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類鼻疽伯克霍爾德菌全基因組測序及感染細(xì)胞模型的建立

發(fā)布時間:2017-06-21 01:02

  本文關(guān)鍵詞:類鼻疽伯克霍爾德菌全基因組測序及感染細(xì)胞模型的建立,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:類鼻疽伯克霍爾德菌(B. pseudomallei)是一種革蘭氏陰性桿菌,1911年首次在緬甸仰光分離到,運(yùn)動活躍,可以通過氣溶膠的形式傳播。根據(jù)能否利用L-阿拉伯糖可以將其分為致病性和非致病性,不能利用L-阿拉伯糖的為致病性菌株。2006年美國CDC將其列為B類病原體,“9.11”之后美國更視其為生物恐怖劑。類鼻疽伯克霍爾德菌能導(dǎo)致一種危害嚴(yán)重的熱帶疾病,稱為類鼻疽,臨床表現(xiàn)為多發(fā)性膿腫,難治性肺炎和致死性的敗血癥,死亡率可達(dá)40%。我國海南、廣東、廣西和臺灣等地都是類鼻疽的疫源地。隨著地區(qū)輸入性病例的增多,該病原體越來越受到重視,但在中國類鼻疽的研究還亟待加強(qiáng)。 開展類鼻疽的研究首先需要具有參考價值的標(biāo)準(zhǔn)株,但是由于涉及生物安全和生物威脅,難于直接從國外獲取標(biāo)準(zhǔn)菌株;蚪M測序是了解細(xì)菌遺傳背景的最本質(zhì)的方法。為此本研究篩選了一株臨床B. pseudomallei進(jìn)行全基因組測序并進(jìn)一步分析其基因組的特點(diǎn),以形成我國B. pseudomallei標(biāo)準(zhǔn)株。 同時,建立B. pseudomallei感染細(xì)胞模型是研究細(xì)菌與宿主細(xì)胞相互作用的前提。本研究擬以完成測序的B. pseudomallei BPC006為感染細(xì)菌,通過優(yōu)化B. pseudomallei感染RAW264.7的各項(xiàng)參數(shù),觀察細(xì)胞受B. pseudomallei感染后細(xì)胞形態(tài)的特殊變化,檢測宿主細(xì)胞的生化和免疫學(xué)指標(biāo),以期建立穩(wěn)定的B. pseudomallei感染細(xì)胞模型。 方法 1.采用454測序儀對一株來自我國海南的B. pseudomallei BPC006進(jìn)行全基因組測序。調(diào)用Newbler2.3軟件、比照參考株B. pseudomallei strain1106a進(jìn)行參考拼接,PCR、ABI3730測序儀補(bǔ)全漏洞(gap)后進(jìn)行在線注釋、糾錯、提交、分析。 2.分別制備B. pseudomallei BPC006全菌超聲抗原、甲醛滅活全菌抗原及熱滅活全菌抗原,免疫BALB/c小鼠和家兔,制備其多抗血清。 3.通過透射電鏡和熒光標(biāo)記觀察胞內(nèi)細(xì)菌確認(rèn)B. pseudomallei胞內(nèi)感染,Giemsa染色和倒置顯微鏡動態(tài)觀察細(xì)胞融合和多核巨細(xì)胞(multinucleated giant cells,MNGC)形成規(guī)律,計算侵襲率和檢測促炎癥因子,評價模型穩(wěn)定性。 結(jié)果 1.完成了B. pseudomallei BPC006的全基因組序列測定,其序列號為:CP003781(1號染色體)和CP003782(2號染色體),分析發(fā)現(xiàn)其基因組中有溶源性大片段的插入、缺失和突變,構(gòu)建類鼻疽伯克霍爾德菌的系統(tǒng)發(fā)生樹。 2. B. pseudomallei BPC006全菌免疫BALB/c小鼠和兔,ELISA和凝集效價高達(dá)1:64000和1:128,免疫熒光顯示制備的抗體能與胞內(nèi)B. pseudomallei BPC006菌體發(fā)生特異的抗原抗體反應(yīng)。 3. MOI=100時B. pseudomallei感染RAW264.7細(xì)胞,細(xì)菌在胞內(nèi)繁殖后促使細(xì)胞間發(fā)生融合,可見明顯的MNGC形成,,1~24h炎癥因子TNF-α呈“雙峰”變化。 結(jié)論 1.首次對中國B. pseudomallei臨床分離株進(jìn)行了全基因組測序,建立了B.pseudomallei研究的標(biāo)準(zhǔn)株,得到了臨床分離株B. pseudomallei BPC006的全序列,分析其遺傳特點(diǎn),為后續(xù)的類鼻疽流行病學(xué)調(diào)查、診斷及預(yù)防靶點(diǎn)的篩選提供了依據(jù)。 2.制備了針對B. pseudomallei BPC006全菌的多抗血清,為后續(xù)病原體的診斷和細(xì)胞微生物學(xué)研究提供了有效的工具。 3.建立了穩(wěn)定的B. pseudomallei感染RAW264.7細(xì)胞模型,為研究病原菌與宿主細(xì)胞的相互作用奠定了基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:類鼻疽伯克霍爾德菌 全基因組測序 細(xì)胞模型
【學(xué)位授予單位】:第三軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R378
【目錄】:
  • 縮略語表4-6
  • Abstract6-8
  • 摘要8-10
  • 第一章 前言10-14
  • 第二章 類鼻疽伯克霍爾德菌基因組測序14-43
  • 2.1 材料與方法14-24
  • 2.2 結(jié)果與分析24-41
  • 2.3 討論41-43
  • 第三章 類鼻疽伯克霍爾德菌感染 RAW264.7 細(xì)胞模型的建立43-57
  • 3.1 材料與方法43-49
  • 3.2 結(jié)果與分析49-55
  • 3.3 討論55-57
  • 全文總結(jié)57-58
  • 本研究的不足與展望58-59
  • 參考文獻(xiàn)59-67
  • 文獻(xiàn)綜述一 類鼻疽的研究進(jìn)展及診療現(xiàn)狀67-73
  • 參考文獻(xiàn)72-73
  • 文獻(xiàn)綜述二 類鼻疽伯克霍爾德菌基因組學(xué)概述及進(jìn)展73-82
  • 參考文獻(xiàn)80-82
  • 附件82-85
  • 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及參與的課題85-86
  • 致謝86

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 陳海,楊小敏,王才春;類鼻疽伯克霍德菌敗血癥四例[J];中華傳染病雜志;2004年03期

2 莫成錦,王旭明,符惠群,谷海瀛;人的類鼻疽:我們必須警惕的感染性疾病[J];中國熱帶醫(yī)學(xué);2002年01期

3 陸振豸;我國類鼻疽研究進(jìn)展情況[J];中國人獸共患病雜志;1988年01期

4 梁思禮,梁華;類鼻疽肺病四例報告與文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[J];中華結(jié)核和呼吸雜志;1994年03期

5 賈杰!570311?;類鼻疽16例誤診探討[J];臨床內(nèi)科雜志;1999年06期

6 吳至成,陳海;類鼻疽假單孢菌致急性敗血型類鼻疽1例報告[J];中國熱帶醫(yī)學(xué);2002年02期

7 宋e,陆振

本文編號:467254


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