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小鼠胚胎成纖維細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜及生物信息學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-08-15 08:11

  本文關(guān)鍵詞:小鼠胚胎成纖維細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜及生物信息學(xué)研究


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【摘要】:目的探究?jī)?nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)也稱為未折疊蛋白效應(yīng)(unfolded protein response,UPR)激活后小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(mouse embryonic fibroblasts,MEFs)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)表達(dá)譜。方法分離13天的小鼠胚胎獲得并培養(yǎng)MEFs,采用內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)誘導(dǎo)劑衣霉素(tunicamycin)處理細(xì)胞16h后發(fā)生UPR;以未處理的MEFs作為陰性對(duì)照,采用基因芯片技術(shù)檢測(cè)lncRNA表達(dá)譜,實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time PCR)驗(yàn)證lncRNA芯片結(jié)果并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果與未使用衣霉素處理的MEFs相比,衣霉素處理的MEFs有411個(gè)lncRNAs表達(dá)量出現(xiàn)顯著上調(diào),790個(gè)lncRNAs出現(xiàn)顯著下調(diào);實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證部分lncRNAs表達(dá)結(jié)果與芯片一致;高級(jí)生物信息學(xué)分析分析了顯著變化的lncRNAs并提示它們可能參與了細(xì)胞內(nèi)許多生物學(xué)過(guò)程的調(diào)控。結(jié)論 lncRNA表達(dá)譜及生物信息學(xué)分析提示lncRNA在UPR激活后的細(xì)胞功能中可能發(fā)揮重要作用。
【作者單位】: 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所生理學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】長(zhǎng)鏈非編碼RNA 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng) 基因芯片 生物信息學(xué)
【分類號(hào)】:R329.2
【正文快照】: 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)(endoplasmic reticulum stress re-sponse)也稱為未折疊蛋白效應(yīng)(unfolded protein re-sponse,UPR)。當(dāng)細(xì)胞遭受過(guò)酸、低氧、缺糖等刺激時(shí),會(huì)導(dǎo)致未折疊蛋白或者錯(cuò)誤折疊蛋白在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)積聚,引起UPR[1]。研究表明,哺乳動(dòng)物細(xì)胞中內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)激活后將通過(guò)I

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):677088

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