H7N9流感病毒HA、NA蛋白的抗原表位預(yù)測(cè)及其與HLA-Ⅱ類等位基因的相關(guān)性分析
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更多相關(guān)文章: HN流感病毒 抗原性表位 HLA 易感性 血凝素 神經(jīng)氨酸酶
【摘要】:目的:分析H7N9流感病毒的HA、NA蛋白的抗原表位;預(yù)測(cè)H7N9流感病毒相關(guān)的HLA-Ⅱ類等位基因及易感人群。方法:軟件分析HA、NA的同源性、B細(xì)胞表位、T細(xì)胞表位以及與HA、NA結(jié)合力強(qiáng)的HLA-Ⅱ類等位基因;并根據(jù)該等位基因在亞洲不同地域的基因頻率,預(yù)測(cè)H7N9的易感人群。結(jié)果:H7N9流感病毒株之間氨基酸序列相對(duì)保守;HA具有10個(gè)B細(xì)胞表位和15個(gè)T細(xì)胞表位;NA有12個(gè)B細(xì)胞表位和9個(gè)T細(xì)胞表位;HLA等位基因DRB1*0701與HA、NA具有強(qiáng)結(jié)合力,在新疆、哈爾濱、山東、遼寧、北京、石家莊、天津等多個(gè)中國(guó)北方地區(qū)人群中的基因頻率較高,高于廣東、云南、臺(tái)灣地區(qū)、日本和韓國(guó)。結(jié)論:預(yù)測(cè)了HA、NA的抗原性表位,為H7N9流感病毒的疫苗研究提供了理論基礎(chǔ);HLA-DRB1*0701與H7N9流感病毒高度相關(guān);H7N9流感病毒在新疆、哈爾濱、山東、遼寧、北京、石家莊、天津地區(qū)更易傳播。
【作者單位】: 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院廣東省過(guò)敏反應(yīng)與免疫重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/呼吸疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室變態(tài)反應(yīng)研究室;
【關(guān)鍵詞】: HN流感病毒 抗原性表位 HLA 易感性 血凝素 神經(jīng)氨酸酶
【基金】:國(guó)家自然基金青年項(xiàng)目(81301948) 廣東高校優(yōu)秀青年創(chuàng)新人才培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目(20131LYM_0070) 廣州醫(yī)科大學(xué)博士啟動(dòng)項(xiàng)目(2012C40)的資助
【分類號(hào)】:R373.13
【正文快照】: 1本文受國(guó)家自然基金青年項(xiàng)目(81301948)、廣東高校優(yōu)秀青年創(chuàng)新人才培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目(20131LYM_0070)、廣州醫(yī)科大學(xué)博士啟動(dòng)項(xiàng)目(2012C40)的資助。甲型H7N9流感病毒是在2013年3月在中國(guó)東部上海和安徽兩地率先發(fā)現(xiàn)的一種新型禽流感病毒[1],感染該病毒將引起肺炎、呼吸道衰竭、急
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,本文編號(hào):536025
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