本文關(guān)鍵詞：基于全局角度網(wǎng)絡(luò)策略的復(fù)雜疾病風(fēng)險(xiǎn)通路識(shí)別

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【摘要】：復(fù)雜疾病的發(fā)生發(fā)展與機(jī)體內(nèi)生物學(xué)通路的功能紊亂有密切聯(lián)系,從高通量數(shù)據(jù)出發(fā),利用計(jì)算機(jī)輔助方法來(lái)研究疾病與通路間的關(guān)系具有重要意義.本文提出了一個(gè)新的基于網(wǎng)絡(luò)的全局性通路識(shí)別方法.該方法利用蛋白質(zhì)互作信息和通路的基因集組成信息構(gòu)建復(fù)雜的蛋白質(zhì)-通路網(wǎng).然后,基于表達(dá)譜數(shù)據(jù),通過(guò)隨機(jī)游走算法從全局層面優(yōu)化疾病風(fēng)險(xiǎn)通路.最終,通過(guò)擾動(dòng)方式識(shí)別統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著的風(fēng)險(xiǎn)通路.將該網(wǎng)絡(luò)運(yùn)用于結(jié)腸直腸癌風(fēng)險(xiǎn)通路識(shí)別,識(shí)別出15個(gè)與結(jié)腸直腸癌發(fā)生與發(fā)展過(guò)程顯著相關(guān)的通路.通過(guò)與其他通路識(shí)別方法(超幾何檢驗(yàn),SPIA)相比較,該方法能夠更有效識(shí)別出疾病相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)通路.
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 風(fēng)險(xiǎn)通路 蛋白質(zhì)-通路網(wǎng) 蛋白質(zhì)互作 隨機(jī)游走
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31200996) 黑龍江省教育廳項(xiàng)目(12531295) 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)于維漢院士杰出青年培養(yǎng)基金資助~~
【分類號(hào)】：R363
【正文快照】： 復(fù)雜疾病的發(fā)病機(jī)理被認(rèn)為是來(lái)自于多基因變異的聯(lián)合效應(yīng)[1],疾病的發(fā)生和發(fā)展與生物通路功能紊亂有密切聯(lián)系[2],此外藥物治療中也涉及代謝通路的局部改變[3].隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,產(chǎn)生了海量的生物學(xué)數(shù)據(jù).因此,從高通量數(shù)據(jù)出發(fā),利用生物信息學(xué)方法挖掘與疾病發(fā)生機(jī)制相關(guān)的

【共引文獻(xiàn)】

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

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【相似文獻(xiàn)】

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3 省人民醫(yī)院心內(nèi)科主任 曹克將;健康來(lái)自健康的生活方式[N];新華日?qǐng)?bào);2010年

4 浙江大學(xué)遺傳與基因組醫(yī)學(xué)教授 祁鳴邋鄭穎t，

本文編號(hào)：560197