誘導多能干細胞和腫瘤干細胞中致瘤基因的生物信息學分析
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1、高通量基因表達譜的整合分析策略(以腫瘤干細胞為例)
8圖1、高通量基因表達譜的整合分析策略(以腫瘤干細胞為例)二、主要功能模塊1、數(shù)據(jù)預處理不同來源的基因表達譜數(shù)據(jù),由于樣本來源、實驗處理手段和芯片平臺等的不同,可能導致這些數(shù)據(jù)之間存在較大的異質性,為了使其具有可比性,我們將采用經(jīng)典的基因芯片處理工具B....
圖4、候選基因在16個正常人組織和部分腫瘤細胞株中的表達注:A.腫瘤特異性表達基因(CSCG1-4):不在16中人的正常組織細胞中表
32圖4、候選基因在16個正常人組織和部分腫瘤細胞株中的表達注:A.腫瘤特異性表達基因(CSCG1-4):不在16中人的正常組織細胞中表達,而只在各種腫瘤細胞株中表達;B.腫瘤相對特異性表達基因(CSCG5-16):只在個別的人正常組中表達,如睪丸;C、腫瘤特異性新....
圖5.iPSC一致基因及其與腫瘤發(fā)生相互關聯(lián)的總體分析策略
第三部分誘導多能干細胞(iPSCs)一致基因的計算鑒別及其瘤性風險的探討一、前言簡介誘導多能干細胞(iPSCs)的致瘤性問題,一直困擾著研究者們,想要將其全地應用到臨床干細胞治療,就必須發(fā)展新的策略和方法,既要使得iPSCs盡展現(xiàn)正常干細胞的特性,同時還要阻止其致瘤潛能的表現(xiàn)....
圖6、源自不同分化細胞的iPSCs過表達基因的交集分析結果
部分誘導多能干細胞和腫瘤干細胞中致瘤基因的生物信個和107個基因,進行交集分析,結果顯示,88個基因共同過表達在(fibroblasts)源和HTM源的iPSCs中(圖6A,表11)——記作I級基因(F100),其中72個是已知基因。其次,對Gr....
本文編號:3997701
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