【摘要】:目的了解桂西北地區(qū)巴馬瑤族自治縣人芽囊原蟲(Blastocystis hominis,B.h)的感染情況;對該地區(qū)105例B.h分離株的進(jìn)行診斷性基因型分型及RAPD分析。 方法隨機(jī)抽取巴馬瑤族自治縣的5個(gè)行政村,收集當(dāng)?shù)鼐用竦男迈r糞便,采有改良酸醚離心沉淀法,鏡檢定性診斷,用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)分析不同調(diào)查點(diǎn)、性別、職業(yè)、年齡和民族人群芽囊原蟲感染情況。從B.h陽性糞便中分離出蟲體,體外培養(yǎng)后提取基因組DNA。先采用已知的7對STS引物對基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增進(jìn)行診斷性基因分型;再應(yīng)用RAPD標(biāo)記技術(shù)對分離株構(gòu)建DNA圖譜,然后分別用NTSYSpc和Popgene兩種軟件對分離株的遺傳多樣性進(jìn)行聚類分析,并分別構(gòu)建聚類分析圖;最后將STS診斷性基因分型與RAPD的結(jié)果進(jìn)行比較分析。 結(jié)果共檢查497例,人芽囊原蟲感染者215例,平均感染率43.26%。各行政村的感染率中,最高達(dá)55.74%,最低為32.14%。各性別、職業(yè)、年齡和民族間感染率差別均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。以已知的7對STS引物作基因型鑒定,發(fā)現(xiàn)單純1型25株,占23.81%(25/105);單純6型1株,占0.95%(1/105);混合型1株,為1型與6型的混合基因型,占0.95%(1/105)。未檢出其余基因型,其余為未知基因型,占75.24%(79/105)。對所有B.h分離株構(gòu)建RAPD圖譜,共檢測到112個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),片段大小在300-3400bp之間。聚類分析結(jié)果顯示了105個(gè)分離株的遺傳分化關(guān)系,地理分布相同的分離株遺傳距離小。按地理分布將分離株劃分為五個(gè)群體,其多態(tài)性位點(diǎn)所占比例分別為:91.07%、23.21%、83、04%、84.82%和81.25%;五個(gè)行政村群體中,Nei’s多樣性指數(shù)為0.1161±0.2120-0.2923±0.1739,shannon's多樣性指數(shù)為0.1609±0.2940-0.4417±0.2297。群體間遺傳多態(tài)性指數(shù)Ht為0.3287±0.0197,群體內(nèi)遺傳多態(tài)性指數(shù)Hs為0.2461±0.0146。五個(gè)行政村群體遺傳分化指數(shù)(Gst)為0.0573-0.2573,其中巴馬鎮(zhèn)盤當(dāng)村與鳳凰鄉(xiāng)德納村的遺傳分化指數(shù)最大為0.2573,說明兩者之間的發(fā)生了較大的遺傳變異,而燕洞鄉(xiāng)龍威村與甲篆鄉(xiāng)興仁村的分化指數(shù)最小,為0.0529;由五個(gè)行政村的聚類分析圖可以看出:五個(gè)行政村的系統(tǒng)樹只有一個(gè)分支,親緣關(guān)系很近。燕洞鄉(xiāng)龍威村與甲篆鄉(xiāng)興仁村先聚在一起,再與西山鄉(xiāng)福厚村聚類,然后再一起與巴馬鎮(zhèn)盤當(dāng)村聚類,最后與鳳凰鄉(xiāng)德納村聚類。 結(jié)論(1)廣西巴馬瑤族自治縣不同人群人芽囊原蟲感染率高達(dá)43.26%,屬于高度流行區(qū)之一。(2)巴馬瑤族自治縣存在1和6兩種已知基因型B.h,并存在混合感染情況。(3)在已知基因型中也存在不同蟲株間的差異,提示可能存在亞基因型。(4)發(fā)現(xiàn)數(shù)量眾多的未知基因型蟲株,它們之間遺傳差異明顯,基因結(jié)構(gòu)復(fù)雜,至少存在11個(gè)以上的類群。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R382
【參考文獻(xiàn)】
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2564467
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