分枝桿菌ESX-1分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)蛋白MycP1的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
發(fā)布時間:2021-01-15 01:42
結(jié)核病是目前世界范圍內(nèi)流行范圍最廣、致死率最高的的傳染性疾病之一。全球每年新增近千萬感染者,并造成近百萬人死亡。結(jié)核分枝桿菌是結(jié)核病的致病菌,它能夠產(chǎn)生多種致病因子,具有強(qiáng)致病性;同時具有多重耐藥性和免疫逃逸能力,對寄生環(huán)境有極強(qiáng)的適應(yīng)能力。因此,結(jié)核分枝桿菌一直都是對人類健康威脅最大的致病菌之一。近年來,對結(jié)核分枝桿菌致病性和耐藥性的研究取得了較大的進(jìn)展,越來越多與之相關(guān)的蛋白被發(fā)現(xiàn)。在本論文中,我們對分枝桿菌致病因子分泌系統(tǒng)ESX-1的調(diào)節(jié)蛋白MycP1以及結(jié)核分枝桿菌外膜蛋白RV1698開展結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,用X-射線晶體衍射方法解析了它們的三維結(jié)構(gòu),并探究了結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系,初步闡釋了這兩個蛋白質(zhì)在分枝桿菌致病過程中的作用機(jī)制。本論文的第一部分是分枝桿菌ESX-1分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)蛋白MycP1的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。結(jié)核分枝桿菌中存在一種新型分泌系統(tǒng)T7SS (Type Ⅶ secretion system,), ESX-1系統(tǒng)就是一種典型的T7SS,也是分枝桿菌中研究最廣泛的分泌系統(tǒng)。ESX-1分泌系統(tǒng)是分枝桿菌致病性的決定因素之一,致病性分枝桿菌在感染宿主細(xì)胞的過程中會通過ESX-...
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:120 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核分枝桿菌桿菌外膜結(jié)構(gòu)與外膜蛋白
1.2.1 分枝桿菌具有復(fù)雜的包膜結(jié)構(gòu)
1.2.2 分枝桿菌的外膜體系
1.2.3 基于膜孔蛋白的跨膜通路
1.2.4 分枝桿菌外膜蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3 結(jié)核分枝桿菌的ESX-1分泌系統(tǒng)
1.3.1 革蘭氏陰性菌的分泌系統(tǒng)
1.3.2 結(jié)核分枝桿菌中的T7SS/ESX-1分泌系統(tǒng)
1.3.3 ESX-1分泌系統(tǒng)的作甩機(jī)制
1.3.4 ESX-1分泌系統(tǒng)與結(jié)核分枝桿菌的致病性
1.3.5 ESX-1分泌系統(tǒng)的調(diào)控機(jī)制
第二章 結(jié)核分枝桿菌ESX-1分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)蛋白MycP1的結(jié)構(gòu)與功能研究
2.1 研究背景
2.2 實驗材料與方法
2.2.1 MycP1、MycP1突變體及EspB蛋白表達(dá)載體構(gòu)建
2.2.2 蛋白表達(dá)與純化
2.2.3 蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析
2.2.4 EspB蛋白的體外酶切實驗
2.2.5 MycP1的分子動力學(xué)模擬
2.3 實驗結(jié)果與討論
24-422蛋白的序列分析"> 2.3.1 MycP124-422蛋白的序列分析
24-422蛋白的表達(dá)和純化"> 2.3.2 MycP124-422蛋白的表達(dá)和純化
24-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)"> 2.3.3 MycP124-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)
24-422蛋白的活性中心與底物結(jié)合口袋"> 2.3.4 MycP124-422蛋白的活性中心與底物結(jié)合口袋
24-422蛋白的propeptide是無序的loop結(jié)構(gòu)"> 2.3.5 MycP124-422蛋白的propeptide是無序的loop結(jié)構(gòu)
24-422蛋白的表達(dá)和純化"> 2.3.6 MycP124-422蛋白的表達(dá)和純化
63-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)"> 2.3.7 MycP163-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)
2.3.8 MycP1對底物蛋白EspB的酶切
2.3.9 “propeptide”對MycP1蛋白分子構(gòu)象穩(wěn)定性的影響
2.4 本章小結(jié)
第三章 結(jié)核分枝桿菌外膜蛋白Rv1698的結(jié)構(gòu)與功能研究
3.1 研究背景
3.2 實驗材料與方法
3.2.1 Rv1698及其突變體表達(dá)載體構(gòu)建
3.2.2 蛋白表達(dá)與純化
27-314蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析"> 3.2.3 Rv169827-314蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析
3.2.4 分析型超速離心實驗
FL蛋白負(fù)染電鏡樣品制備及數(shù)據(jù)采集"> 3.2.5 Rv1698FL蛋白負(fù)染電鏡樣品制備及數(shù)據(jù)采集
3.2.6 恥垢分枝桿菌表達(dá)體系
3.3 實驗結(jié)果與討論
3.3.1 Rv1698蛋白的序列分析
3.3.2 Rv1698的水溶性特征
3.3.3 Rv1698的整體結(jié)構(gòu)
3.3.4 Rv1698蛋白的膜定位及寡聚化
3.3.5 Rv1698多聚體模型的構(gòu)建
3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的其他研究成果
本文編號:2977967
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【文章頁數(shù)】:120 頁
【學(xué)位級別】:博士
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摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核分枝桿菌桿菌外膜結(jié)構(gòu)與外膜蛋白
1.2.1 分枝桿菌具有復(fù)雜的包膜結(jié)構(gòu)
1.2.2 分枝桿菌的外膜體系
1.2.3 基于膜孔蛋白的跨膜通路
1.2.4 分枝桿菌外膜蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3 結(jié)核分枝桿菌的ESX-1分泌系統(tǒng)
1.3.1 革蘭氏陰性菌的分泌系統(tǒng)
1.3.2 結(jié)核分枝桿菌中的T7SS/ESX-1分泌系統(tǒng)
1.3.3 ESX-1分泌系統(tǒng)的作甩機(jī)制
1.3.4 ESX-1分泌系統(tǒng)與結(jié)核分枝桿菌的致病性
1.3.5 ESX-1分泌系統(tǒng)的調(diào)控機(jī)制
第二章 結(jié)核分枝桿菌ESX-1分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)蛋白MycP1的結(jié)構(gòu)與功能研究
2.1 研究背景
2.2 實驗材料與方法
2.2.1 MycP1、MycP1突變體及EspB蛋白表達(dá)載體構(gòu)建
2.2.2 蛋白表達(dá)與純化
2.2.3 蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析
2.2.4 EspB蛋白的體外酶切實驗
2.2.5 MycP1的分子動力學(xué)模擬
2.3 實驗結(jié)果與討論
24-422蛋白的序列分析"> 2.3.1 MycP124-422蛋白的序列分析
24-422蛋白的表達(dá)和純化"> 2.3.2 MycP124-422蛋白的表達(dá)和純化
24-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)"> 2.3.3 MycP124-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)
24-422蛋白的活性中心與底物結(jié)合口袋"> 2.3.4 MycP124-422蛋白的活性中心與底物結(jié)合口袋
24-422蛋白的propeptide是無序的loop結(jié)構(gòu)"> 2.3.5 MycP124-422蛋白的propeptide是無序的loop結(jié)構(gòu)
24-422蛋白的表達(dá)和純化"> 2.3.6 MycP124-422蛋白的表達(dá)和純化
63-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)"> 2.3.7 MycP163-422蛋白的晶體結(jié)構(gòu)
2.3.8 MycP1對底物蛋白EspB的酶切
2.3.9 “propeptide”對MycP1蛋白分子構(gòu)象穩(wěn)定性的影響
2.4 本章小結(jié)
第三章 結(jié)核分枝桿菌外膜蛋白Rv1698的結(jié)構(gòu)與功能研究
3.1 研究背景
3.2 實驗材料與方法
3.2.1 Rv1698及其突變體表達(dá)載體構(gòu)建
3.2.2 蛋白表達(dá)與純化
27-314蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析"> 3.2.3 Rv169827-314蛋白晶體生長、數(shù)據(jù)采集與結(jié)構(gòu)解析
3.2.4 分析型超速離心實驗
FL蛋白負(fù)染電鏡樣品制備及數(shù)據(jù)采集"> 3.2.5 Rv1698FL蛋白負(fù)染電鏡樣品制備及數(shù)據(jù)采集
3.2.6 恥垢分枝桿菌表達(dá)體系
3.3 實驗結(jié)果與討論
3.3.1 Rv1698蛋白的序列分析
3.3.2 Rv1698的水溶性特征
3.3.3 Rv1698的整體結(jié)構(gòu)
3.3.4 Rv1698蛋白的膜定位及寡聚化
3.3.5 Rv1698多聚體模型的構(gòu)建
3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的其他研究成果
本文編號:2977967
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