DNA甲基化與廣西巴馬地區(qū)長壽的相關(guān)性
本文關(guān)鍵詞:DNA甲基化與廣西巴馬地區(qū)長壽的相關(guān)性
更多相關(guān)文章: DNA混合池 DNA甲基化 巴馬 長壽
【摘要】:目的探討DNA甲基化與巴馬長壽的關(guān)系。方法在廣西巴馬縣長壽家族中選取60例90~110歲老人組成長壽組,在非長壽家族中選取48~85歲的健康者60例組成對照組。抽取外周血2 ml,構(gòu)建DNA混合池,利用Roche-Nimble Gen甲基化芯片技術(shù)對研究人群的全基因組進(jìn)行掃描,使用SPSS17.0軟件及在線分子功能注釋系統(tǒng)(MAS)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,P0.01視為甲基化程度較高的序列。結(jié)果共篩查出6 441個超甲基化位點(diǎn),其中長壽組392個,對照組6 049個。高甲基化位點(diǎn)共涉及1 618個基因,長壽組有133個,對照組有1 485個。兩組人群的高甲基化基因均涉及24個生物學(xué)功能,均以細(xì)胞過程、生理過程、生物調(diào)控為主。長壽組高甲基化基因涉及42個信號通路,對照組涉及156個信號通路。長壽組和對照組中均有與年齡相關(guān)性疾病有關(guān)聯(lián)的高甲基化基因,長壽組中涉及較多疾病的基因有CCKBR、COL18A1、EGR3、H19、IL11、TIMP1、S100A1等;對照組中涉及較多疾病的基因有ACSL1、ADAMTS13、ADCY8、AHRR、ARVCF、ATP2A1、ATP5I、BCS1L、GCK、ITGA2B等。結(jié)論本研究利用芯片技術(shù)篩查獲得了與長壽呈正相關(guān)和負(fù)相關(guān)的高甲基化位點(diǎn)、基因及其生物學(xué)功能分類、信號通路,為DNA甲基化和長壽的深入研究提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
【作者單位】: 廣西醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;廣西檢驗(yàn)檢疫局;廣西疾病預(yù)防控制中心;廣西醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)實(shí)驗(yàn)中心;
【關(guān)鍵詞】: DNA混合池 DNA甲基化 巴馬 長壽
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81260423,81060246) 廣西自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(2011GXNSED018029) 2012年優(yōu)秀博士學(xué)位論文培育項(xiàng)目(YCBZ2012012)
【分類號】:R394
【正文快照】: 廣西巴馬縣是長壽之鄉(xiāng),本課題組之前曾探討過DNA甲基化水平與巴馬長壽的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)巴馬人群和對照組的總體甲基化水平都呈增齡性下降,年齡與甲基化比值呈負(fù)相關(guān),巴馬縣人群的DNA總體甲基化水平比對照組人群高,提示巴馬長壽現(xiàn)象可能與該地區(qū)人群較高的DNA總體甲基化水平有關(guān)〔
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,本文編號:515401
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