恥垢分枝桿菌MSMEG-6402基因的克
發(fā)布時(shí)間:2017-07-06 12:09
本文關(guān)鍵詞:恥垢分枝桿菌MSMEG-6402基因的克隆、表達(dá)及功能鑒定
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【摘要】:結(jié)核病(Tuberculosis,TB)主要是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的,多種耐藥性結(jié)核菌株的出現(xiàn)以及臨床抗結(jié)核藥物的缺乏,致使結(jié)核病發(fā)病率呈逐年上升趨勢(shì),尋找新的藥物靶點(diǎn)、開(kāi)發(fā)能有效治療多重耐藥結(jié)核的抗結(jié)核藥物亟待解決。 細(xì)胞壁是分枝桿菌賴以生存的重要屏障,而聚阿拉伯糖是細(xì)胞壁的核心組分。聚阿拉伯糖基的活性供體被證實(shí)是聚十異戊二烯磷酸阿拉伯糖(Decaprenyl-phospho-arabinose, DPA)。近幾年,隨著磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(Rv3806c)和差向異構(gòu)酶(Rv3790/Rv3791)功能的揭示,DPA特異的合成途徑逐漸被闡明,是由三個(gè)連續(xù)反應(yīng)組成:(1)Rv3806c催化5-磷酸核糖焦磷酸(PRPP)轉(zhuǎn)移到聚十異戊二烯磷酸(DP)分子上形成5-磷酸核糖聚十異戊二烯磷酸(5-P-DPR);(2)磷酸酶催化5-P-DPR分子上的5-磷酸基團(tuán)水解形成聚十異戊二烯磷酸核糖(DPR);(3)Rv3790/Rv3791催化DPR生成DPA。在此途徑中,催化5-P-DPR脫磷酸的磷酸酶尚未被鑒定。而與Rv3806c處于同一啟動(dòng)子的Rv3807c通過(guò)蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)具有磷酸酶功能結(jié)構(gòu)域,該蛋白被推測(cè)催化5-P-DPR生成了DPR。非致病菌恥垢分枝桿菌的MSMEG-6402基因是Rv3807c基因的同源基因,本論文通過(guò)在大腸桿菌BL21(DE3)中將MSMEG-6402基因克隆、可溶性表達(dá)并純化,建立MSMEG-6402蛋白的體外酶活測(cè)定方法,對(duì)MSMEG_6402的功能進(jìn)行闡明,這將有助于完善對(duì)于DPA合成代謝途徑的認(rèn)識(shí)以及尋找新型抗結(jié)核藥物靶點(diǎn)。 本研究的實(shí)驗(yàn)內(nèi)容包括:1)構(gòu)建pET16b-MSMEG-6402表達(dá)質(zhì)粒,在BL21(DE3)中進(jìn)行可溶性表達(dá),并用鎳-組氨酸親和層析法對(duì)帶有N-末端組氨酸標(biāo)簽的MSMEG-6402蛋白進(jìn)行純化,通過(guò)SDS-PAGE和Western-blotting對(duì)表達(dá)蛋白和純化蛋白進(jìn)行檢測(cè)鑒定;2)由于5-P-DPR反應(yīng)直接底物的缺乏,需要偶聯(lián)Rv3806c參與的酶促反應(yīng)來(lái)完成酶活檢測(cè),因此我們采用與MSMEG-6402相同的表達(dá)載體和菌株對(duì)Rv3806c蛋白進(jìn)行可溶性表達(dá)并純化,通過(guò)SDS-PAGE和Western-blotting進(jìn)行檢測(cè)鑒定;3)根據(jù)底物DP/PRPP和產(chǎn)物DPPR/DPR的性質(zhì)及其消耗產(chǎn)出量的變化,分別采用孔雀石綠-鉬酸銨測(cè)磷法、薄板層析法(TLC)以及質(zhì)譜法(MS)對(duì)MSMEG-6402純化蛋白的功能活性進(jìn)行檢測(cè)。 研究結(jié)果如下: 1)成功對(duì)MSMEG-6402基因和Rv3806c基因在大腸桿菌BL21(DE3)中進(jìn)行可溶性表達(dá),通過(guò)Ni-NTA純化獲得目的蛋白,分子量分別為20kDa和33kDa; 2)建立MSMEG-6402蛋白功能活性的測(cè)定方法,對(duì)其磷酸酶活性進(jìn)行鑒定:孔雀石綠-鉬酸銨測(cè)磷法對(duì)反應(yīng)生成的游離單磷酸進(jìn)行檢測(cè),,觀察到MSMEG-6402蛋白參與的反應(yīng)組明顯的顏色和OD630值變化,陰性對(duì)照組與空白對(duì)照組結(jié)果相近;TLC法對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物DPPR和DPR進(jìn)行檢測(cè),由于二者均為糖脂化合物,同時(shí)采用糖顯色和脂顯色,以DP和PRPP為底物對(duì)照,樣品組有DPPR和DPR的生成,而陰性對(duì)照組只有DPPR的生成;MS法對(duì)底物DP/PRPP的消耗量和產(chǎn)物DPPR/DPR的生成量進(jìn)行直接檢測(cè),結(jié)果顯示DP/PRPP有一定量的消耗,同時(shí)DPPR/DPR有相應(yīng)的峰出現(xiàn)。 綜上所述,本研究利用不同的方法對(duì)MSMEG-6402蛋白的功能進(jìn)行了闡明,鑒定了其特異的磷酸酶活性,催化5-P-DPR生成DPR,進(jìn)一步完善了DPA的合成代謝途徑,在今后的研究工作中,我們將改善對(duì)MSMEG-6402蛋白的純化方法,減少雜蛋白的含量,體外模擬DPA的合成通路,對(duì)MSMEG-6402蛋白在代謝網(wǎng)絡(luò)中扮演的角色進(jìn)一步闡述。
【關(guān)鍵詞】:恥垢分枝桿菌 MSMEG-6402 功能檢測(cè)
【學(xué)位授予單位】:大連醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:Q78;R378
【目錄】:
- 摘要6-8
- Abstract8-11
- 前言11-12
- 材料和方法12-20
- 結(jié)果20-30
- 討論30-34
- 結(jié)論34-35
- 未來(lái)工作35-36
- 參考文獻(xiàn)36-38
- 綜述38-48
- 參考文獻(xiàn)45-48
- 致謝48-50
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 董旭;辛毅;;重組蛋白在大腸桿菌中可溶性表達(dá)的策略[J];大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2007年04期
2 孫丕;梅建;;結(jié)核分枝桿菌中的分枝菌酸[J];中國(guó)防癆雜志;2010年07期
3 王天才;周金培;張惠斌;;抗結(jié)核藥物的研究進(jìn)展[J];中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào);2010年04期
本文編號(hào):526136
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