誘導(dǎo)多能干細(xì)胞和腫瘤干細(xì)胞中致瘤基因的生物信息學(xué)分析
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1、高通量基因表達(dá)譜的整合分析策略(以腫瘤干細(xì)胞為例)
8圖1、高通量基因表達(dá)譜的整合分析策略(以腫瘤干細(xì)胞為例)二、主要功能模塊1、數(shù)據(jù)預(yù)處理不同來源的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),由于樣本來源、實驗處理手段和芯片平臺等的不同,可能導(dǎo)致這些數(shù)據(jù)之間存在較大的異質(zhì)性,為了使其具有可比性,我們將采用經(jīng)典的基因芯片處理工具B....
圖4、候選基因在16個正常人組織和部分腫瘤細(xì)胞株中的表達(dá)注:A.腫瘤特異性表達(dá)基因(CSCG1-4):不在16中人的正常組織細(xì)胞中表
32圖4、候選基因在16個正常人組織和部分腫瘤細(xì)胞株中的表達(dá)注:A.腫瘤特異性表達(dá)基因(CSCG1-4):不在16中人的正常組織細(xì)胞中表達(dá),而只在各種腫瘤細(xì)胞株中表達(dá);B.腫瘤相對特異性表達(dá)基因(CSCG5-16):只在個別的人正常組中表達(dá),如睪丸;C、腫瘤特異性新....
圖5.iPSC一致基因及其與腫瘤發(fā)生相互關(guān)聯(lián)的總體分析策略
第三部分誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)一致基因的計算鑒別及其瘤性風(fēng)險的探討一、前言簡介誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)的致瘤性問題,一直困擾著研究者們,想要將其全地應(yīng)用到臨床干細(xì)胞治療,就必須發(fā)展新的策略和方法,既要使得iPSCs盡展現(xiàn)正常干細(xì)胞的特性,同時還要阻止其致瘤潛能的表現(xiàn)....
圖6、源自不同分化細(xì)胞的iPSCs過表達(dá)基因的交集分析結(jié)果
部分誘導(dǎo)多能干細(xì)胞和腫瘤干細(xì)胞中致瘤基因的生物信個和107個基因,進(jìn)行交集分析,結(jié)果顯示,88個基因共同過表達(dá)在(fibroblasts)源和HTM源的iPSCs中(圖6A,表11)——記作I級基因(F100),其中72個是已知基因。其次,對Gr....
本文編號:3997701
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