脫氫表雄酮誘導(dǎo)的多囊卵巢綜合征模型大鼠的腸道菌群研究
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978上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)2019,39(9)JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCE)Vol.39No.9Sep.201916SrRNA測序。對所有有效原始數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,獲得優(yōu)化序列,進(jìn)行操作分類單元(operationaltaxonomicunits,OTU)聚類。從各個OTU中挑選出豐度最高的一條序列,作為該OTU的代表序列。將該代表序列與核糖體數(shù)據(jù)庫(RibosomalDatabaseProject,RDP)中已知物種的16SrRNA基因序列進(jìn)行比對,從而對每個OTU進(jìn)行物種歸類。根據(jù)物種注釋情況,統(tǒng)計(jì)每個樣品中被注釋到各分類水平上的序列數(shù)目。根據(jù)物種注釋結(jié)果繪制物種組成柱形圖,從而進(jìn)行物種相對豐度分析。LEfSe分析(LDAEffectSize)采用線性判別分析(lineardiscriminantanalysis,LDA)來估算每個物種的豐度對2組之間差異的影響程度,找出影響2組之間產(chǎn)生顯著差異的群落或物種,以LDA≥2.0為顯著差異判定標(biāo)準(zhǔn)。通過R軟件包繪制優(yōu)勢物種之間Spearman相關(guān)性熱圖,以發(fā)現(xiàn)優(yōu)勢物種之間重要的模式與關(guān)系;16SrRNA和參考序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行PICRUSt(phylogeneticinvestigationofcommunitiesbyreconstructionofunobservedstates),以較好地反映樣品中的功能基因構(gòu)成,從而預(yù)測基因功能。1.6統(tǒng)計(jì)學(xué)分析所有數(shù)據(jù)采用SPSS19.0軟件進(jìn)行分析。結(jié)果以x—±s表示。檢驗(yàn)樣本變量之間的方差齊性,多組間的均數(shù)比較采用單因素方差分析(One-WayANOVA)及t檢驗(yàn)(Student'sttest)。P<0.05時被認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2結(jié)果2.1大鼠體質(zhì)量變化實(shí)驗(yàn)組大鼠連續(xù)28d皮下注射DHEA溶液,其體質(zhì)量的增長情況與皮下注射PBS的對照組大鼠相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,圖1)。圖12組大鼠體質(zhì)量增長的情況Fig1Growthofbodyweightofratsfromtwogroups2.2大鼠動情周期改變在實(shí)驗(yàn)的第4周
析(One-WayANOVA)及t檢驗(yàn)(Student'sttest)。P<0.05時被認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2結(jié)果2.1大鼠體質(zhì)量變化實(shí)驗(yàn)組大鼠連續(xù)28d皮下注射DHEA溶液,其體質(zhì)量的增長情況與皮下注射PBS的對照組大鼠相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,圖1)。圖12組大鼠體質(zhì)量增長的情況Fig1Growthofbodyweightofratsfromtwogroups2.2大鼠動情周期改變在實(shí)驗(yàn)的第4周,2組大鼠的動情周期出現(xiàn)明顯差異。與對照組大鼠相比,實(shí)驗(yàn)組大鼠的動情周期延長,動情周期明顯紊亂(圖2)。注:A.對照組;B.實(shí)驗(yàn)組。每組展示3只大鼠的動情周期代表圖。動、前、間、后分別表示動情期、動情前期、動情間期、動情后期圖22組大鼠動情周期的情況Fig2EstrouscyclesofratsfromtwogroupsAB
979http://xuebao.shsmu.edu.cn上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2019,39(9)2.3大鼠卵巢質(zhì)量及形態(tài)學(xué)改變實(shí)驗(yàn)組大鼠卵巢質(zhì)量較對照組降低(圖3A,P=0.010)。通過H-E染色可見,對照組大鼠卵巢皮質(zhì)內(nèi)存在黃體和各級卵泡,排卵前卵泡內(nèi)可見卵丘及卵母細(xì)胞,卵泡形態(tài)較為規(guī)則(圖3B)。而實(shí)驗(yàn)組大鼠卵巢形態(tài)出現(xiàn)明顯改變,小竇卵泡增多,伴卵泡囊性擴(kuò)張、卵泡壁顆粒細(xì)胞層減少、卵泡壁變薄等異常改變(圖3C)。注:A.2組大鼠卵巢質(zhì)量比較;B.對照組大鼠卵巢形態(tài);C.實(shí)驗(yàn)組大鼠卵巢形態(tài)圖32組大鼠卵巢質(zhì)量及H-E染色情況Fig3OvarianweightandH-Estainingofratovariesintwogroups注:A.對照組、實(shí)驗(yàn)組內(nèi)每只大鼠腸道菌群的相對豐度;B.2組大鼠腸道菌群的相對豐度圖42組大鼠腸道菌群在屬水平的相對豐度Fig4Relativeabundanceofgutmicrobiotaoftwogroupsofratsingenuslevel2.4大鼠腸道菌群的豐度變化在屬水平,對照組內(nèi)每只大鼠腸道菌群組成情況較為類似,而實(shí)驗(yàn)組中各大鼠間腸道菌群的相對豐度變化較大(圖4A)。2組大鼠腸道菌群豐度較高的屬依次為普雷沃菌屬(Prevotella)、擬桿菌屬(Bacteroides)、考拉桿菌屬(Phascolarctobacterium)、乳桿菌屬(Lactobacillus)及梭菌屬(Clostridium)(圖4B)。對比2組間大鼠腸道菌群的相對豐度發(fā)現(xiàn),擬普雷沃菌屬(Alloprevotella,P=0.040)及副薩特菌屬(Parasutterella,P=0.009)的豐度差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(表1)。ABBCA儲維薇,等脫氫表雄酮誘導(dǎo)的多囊卵巢綜合征模型大鼠的腸道菌群研究
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