C.jejuni毒力及耐藥基因的分析和糞便中的C.jejuni快速鑒定
發(fā)布時(shí)間:2017-07-07 20:21
本文關(guān)鍵詞:C.jejuni毒力及耐藥基因的分析和糞便中的C.jejuni快速鑒定
更多相關(guān)文章: 吉蘭—巴雷綜合征 空腸彎曲菌 毒力基因 耐藥基因 快速鑒定 PCR
【摘要】:目的:1選取空腸彎曲菌的12對(duì)毒力相關(guān)基因和8對(duì)耐藥基因?qū)?株吉蘭-巴雷綜合征(Guillain-Barre syndrome, GBS)相關(guān)空腸彎曲菌(Campylobacter jejuni, C.jejuni,C.J.)及NCTC11168共4種菌株進(jìn)行相關(guān)基因分析和比較,了解致C.jejuni菌株毒力基因及耐藥基因性的特征,探討C.jejuni致GBS機(jī)制。 2傳統(tǒng)的對(duì)空腸彎曲菌的分離實(shí)驗(yàn)是通過傳代進(jìn)行培養(yǎng),經(jīng)過形態(tài)學(xué)鑒定及生化鑒定疑似空腸彎曲菌以后再做分子方面的鑒定實(shí)驗(yàn),至少要花費(fèi)三天的時(shí)間。常見的特異性生化實(shí)驗(yàn)馬尿酸實(shí)驗(yàn),由于放置的時(shí)間的差異會(huì)出現(xiàn)假陰性,降低分離率。而分離方法,需要經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)員挑取可疑單菌落,經(jīng)過純種傳代后,一些毒力及耐藥性可能因?yàn)檫@種非自然的傳代而喪失,影響我們對(duì)其分子方面的研究。本次實(shí)驗(yàn)旨在模擬從糞便中直接檢測(cè)出空腸彎曲菌的過程,找出特異性及靈敏度高的檢測(cè)方法,通過PCR對(duì)空腸彎曲菌進(jìn)行快速而準(zhǔn)確的鑒定。 方法:1選取空腸彎曲菌的12對(duì)毒力相關(guān)基因包括:黏附相關(guān)基因codF和racR,鞭毛蛋白基因flaA,毒素調(diào)節(jié)基因cdtA、cdtB、cdtC、wlaN和virB11質(zhì);,熱休克蛋白和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)蛋白基因dnaJ,ceuE,CiaB和pldA基因,8對(duì)耐藥相關(guān)基因包括對(duì)環(huán)丙沙星耐藥gyrA,parC基因,對(duì)四環(huán)素耐藥基因tet(o),對(duì)大環(huán)內(nèi)脂類耐藥基因mutation,CJ1/DP1,CJ18/CJ19和CJ20/SJ21,對(duì)妥布霉素-慶大霉素耐藥基因int1。應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)對(duì)菌株的毒力及耐藥基因進(jìn)行擴(kuò)增,通過擴(kuò)增出來的條帶確定空腸彎曲菌的毒力及耐藥基因的差別。 2利用平板傳代法對(duì)NC11168菌株傳代至P2代,經(jīng)過生化及分子鑒定;隨機(jī)收集病區(qū)中沒有腹瀉及吉蘭巴雷綜合征的患者的新鮮糞便16份,分別置于布氏肉湯中;將肉湯中的糞便振蕩分散后,利用濾膜過濾和PBS離心處理;在濾液中加入調(diào)整濁度后的NC11168菌液,根據(jù)添加菌液濃度的不同進(jìn)行分組,實(shí)驗(yàn)組分五組,分別為10~3個(gè)/ml組,10~4個(gè)/ml組,10~5個(gè)/ml組,10~6個(gè)/ml組及對(duì)照組;利用多重PCR及普通PCR對(duì)糞便進(jìn)行檢測(cè)。 結(jié)果:1毒力基因flaA, cadF, racR, pldA和cdtB在四種菌株中均可被檢測(cè)到,cdtA和dnaJ在lulei,lichang,NCTC11168三種菌株中可被檢測(cè)到。 virB11在四種菌株中都沒有被檢測(cè)到,CiaB和cdtC僅在lulei中存在, wlaN基因在lulei, lichang和qiaoyuntao三種菌株中均存在, ceuE在lulei,,qiaoyuntao和NCTC11168中可檢測(cè)到。耐藥相關(guān)基因中對(duì)大環(huán)內(nèi)脂類耐藥基因CJ1/DP1,在檢測(cè)的四株空腸彎曲菌中都被檢測(cè)到,CJ18/CJ19lichang,lulei和NCTC11168中檢測(cè)到,CJ20/CJ21于qiaoyuntao,NCTC11168和lulei中檢測(cè)到,mutation中沒有檢測(cè)到。環(huán)丙沙星耐藥基因gyrA和parC在檢測(cè)的四株空腸彎曲菌中都被檢測(cè)到。四環(huán)素耐藥質(zhì);騮et(o),只在lichang中檢測(cè)到。對(duì)妥布霉素-慶大霉素耐藥基因int1,在qiaoyuntao株中被檢測(cè)到。 2多重PCR的結(jié)果,在五個(gè)分組中,實(shí)驗(yàn)組2中的標(biāo)號(hào)為6和8的樣本中擴(kuò)增出一條16S的基因片段,實(shí)驗(yàn)組3中編號(hào)為9的樣本擴(kuò)增出一條hipo基因片段,實(shí)驗(yàn)組4中編號(hào)為14的樣本擴(kuò)增出兩個(gè)條帶即16S,hipo的基因片段。利用16S為擴(kuò)增的目的基因的普通PCR的結(jié)果,在五個(gè)分組中,實(shí)驗(yàn)組1中編號(hào)為4的樣本擴(kuò)增出目的條帶,實(shí)驗(yàn)組2中6和8的樣本中擴(kuò)增出目的條帶,實(shí)驗(yàn)組3(中編號(hào)為9,10,11的樣本均擴(kuò)增出目的條帶,實(shí)驗(yàn)組4中編號(hào)為13,14的樣本擴(kuò)增出目的條帶。利用普通PCR對(duì)樣本進(jìn)行map基因擴(kuò)增,各組均沒有擴(kuò)增出目的基因;對(duì)目的基因FlaA進(jìn)行擴(kuò)增在實(shí)驗(yàn)組1中編號(hào)4的樣本中擴(kuò)增出目的基因,實(shí)驗(yàn)組2中編號(hào)為6和8的樣本擴(kuò)增出目的條帶,實(shí)驗(yàn)組4中編號(hào)為13的樣本擴(kuò)增出目的基因。 結(jié)論:1空腸彎曲菌有著多重調(diào)控和監(jiān)控基因,還有多重的毒力及耐藥性。GBS相關(guān)的空腸彎曲菌的毒力基因比NCTC11168要多,而且不同的致病菌株間也有很大差異,在致病過程中的粘附,入侵,細(xì)胞毒作用和支持作用的基因都各不相同,毒力較強(qiáng)的lulei株在所測(cè)的12中毒力基因中所含的毒力基因種類最多。耐藥性在致病菌株中同樣較NCTC11168種類多,這可能與醫(yī)源環(huán)境有關(guān)。有沒有可能是不同的菌株是通過不同的機(jī)制致病,目前還沒有足夠的證據(jù)證明,但是通過對(duì)毒力和耐藥基因的研究,的確存在基因的侵染及耐藥的不同性。 2實(shí)驗(yàn)中通過蒸煮法獲得的DNA用于空腸彎曲菌的身份鑒定,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明多重PCR并不適用于糞便中的空腸彎曲菌的鑒定,在濃度為10~6-10~3中其準(zhǔn)確率低于30%,多重PCR在鑒定細(xì)菌的過程中對(duì)循環(huán)體系的組成及溫度的要求是相對(duì)嚴(yán)格的。在此次實(shí)驗(yàn)分別選取三個(gè)基因16S,map和flaA基因利用普通PCR的方法對(duì)14個(gè)樣本進(jìn)行基因擴(kuò)增,其中16S為的測(cè)出率相對(duì)較高,陽(yáng)性率約為81.15%,而對(duì)于map基因的擴(kuò)增沒有得到陽(yáng)性的結(jié)果,在flaA基因中12個(gè)實(shí)驗(yàn)組樣本中擴(kuò)增出4個(gè)陽(yáng)性結(jié)果,陽(yáng)性率約為33.33%。在三個(gè)普通PCR的結(jié)果中,16S的基因測(cè)出率相對(duì)較高,而其他的兩種基因結(jié)果不太理想,但是由于16S的特異性只局限在彎曲菌屬,不能對(duì)空腸彎曲菌進(jìn)行身份識(shí)別,所以對(duì)于彎曲菌中的目的基因的選取上還有很多值得研究的地方。
【關(guān)鍵詞】:吉蘭—巴雷綜合征 空腸彎曲菌 毒力基因 耐藥基因 快速鑒定 PCR
【學(xué)位授予單位】:河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R378.3;R3416
【目錄】:
- 摘要4-7
- ABSTRACT7-11
- 英文縮寫11-12
- 引言12-13
- 第一部分 空腸彎曲菌毒力及耐藥基因的分析13-33
- 前言13
- 材料與方法13-17
- 結(jié)果17-20
- 附圖20-24
- 附表24-27
- 討論27-29
- 小結(jié)29-30
- 參考文獻(xiàn)30-33
- 第二部分 糞便中空腸彎曲菌的快速分離33-44
- 前言33
- 材料與方法33-38
- 結(jié)果38-40
- 附圖40-42
- 討論42-43
- 小結(jié)43
- 參考文獻(xiàn)43-44
- 結(jié)論44-45
- 綜述 空腸彎曲菌質(zhì)粒及載體建立的研究及發(fā)展45-53
- 參考文獻(xiàn)50-53
- 致謝53-54
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷54
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 孫國(guó)富,童克中;枯草桿菌(Bacillus subtilis)穩(wěn)定的基因表達(dá)系統(tǒng)[J];生物工程進(jìn)展;1991年01期
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3 喬明強(qiáng),蔡寶立,蔣如璋,高才昌,郎艷軍,樊廷玉,蘇同芳;芽孢桿菌基因工程新載體的構(gòu)建[J];遺傳學(xué)報(bào);1989年05期
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條
1 彭勇;豆豉溶栓酶的純化及其基因的克隆與表達(dá)研究[D];四川大學(xué);2002年
2 王海燕;脫毛蛋白酶產(chǎn)生菌的選育及其堿性蛋白酶基因的克隆與表達(dá)[D];四川大學(xué);2006年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 張震;土傳植物病害拮抗細(xì)菌根圍生態(tài)學(xué)研究[D];浙江大學(xué);2004年
本文編號(hào):531707
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/531707.html
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