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杭州地區(qū)傷寒及甲型副傷寒沙門菌流行菌株分子特征的研究

發(fā)布時間:2020-06-28 04:00
【摘要】:目的傷寒、甲型副傷寒是一種急性消化道傳染病,傳染源為病人及帶菌者,傳播途徑主要為糞-口傳播,人群普遍易感。其病原體為傷寒沙門菌及甲型副傷寒沙門菌。近年來杭州地區(qū)發(fā)生了多起傷寒、甲型副傷寒的暴發(fā)與流行,已成為嚴重的公共衛(wèi)生問題。本課題旨在通過研究2002~2008年杭州地區(qū)傷寒沙門菌、甲型副傷寒沙門菌優(yōu)勢菌株的分子特征,為傳染源的溯源提供實驗室線索,為有效地干預(yù)控制傷寒、甲型副傷寒的發(fā)生提供依據(jù)。 方法1.采用脈沖場凝膠電泳分型(PFGE)、多位點串聯(lián)重復(fù)序列分析(MLVA)、多位點序列分型(MLST)三種分型方法對杭州地區(qū)31株傷寒沙門菌進行分子分型,并進行藥敏試驗。2.對杭州地區(qū)2002-2008年分離到的404株甲型副傷寒沙門菌進行PFGE分型和藥敏試驗。3.將八株非傷寒沙門菌應(yīng)用與傷寒沙門菌一致的擴增條件在TR1、TR2、TR3、Sa102這4個位點進行PCR。4.應(yīng)用PFGE和MLST方法對生化、血清鑒定有分歧的沙門菌進行鑒定。 結(jié)果1.131株傷寒沙門菌可分為14個PFGE型,28個MLVA型,3個MLST型,6個耐藥型;31株傷寒沙門菌在TR1、TR2、TR3、Sa102這4個VNTR位點表現(xiàn)出多態(tài)性,在其余18個VNTR位點均未表現(xiàn)出多態(tài)性;3個MLST型中ST1型7株,ST2型23株,ST3型1株。1.22株在TR3位點重復(fù)序列拷貝數(shù)為2.3的傷寒沙門菌在TR3位點重復(fù)序列的5’上游的側(cè)翼序列分別有61bp(重復(fù)序列的5’上游的側(cè)翼序列53-113bp)和340bp(重復(fù)序列的5’上游的側(cè)翼序列1-340bp)的堿基缺失導(dǎo)致TR3位點擴增的目的片段的大小與串聯(lián)重復(fù)序列的拷貝數(shù)不呈正相關(guān)。2404株甲型副傷寒沙門菌可分為6個PFGE型和4個耐藥型,P1型和P2型屬于同一個克隆系,該克隆系菌株占試驗菌株數(shù)的99%,分離自臨安市的310株菌均為P1型,分離自西湖區(qū)的主要菌型是P2型和P1型。3八株非傷寒、甲型副傷寒沙門菌在TR1、TR2、TR3、Sa102這四個位點均未表現(xiàn)出多態(tài)性。4三株生化、血清鑒定有分歧的沙門菌PFGE圖譜與腸炎沙門菌標準株CMCC10022比較分別只有4條和2條條帶的差異,與甲型副傷寒沙門菌標準株CMCC50001的圖譜完全不同。三株菌與腸炎沙門菌標準株CMCC10022的MLST型別均為ST11型,在MLST數(shù)據(jù)庫中,該型的菌株均為腸炎沙門菌,甲型副傷寒沙門菌標準株CMCC50001的MLST型別為ST85型。 結(jié)論近年杭州地區(qū)甲型副傷寒疫情由同一克隆系菌株感染所致,但本地區(qū)流行的傷寒沙門菌株呈現(xiàn)高度多樣性。呈高度多態(tài)性的可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)位點TR1、TR2、Sa102可作為本地區(qū)傷寒沙門菌株的檢測標志?梢岳梅肿臃中图夹g(shù)來協(xié)助鑒定通過表型鑒定難以區(qū)分的沙門菌。
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R378.22

【參考文獻】

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本文編號:2732526

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