三省區(qū)蛞蝓感染廣州管圓線蟲調(diào)查及廣州管圓線蟲親緣性分析
本文關(guān)鍵詞:三省區(qū)蛞蝓感染廣州管圓線蟲調(diào)查及廣州管圓線蟲親緣性分析
更多相關(guān)文章: 廣州管圓線蟲 感染率 系統(tǒng)進(jìn)化樹 ITS2 CO Ⅰ
【摘要】:目的了解廣西、云南和海南3省9個(gè)縣市廣州管圓線蟲中間宿主蛞蝓的感染情況,探索廣州管圓線蟲不同分離株的基因類型。 方法采用區(qū)域抽樣法,在廣西抽取7個(gè)縣市,云南和海南分別抽取1個(gè)縣市對(duì)蛞蝓感染廣州管圓線蟲情況進(jìn)行調(diào)查。采用人工蛋白酶消化法處理蛞蝓,收集廣州管圓線蟲三期幼蟲。提取廣西南寧、廣西靖西、廣西玉林、云南普洱和海南瓊中5個(gè)縣市廣州管圓線蟲的基因組DNA:PCR擴(kuò)增5個(gè)縣市的核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列基因(ITS2)片段并進(jìn)行克隆測(cè)序;PCR擴(kuò)增廣西3個(gè)縣市的線粒體CO I基因片段并進(jìn)行克隆測(cè)序。計(jì)算遺傳距離,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,比較廣州管圓線蟲的親緣關(guān)系。 結(jié)果本次抽查廣西、云南和海南共9個(gè)縣市蛞蝓廣州管圓線蟲的感染情況,調(diào)查蛞蝓共2013條,總感染率為12.62%,平均感染度為70.83條。其中感染率最高的是廣西靖西為32.48%,其次為云南普洱和海南瓊中,感染率分別為20.82%和12.83%,感染率最低的是廣西玉林為1.13%;其中感染度最高的為廣西靖西,平均感染度為145.93條,其次為廣西南寧和海南瓊中,感染度分別為127.67條和99.21條;感染度最低的為廣西忻城,平均感染度為2條。廣西南寧、廣西靖西、廣西玉林、云南普洱和海南瓊中廣州管圓線蟲ITS2基因序列與南美標(biāo)準(zhǔn)株基因序列同源性分別為98.5%、98.6%、98.8%、98.8%和98.3%;廣西南寧、廣西靖西、廣西玉林和云南普洱廣州管圓線蟲ITS2基因序列與海南瓊中同源性分別為98.9%、99.1%、99.2%和99.2%;廣西南寧、廣西靖西和廣西玉林廣州管圓線蟲ITS2基因序列與云南普洱同源性分別為99.7%、99.8%和100.0%;廣西南寧和廣西靖西廣州管圓線蟲ITS2基因序列與廣西玉林同源性分別為99.7%和99.8%;廣西南寧廣州管圓線蟲ITS2基因序列和廣西靖西同源性為99.5%。廣西南寧、廣西靖西和廣西玉林廣州管圓線蟲CO I基因序列與福建標(biāo)準(zhǔn)株基因序列同源性分別為99.8%、98.2%和99.8%;廣西南寧和廣西靖西廣州管圓線蟲CO I基因序列與廣西玉林同源性分別為99.8%和98.2%;廣西南寧和廣西靖西廣州管圓線蟲CO I基因序列同源性為98.1%。表明廣西、云南和海南3省5個(gè)縣市廣州管圓線蟲ITS2基因具有高度同源性,與南美標(biāo)準(zhǔn)株屬于同一蟲種;廣西3縣市廣州管圓線蟲CO I基因具有高度同源性,與福建標(biāo)準(zhǔn)株屬于同一蟲種。 結(jié)論廣西、云南和海南3省9個(gè)縣市的蛞蝓廣州管圓線蟲的感染率不同,感染率的高低與蛞蝓滋生的環(huán)境等因素有關(guān)。高突足襞蛞蝓的廣州管圓線蟲感染率高于雙線嗜粘液蛞蝓,可能與生物學(xué)特性有關(guān)。廣西、云南和海南3省5縣市廣州管圓線蟲ITS2基因的同源性較高,與南美標(biāo)準(zhǔn)株親緣關(guān)系較近,屬同一蟲種;其中海南瓊中與廣西靖西分離株同屬一個(gè)小分支,廣西玉林與云南普洱位于另一個(gè)小分支,只有廣西南寧分離株處于獨(dú)立的一個(gè)小分支。因此,可以認(rèn)為海南瓊中與廣西靖西、廣西玉林與云南普洱的親緣性更高。廣西三縣市廣州管圓線蟲CO I基因的同源性較高,與福建標(biāo)準(zhǔn)株親緣關(guān)系較近,屬同一蟲種。其中廣西南寧與廣西玉林分離株同屬一個(gè)小分支,廣西靖西分離株處于獨(dú)立的一個(gè)小分支。因此,可以認(rèn)為廣西南寧與廣西玉林的親緣性更高。由于蛞蝓與居民生產(chǎn)生活密切接觸,因此存在潛在的人群感染威脅。
【關(guān)鍵詞】:廣州管圓線蟲 感染率 系統(tǒng)進(jìn)化樹 ITS2 CO Ⅰ
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R383.19
【目錄】:
- 英文縮略詞4-5
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-11
- 前言11-14
- 實(shí)驗(yàn)材料與實(shí)驗(yàn)方法14-26
- 結(jié)果26-49
- 討論49-57
- 結(jié)論57-58
- 參考文獻(xiàn)58-61
- 附錄61-74
- 綜述74-84
- 參考文獻(xiàn)81-84
- 致謝84-85
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文85
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):623687
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