高滲敏感煙曲霉T-DNA插入突變體的篩選和相關基因與致病力的關系研究
發(fā)布時間:2017-08-04 16:13
本文關鍵詞:高滲敏感煙曲霉T-DNA插入突變體的篩選和相關基因與致病力的關系研究
【摘要】:煙曲霉(Aspergillus fumigatus)是自然環(huán)境中廣泛存在的腐生真菌,分生孢子體積較�。ㄖ睆綖�2~3μm),可以經空氣播散且存活時間較長。人體每天吸入幾百個煙曲霉分生孢子,這些孢子可以經鼻腔、氣管到達支氣管末端和肺泡。 機體免疫功能健全的情況下,非特異性和特異性免疫應答可以有效清除這些孢子。然而,近些年隨著臨床上骨髓移植、器官移植以及化學藥物治療的開展,白血病、囊泡性纖維化、感染HIV等患者的增加,類固醇類激素、糖皮質激素和免疫抑制劑的使用導致機體免疫功能受損,防御能力降低,無法抵御煙曲霉分生孢子的黏附和侵襲,致使煙曲霉引起的感染病死率一直在50%以上。 1、利用根癌農桿菌介導的遺傳轉化體系獲得煙曲霉T-DNA插入突變體 根癌農桿菌攜帶有一個腫瘤誘導質粒(tumor-inducing plamid,Ti質粒)。根癌農桿菌侵染植物細胞時,Ti質粒的基因片段即T-DNA(transfer DNA)能夠隨機整合到宿主染色體,導致細胞生長調控失衡,形成冠癭瘤。質粒上的毒力基因在侵染過程中編碼毒力蛋白,負責單鏈T-DNA的形成、轉移和隨機插入基因組。利用根癌農桿菌介導的遺傳轉化體系(Agrobacterium tumefaciens-mediatedT-DNA insertional mutagenesis,ATMT)獲得3205株煙曲霉T-DNA插入突變體(Aspergillus fumigatus insertion mutants,,AFM),每一個突變體都相當于一個基因敲除株,T-DNA插入突變缺失位點多為單拷貝,HI-TAILPCR和BLAST方法可以定位插入位點相關基因,從而為研究基因功能提供菌株資源。 2、篩選高滲敏感煙曲霉T-DNA插入突變體 利用由無機鹽離子NaCl構成高滲透壓力,平板法篩選在1.25M NaCl濃度下較野生型菌落直徑減小、分生孢子生成障礙等表型發(fā)生改變的T-DNA插入突變體,總共從2086株中篩選出320株,建立高滲敏感煙曲霉T-DNA插入突變體亞庫。其中108株突變體通過HI-TAIL-PCR和BLAST確定插入突變基因,分析結果這些基因滲透壓感受、膜通道、能量代謝和細胞周期等相關。 3、構建煙曲霉金屬平衡蛋白bsd2基因敲除株和回復突變株 AFM3217在1.25M NaCl濃度下表現為菌落直徑減小、白化,分生孢子生成減少。HI-TAIL-PCR和BLAST比對確定打斷的序列位于bsd2基因上游啟動子區(qū)域的TATA盒,阻礙了轉錄因子與啟動子區(qū)域的結合,導致bsd2基因不能表達。bsd2基因敲除株與AFM3217表型基本一致,回復突變株與野生型表型基本一致。 4、致病力和藥物敏感性實驗 煙曲霉秀麗隱桿線蟲感染模型顯示與野生型相比,AFM3217的致病力明顯下降。采用美國國家臨床試驗室標準化委員會(CLSI,原NCCLs)頒布的微量稀釋法方案(M38-A2),結果顯示AFM3217對氟康唑(fluconazole,FCZ)、伊曲康唑(itraconazole,ITC)、伏立康唑(voriconazole,VCZ)、泊沙康唑(posaconazole,POS)、兩性霉素B(amphotericin B,AMB)、卡泊芬凈(caspofungin,CAS)、特比萘芬(terbinafine,TRB)和匹馬毒素(pimagedine,PIM)的敏感性與野生型無明顯差異。
【關鍵詞】:煙曲霉 高滲脅迫 T-DNA 致病力
【學位授予單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R379
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-13
- 第1章 緒論13-21
- 1.1 煙曲霉和煙曲霉感染13-14
- 1.1.1 煙曲霉的分類學地位和生物學特性13-14
- 1.1.2 煙曲霉引起的機體感染14
- 1.2 煙曲霉致病因子和致病機制的研究現狀14-16
- 1.2.1 煙曲霉致病因子的研究現狀15-16
- 1.2.2 煙曲霉致病機制的研究進展16
- 1.3 滲透壓應激在煙曲霉感染中的作用機制16-20
- 1.3.1 煙曲霉感染機體時面臨的應激反應16-17
- 1.3.2 高滲透壓應激的研究進展17-20
- 1.4 本研究的目的和意義20-21
- 第2章 利用根癌農桿菌介導的遺傳轉化體系(ATMT)獲得煙曲霉T-DNA 插入突變體21-27
- 2.1 材料21-23
- 2.1.1 菌株21
- 2.1.2 培養(yǎng)基21-22
- 2.1.3 試劑22-23
- 2.1.4 儀器設備23
- 2.2 方法23-25
- 2.2.1 煙曲霉 IFM40808 分生孢子懸濁液的制備23-24
- 2.2.2 根癌農桿菌 AGL-1 的活化和誘導培養(yǎng)24
- 2.2.3 煙曲霉 IFM40808 與根癌農桿菌 AGL-1 共培養(yǎng)24
- 2.2.4 轉化獲得煙曲霉 T-DNA 插入突變體24-25
- 2.3 結果25
- 2.4 討論25-27
- 第3章 建立高滲敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體亞庫27-30
- 3.1 材料27-28
- 3.1.1 菌株27
- 3.1.2 試劑27
- 3.1.3 儀器設備27-28
- 3.2 方法28
- 3.2.1 煙曲霉 IFM40808 在不同 NaCl 濃度構成的高滲透壓條件下的生長狀態(tài)28
- 3.2.2 高滲透壓培養(yǎng)基篩選敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體28
- 3.2.3 高滲敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體的形態(tài)學觀察28
- 3.3 結果28-29
- 3.4 討論29-30
- 第4章 高滲敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體的分子分析30-42
- 4.1 材料30-31
- 4.1.1 菌株30
- 4.1.2 試劑30
- 4.1.3 儀器設備30-31
- 4.2 方法31-35
- 4.2.1 高滲透壓敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體基因組 DNA 的提取31-32
- 4.2.2 HI-TAIL PCR 擴增煙曲霉 T-DNA 突變體的側翼序列32-35
- 4.2.3 HI-TAIL-PCR 產物測序35
- 4.3 結果35-39
- 4.3.1 煙曲霉 T-DNA 插入突變體 PCR 檢測 hph35-36
- 4.3.2 HI-TAIL PCR 擴增 T-DNA 插入突變體側翼序列36
- 4.3.3 高滲敏感煙曲霉 T-DNA 插入突變體36-38
- 4.3.4 功能基因分析38-39
- 4.4 討論39-42
- 第5章 構建煙曲霉 BSD2 基因敲除株和回復突變株42-61
- 5.1 材料42
- 5.1.1 菌株42
- 5.1.2 試劑42
- 5.1.3 培養(yǎng)基42
- 5.1.4 儀器設備42
- 5.2 生物信息學分析 AFM3217 的插入突變位點42-43
- 5.3 RT- PCR 驗證 BSD2 的轉錄水平43-45
- 5.3.1 設計特異性引物43
- 5.3.2 提取 IFM40808 和 AFM3217 的總 RNA43-44
- 5.3.3 逆轉錄反應合成 cDNA44-45
- 5.3.4 RT-PCR 反應45
- 5.4 構建 BSD2 的基因缺失株和回復突變株45-57
- 5.4.1 構建 bsd2 基因敲除株45-52
- 5.4.2 構建 bsd2 基因回復突變株52-57
- 5.5 野生型,AFM3217,BSD2 基因敲除株和回復突變株生物學性狀比較57
- 5.6 結果57-60
- 5.7 討論60-61
- 第6章 煙曲霉秀麗隱桿線蟲感染實驗和藥物敏感性實驗61-65
- 6.1 材料61-62
- 6.1.1 菌株61
- 6.1.2 培養(yǎng)基61-62
- 6.2 儀器設備62
- 6.3 方法62
- 6.3.1 大腸桿菌 OP50 菌液的制備:62
- 6.3.2 秀麗隱桿線蟲的培養(yǎng):62
- 6.4 煙曲霉秀麗隱桿線蟲感染模型的建立62
- 6.5 藥物敏感性實驗62-63
- 6.5.1 菌懸液制備62
- 6.5.2 微量稀釋法檢測待測 IFM40808 和 AFM3217 對抗真菌藥物的敏感性62-63
- 6.6 結果63-64
- 6.6.1 秀麗隱桿線蟲致病模型63
- 6.6.2 最低抑菌濃度(MIC)的判定63-64
- 6.7 討論64-65
- 第7章 結論65-66
- 參考文獻66-78
- 在學期間取得的科研成果78-79
- 致謝79
【共引文獻】
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1 程娜;曉軍;趙民安;張文明;姚大年;;農桿菌介導遺傳轉化宿主的研究進展[J];安徽農業(yè)科學;2006年24期
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6 喬建軍;劉偉;馬彥;萬U
本文編號:620486
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