;比較了在外周全血、CD4+T細(xì)胞和CD14+單核細(xì)胞中識別的ar Cp Gs的一致性。結(jié)果顯示,在獨(dú)立外周全血數(shù)據(jù)中識別的ar Cp Gs具有顯著的可重復(fù)性(超幾何檢驗(yàn),P=1.65×10-11)。外周血髓性和淋巴性細(xì)胞的比例分別與年齡顯著正、負(fù)相關(guān)(Spearman秩相關(guān)檢驗(yàn),P0.05,r≤0.22),它們間DNA甲基化水平差異較大的Cp G位點(diǎn)傾向于在外周全血中被識別為ar Cp Gs。在CD4+T細(xì)胞中識別的ar Cp Gs與在外周全血中識別的ar Cp Gs顯著交疊(超幾何檢驗(yàn),P=6.14×10-12),且99.1%的交疊位點(diǎn)在CD4+T細(xì)胞及外周全血中的DNA甲基化水平與年齡的正、負(fù)相關(guān)性一致。盡管在CD14+單核細(xì)胞中識別的ar Cp Gs與在外周全血中識別的ar Cp Gs并不顯著交疊,但是在交疊的51個ar Cp Gs中,有90.1%的位點(diǎn)在CD14+單核細(xì)胞、外周全血以及CD4+T細(xì)胞中的DNA甲基化水平與年齡的正、負(fù)相關(guān)性一致,提示它們可能主要反映細(xì)胞間共同的改變。在外周全血中識別的ar Cp Gs主要反映某些白細(xì)胞共同或特異的DNA甲基化改變,但是也有一部分反映外周血細(xì)胞比例構(gòu)成的變化。
【作者單位】: 電子科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;福建醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院 消化道惡性腫瘤教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 外周全血 老化 DNA甲基化 CD+T細(xì)胞 CD+單核細(xì)胞
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(編號:81372213,81201822)資助
【分類號】:R3416
【正文快照】: 2.福建醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,消化道惡性腫瘤教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福州350108制基體關(guān)高改平癌周化兒中與狀齡證標(biāo)相如細(xì)減甲變ofile of periphethylation Cp G=1.65×10?11).Uhile that of lymon test,P0.05mphoid cells,wcells significanthe overlappinonocytes did n51 overla,
本文編號:679793
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