南京地區(qū)2012~2013年G9型輪狀病毒VP7基因特征的分析
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【摘要】:A組輪狀病毒是引起成人和嬰幼兒急性腹瀉的主要病原。了解輪狀病毒流行株的型別,對主要中和抗原VP7的編碼基因進行遺傳變異分析,可為當(dāng)?shù)剌啝畈《疽呙绲膽?yīng)用和開發(fā)提供指導(dǎo)。我們對2012年10月至2013年12月南京地區(qū)908例腹瀉門診患者的糞便標本進行輪狀病毒檢測,采用RT-PCR方法對隨機抽取的50份陽性標本進行G分型,并對其中19份G9型輪狀病毒的VP7基因序列測序分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)輪狀病毒陽性率11.34%(103/908),其中以G9型為主,占78.0%(39/50),其次是G2、G1和G3型。對G9型輪狀病毒VP7基因核苷酸序列進行分析,顯示主要分為G9-VI亞型和G9-III亞型,以G9-VI亞型為主,且屬于中國和日本G9型輪狀病毒亞簇,部分毒株在A、B、C、F四個中和抗原表位中有變異,這可能有助于G9型輪狀病毒的流行,值得引起注意。
【作者單位】: 南京市疾病預(yù)防控制中心;中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】: 輪狀病毒G型 RT-PCR VP基因 遺傳變異
【基金】:南京市衛(wèi)生局十二五重大專項第6項 南京市醫(yī)學(xué)科技發(fā)展項目(QRX11039)
【分類號】:R373.2
【正文快照】: A組輪狀病毒(Group A rotavirus,GARV)近30年來被認為是嬰幼兒急性腹瀉最常見的病因。GARV感染廣泛,每年引起全世界大約453 000名5歲以下嬰幼兒的死亡,給全球帶來巨大的經(jīng)濟負擔(dān)[1-2]。GARV基因組編碼6種結(jié)構(gòu)蛋白(VP1~VP4,VP6和VP7)和6種非結(jié)構(gòu)蛋白(NSP1~NSP6)。外部衣殼由VP4
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