由于腸道菌群與人體的健康和一些代謝性疾病的發(fā)生有著密切的關(guān)系，所以越來越多的研究人員在該領(lǐng)域展開了研究工作。本論文分別對(duì)嬰兒和中青年人群、藏族牧民和城市居民以及哈薩克族和維吾爾族居民腸道微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究，同時(shí)對(duì)不同民族居民其腸道菌群是否存在共有的或者特有的種系型進(jìn)行了探討。為了初步間接的探討改變代謝性疾病患者腸道菌群的結(jié)構(gòu)是否會(huì)對(duì)疾病治療產(chǎn)生影響，本研究選取對(duì)人體腸道菌群具有顯著影響作用的益生菌和菊粉為研究對(duì)象，通過采用循證醫(yī)學(xué)的研究手段，探討其在臨床應(yīng)用中是否對(duì)高脂血癥具有治療作用。論文的主要研究結(jié)果如下： （1）本部分研究選取中國四川地區(qū)5例健康漢族嬰兒、6例青年人和6例中年人的糞便樣品樣品作為研究對(duì)象，以454焦磷酸測序技術(shù)結(jié)合多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)方法檢測細(xì)菌16S rRNA基因V5-V6區(qū)的多樣性。通過基于UniFrac的主成分分析（principal componentanalysis，PCoA）和非加權(quán)組平均法（Unweighted Pair Group Method with ArithmeticMean，UPGMA)我們發(fā)現(xiàn)嬰兒樣品與中青年樣品是完全分離的而部分中青年的樣品存在交疊現(xiàn)象。多元方差分析（Multivariate analysis of variance，MANOVA）表明嬰兒腸道菌群群落結(jié)構(gòu)與中青年差異顯著而中青年腸道菌群群落結(jié)構(gòu)差異不顯著。無論是基于加權(quán)還是非加權(quán)的UniFrac距離分析（weighted and unweighted UniFrac distances）均顯示嬰兒組內(nèi)平均UniFrac距離大于青年和中年組，同時(shí)中年組和青年組間差異不顯著。中青年人腸道中的微生物主要隸屬于硬壁菌門（Firmicutes），而嬰兒的主要為變形菌門（Proteobacteria），克雷白氏桿菌屬（Klebsiella）為多數(shù)嬰兒腸道中的優(yōu)勢細(xì)菌屬，而非以往文獻(xiàn)報(bào)道的雙歧桿菌（Bifidobacterium）。上述結(jié)果表明，嬰兒腸道菌群群落結(jié)構(gòu)明顯不同于中青年人，但中青年人腸道菌群群落結(jié)構(gòu)相似，同時(shí)嬰兒腸道菌群群落結(jié)構(gòu)個(gè)體之間的差異要顯著大于青年人和中年人。 （2）本部分研究選取28例西藏那曲縣境內(nèi)那曲草原的牧民和15例拉薩的城市居民的糞便樣品樣品作為研究對(duì)象，以454焦磷酸測序技術(shù)結(jié)合多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)方法檢測細(xì)菌16S rRNA基因V5-V6區(qū)的多樣性。雖然基于UniFrac的PcoA分析和UPGMA分析均顯示兩個(gè)人群的樣本存在交疊現(xiàn)象，但MANOVA分析顯示其腸道菌群群落結(jié)構(gòu)差異顯著（P 0.05）。雖然藏族城市居民腸道菌群的多樣性和豐度大于藏區(qū)居民，但藏區(qū)居民組內(nèi)平均UniFrac距離大于城市居民（P 0.05）。利用偏最小二乘判別分析（Partial least squares discrimination analysis, PLS-DA），我們找出了212個(gè)在兩類居民腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異中最為關(guān)鍵的分類操作單元（Operational taxonomic units，OTU），其中逾1/4的OTUs被鑒定為具有短鏈脂肪酸產(chǎn)生功能的勞特氏菌屬（Blautia）、梭菌屬（Clostridium）、考拉桿菌屬（Phascolarctobacterium）、羅斯氏菌屬（Roseburia）和罕見小球菌屬（Subdoligranulum），且其在城市居民中含量顯著高于藏區(qū)牧民。上述結(jié)果表明，在城市和藏區(qū)生活的藏族居民其腸道菌群結(jié)構(gòu)是不同的，生活方式對(duì)人腸道菌群構(gòu)成有顯著影響作用。 （3）本部分研究選取22例在烏魯木齊生活的維吾爾族居民和21例哈薩克族居民的糞便樣品樣品作為研究對(duì)象，以454焦磷酸測序技術(shù)結(jié)合多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)方法檢測細(xì)菌16S rRNA基因V5-V6區(qū)的多樣性。雖然基于UniFrac的PcoA分析和UPGMA分析均顯示兩個(gè)人群的樣本存在交疊現(xiàn)象，但MANOVA分析顯示其腸道菌群群落結(jié)構(gòu)差異顯著（P 0.05）。雖然維吾爾族居民腸道菌群的多樣性和豐度大于哈薩克族居民，但哈薩克族居民組內(nèi)平均UniFrac距離大于城市居民（P 0.05）。利用偏最小二乘判別分析（Partial least squares discrimination analysis, PLS-DA），我們找出了69個(gè)在兩類居民腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異中最為關(guān)鍵的分類操作單元（Operational taxonomic units，OTU），其中近1/3的OTUs被鑒定為具有短鏈脂肪酸產(chǎn)生功能的梭菌屬（Clostridium）、羅斯氏菌屬（Roseburia）、布勞特氏菌屬（Blautia）、罕見小球菌屬（Subdoligranulum）、棲糞桿菌屬（Faecalibacterium）、擬桿菌屬（Bacteroides）和多爾氏菌屬（Dorea），且其在維吾爾族居民中含量偏高。上述結(jié)果表明，維吾爾族和哈薩克族居民腸道菌群結(jié)構(gòu)是不同的，基因型對(duì)人腸道菌群構(gòu)成有顯著影響作用。 （4）將前三部分研究中所涉及的漢族、維吾爾族、哈薩克族及藏族青年居民的樣品進(jìn)行合并分析，研究發(fā)現(xiàn)所有92個(gè)健康居民腸道均含有的細(xì)菌屬為11個(gè)，包括普氏菌屬（Prevotella）、擬桿菌屬（Bacteroides）、考拉桿菌屬（Phascolarctobacterium），羅斯氏菌屬（Roseburia），布勞特氏菌（Blautia），棲糞桿菌屬（Faecalibacterium）、梭菌屬（Clostridium），罕見小球菌屬（Subdoligranulum），瘤胃球菌屬（Ruminococcus），糞球菌屬（Coprococcus）和韋榮球菌屬（Veillonella）。通過基于Manova分析的各民族樣品馬爾距離聚類分析發(fā)現(xiàn)各民族居民腸道菌群群落差異顯著。為了進(jìn)一步分析各民族特有的OTU，我們假設(shè)若一個(gè)OTU在一個(gè)或者多個(gè)民族居民的檢出率小于5%（若樣品數(shù)小于20則檢出率取0），而在其余一個(gè)或者多個(gè)民族的檢出率大于67%，則認(rèn)為該OTU為能將各民族居民腸道菌群區(qū)分開的關(guān)鍵OTU（key OTU）。結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同民族居民腸道菌群具有其特有或缺失的OTUs，哈薩克族和維吾爾族居民其特有的OTUs主要來自于擬桿菌屬（Bacteroides）、羅斯氏菌屬(Roseburia)和考拉桿菌屬（Phascolarctobacterium），然而漢族和藏族居民其特有OTUs主要為勞特氏菌(Blautia)和普氏菌屬（Prevotella）細(xì)菌。因此我們可以初步推斷納入本部分研究的92個(gè)健康青年人共有少數(shù)相同的腸道菌群。 （5）經(jīng)薈萃分析發(fā)現(xiàn)，口服益生乳酸菌及其發(fā)酵乳制品具有降低受試者血漿總膽固醇和LDL膽固醇的作用，而對(duì)HDL膽固醇和甘油三酯無影響。服用菊粉對(duì)高脂血癥患者具有降低其血清總膽固醇和LDL膽固醇的作用，而對(duì)HDL膽固醇和甘油三酯無影響，此外菊粉對(duì)健康居民血脂無調(diào)節(jié)作用。
【學(xué)位單位】：江南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位年份】：2013
【中圖分類】：R378;Q78
【部分圖文】：

[82]。本研究中盡管依據(jù)當(dāng)前的測序量每個(gè)樣品的稀疏曲線（rarefaction curve）依舊不能進(jìn)入平臺(tái)期（圖2-1），但是香農(nóng)多樣性曲線已經(jīng)飽和（圖2-2）。上述現(xiàn)象表明，盡管隨著測序量的增加新的種系型可能會(huì)被發(fā)現(xiàn)，但是微生物的多樣性已經(jīng)不再隨之發(fā)生變化了。

香農(nóng)指數(shù)圖

但是研究發(fā)現(xiàn)若干因素可能會(huì)對(duì)其豐度和多樣性產(chǎn)生影及炎性腸病（inflammatory bowel disease）均能降低腸道菌群的生菌制劑可以增加腸道菌群的多樣性[93]。同時(shí)有研究表明全球品添加劑的工業(yè)化無污染食品均可降低人腸道菌群的多樣性[56]元統(tǒng)計(jì)方法的嬰兒、青年及中年人腸道菌群群落結(jié)構(gòu)的比較分
【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2880256