目的探討共生菌群對(duì)荷瘤小鼠肺泡巨噬細(xì)胞(AM)基因表達(dá)的調(diào)控作用。方法分離純化共生菌缺失的荷瘤小鼠及共生菌正常的荷瘤小鼠AM,利用基因芯片技術(shù)篩選差異表達(dá)的基因并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果分選后的AM細(xì)胞純度可達(dá)98%,共生菌缺失荷瘤小鼠與正常荷瘤小鼠相比較,AM細(xì)胞中差異性表達(dá)基因共有353個(gè)(變化倍數(shù)≥2),上調(diào)基因171個(gè),下調(diào)基因182個(gè);差異表達(dá)基因的基因分類(GO)主要為細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化、信號(hào)傳導(dǎo)、血管生成等;KEGG通路主要為氮素代謝、趨化因子信號(hào)、TGF-β信號(hào)及腫瘤通路等;M2型巨噬細(xì)胞特異性基因CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等在共生菌缺失荷瘤小鼠AM細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)。結(jié)論共生菌可以調(diào)控荷瘤小鼠AM細(xì)胞的基因表達(dá),包括CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等基因,差異表達(dá)基因與多個(gè)GO分類和KEGG通路密切相關(guān)。

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圖1共生菌缺失對(duì)荷瘤小鼠肺泡巨噬細(xì)胞基因表達(dá)的影響注:WT+LLC為共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC為共生菌缺失的荷瘤小鼠

圖2共生菌缺失荷瘤小鼠肺泡巨噬細(xì)胞差異表達(dá)基因的功能分析

血管生成、分泌、細(xì)胞分化、細(xì)胞增殖、對(duì)刺激的反應(yīng)性、運(yùn)動(dòng)、信號(hào)、多器官過程及免疫系統(tǒng)過程等(圖2A、圖2B)。KEGG通路分析結(jié)果表明，共生菌缺失后荷瘤小鼠肺泡巨噬細(xì)胞差異性表達(dá)基因主要與氮素代謝、趨化因子信號(hào)通路、TGF-β信號(hào)通路、腫瘤通路、細(xì)胞因子－細(xì)胞因子受體相互作用等信....

圖3肺泡巨噬細(xì)胞中M1和M2型巨噬細(xì)胞特異性基因的表達(dá)情況注:WT+LLC為共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC為共生菌缺失的荷瘤小鼠

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