2014年安徽省柯薩奇病毒A組16型分離株VP1基因特征研究
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【摘要】:研究2014年安徽省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)患兒中分離的柯薩奇病毒A組16型(Coxsachivirus A 16,CVA16)毒株VP1區(qū)基因特征。收集安徽省2014年1月至11月期間413份HFMD患兒咽拭子標(biāo)本接種敏感細(xì)胞分離腸道病毒,用熒光定量RT-PCR鑒定細(xì)胞培養(yǎng)物,對CVA16陽性培養(yǎng)物進(jìn)行毒株VP1區(qū)RT-PCR擴(kuò)增及核苷酸序列測定和基因特征分析,并與國內(nèi)外參考序列構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹。共分離鑒定出腸道病毒陽性培養(yǎng)物97份,其中CVA16病毒分離株17株,人腸道病毒71型(Human enterovirus 71,HEV71)分離株76株,其它腸道病毒分離株4株,總體病毒分離率為23.49%(97/413)。CVA16基因親緣性關(guān)系分析顯示:安徽省2014分離的17株CVA16毒株都屬于B1基因型B1b一個(gè)分支,它們之間在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分布為分別為95.30%~100%和98.70%~100%,但在B1b分支內(nèi)形成幾個(gè)傳播鏈。17株CVA16毒株VP1區(qū)核苷酸序列與國內(nèi)云南、湖南、廣東、西藏和江蘇地區(qū)病毒分離株同源性較高,親緣性關(guān)系近,其中與湖南2013年和廣東深圳2014年CVA16病毒分離株同源性最高,為96.40%~99.70%。2014年安徽省分離的CVA16病毒分離株屬于B1基因型B1b亞型,為優(yōu)勢流行株;在B1b分支內(nèi)形成多個(gè)小的病毒傳播鏈共同流行。
【作者單位】: 安徽省疾病預(yù)防控制中心;安徽醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 柯薩奇病毒A組型 手足口病 VP基因 B基因型
【分類號】:R373.2
【正文快照】: 手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一種在兒童中常見的傳染病,尤其對5歲以下幼兒易感,柯薩奇病毒A組16型(Coxsack-ievirus A16,CVA16)和人腸道病毒71型(Humanenterovirus 71,HEV71)已被證實(shí)為HFMD的兩種主要病原體[1-2]。自2008年安徽阜陽HFMD大規(guī)模暴發(fā)以來,有文
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