【摘要】：目的應用計算機在線預測軟件分析細粒棘球絳蟲AgB5抗原蛋白的二級結(jié)構(gòu),預測其可能形成的B細胞表位和T細胞表位,為研制安全、高效的新型包蟲病基因疫苗奠定基礎,也為包蟲病的免疫學治療提供新的理論依據(jù)。方法采用計算機在線預測軟件SOPMA對細粒棘球絳蟲AgB5抗原蛋白的二級結(jié)構(gòu)進行預測和分析;采用LEPS和ABC Pred網(wǎng)絡軟件結(jié)合其表面特性、親水性、柔韌性、可及性、可塑性等對其B細胞表位進行預測和分析;采用IEBD和SYFPEITHI在線軟件對細粒棘球絳蟲AgB5抗原蛋白的MHC-I類HLA-A 0201限制性T細胞表位進行預測和分析。結(jié)果采用計算機在線預測軟件預測細粒棘球絳蟲AgB5抗原蛋白的二級結(jié)構(gòu)中α螺旋結(jié)構(gòu)占76.47%,β-折疊占5.88%,無規(guī)則卷曲占17.65%。結(jié)合其表面特性、親水性、柔韌性、可及性以及可塑性等分析得出分值較高的3個B細胞表位區(qū)域,分別為:6~14、28~33和48~52氨基酸序列,較易形成B細胞表位;通過MHC-I類HLA-A 0201限制性T細胞表位分析得出分值較高的4個T細胞表位區(qū)域,分別為:9~13、24~29、38~45和51~59氨基酸序列,較易形成T細胞表位。結(jié)論通過生物信息網(wǎng)絡技術方法分析確定細粒棘球絳蟲AgB5抗原蛋白分別存在3個B細胞抗原表位和4個T細胞抗原表位,可為細粒棘球絳蟲AgB抗原性研究和高效表位疫苗研發(fā)提供參考,為臨床包蟲病的免疫診斷、藥物治療提供新的靶標。
[Abstract]:Objective to analyze the secondary structure of AgB5 antigen protein of Echinococcus granulosus by computer online prediction software, and to predict the B cell epitopes and T cell epitopes that may be formed, so as to lay a foundation for the development of a safe and efficient new type of echinococcosis gene vaccine, and to provide a new theoretical basis for immunological treatment of echinococcosis. Methods the secondary structure of AgB5 antigen protein of Echinococcus granulosus was predicted and analyzed by computer online prediction software SOPMA, and the B cell epitopes of Echinococcus granulosus were predicted and analyzed by LEPS and ABC Pred network software combined with its surface characteristics, hydrophilicity, flexibility, accessibility and plasticity. The MHC-I class HLA-A 0201 restricted T cell epitopes of Echinococcus granulosus AgB5 antigen protein were predicted and analyzed by IEBD and SYFPEITHI online software. Results the secondary structure of AgB5 antigen protein of Echinococcus granulosus was predicted by computer online prediction software. The secondary structure of Echinococcus granulosus AgB5 antigen protein was 76.47%, 尾-fold 5.88% and irregular curl 17.65%. According to the analysis of its surface characteristics, hydrophilicity, flexibility, accessibility and plasticity, three B cell epitope regions with high score were obtained, which were 6: 14, 28 / 33 and 48 脳 52 amino acid sequences, which were easy to form B cell epitopes, and four T cell epitopes with higher scores were obtained by MHC-I HLA-A 0201 restricted T cell epitope analysis, which were 9: 13, 24 / 29, 38 / 45 and 51 / 59 amino acid sequences, which were easy to form T cell epitopes. Conclusion it is confirmed that there are three B cell epitopes and four T cell epitopes in AgB5 antigen protein of Echinococcus granulosus by bioinformation network technique, which can provide reference for the study of antigenicity of Echinococcus granulosus AgB and the development of high efficiency epitope vaccine, and provide a new target for clinical immune diagnosis and drug treatment of echinococcosis.
【作者單位】： 新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院 新疆重大疾病醫(yī)學重點實驗室-省部共建國家重點實驗室培育基地;新疆醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81260253,31160194,30960358,81160200,81060135) 新疆維吾爾自治區(qū)自然基金項目(No.2012211A304)
【分類號】：R383.33

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 鐘石根;阿根廷細粒棘球絳蟲的遺傳變異和流行病學[J];國外醫(yī)學(寄生蟲病分冊);2000年02期

2 單連玉;細粒棘球絳蟲成蟲分泌14-3-3蛋白[J];國外醫(yī)學(寄生蟲病分冊);2002年01期

3 林仁勇,丁劍冰,溫浩,張文寶,李君,盧曉梅;新疆株細粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段95抗原基因克隆及序列分析[J];中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志;2003年03期

4 陳潔;吾拉木·馬木提;;犬感染細粒棘球絳蟲的診斷研究進展及展望[J];新疆醫(yī)科大學學報;2011年03期

5 樂文菊;;吡哇酮和鹽酸丁萘脒殺細粒棘球絳蟲卵的作用[J];國外醫(yī)學(寄生蟲病分冊);1980年01期

6 黃嬌英;細粒棘球絳蟲感染和惡性腫瘤[J];癌癥;1982年02期

7 薛弘燮;傅玉才;吳炳洪;葉瑛;陸憲和;;新疆吉木乃縣犬腸寄生蟲調(diào)查及細粒棘球絳蟲蟲株探討[J];新疆醫(yī)學院學報;1985年03期

8 張志仁;細粒棘球絳蟲在體外補體介導溶解中的連續(xù)形態(tài)變化[J];國外醫(yī)學(寄生蟲病分冊);1986年01期

9 曹巖;;肯尼亞狒狒實驗感染駝駱、牛、綿羊、山羊細粒棘球絳蟲的研究[J];地方病譯叢;1987年04期

10 楊峻瑛;;利比亞犬中的細粒棘球絳蟲感染[J];地方病譯叢;1987年04期

相關會議論文 前10條

1 王穎旺;楊光友;蔣忠榮;鄧仕金;;細粒棘球絳蟲基因型與抗原研究進展[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜寄生蟲學分會第六次代表大會暨第十次學術研討會論文集[C];2009年

2 張旭;古努爾·吐爾遜;米曉云;石保新;巫劍;趙莉;阿布力克木;張玲;丁曉玲;阿布力茲;李國慶;卡那提拜克·開比熱;張壯志;;抗體夾心ELISA試驗檢測犬細粒棘球絳蟲糞抗原方法的建立[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜寄生蟲學分會第六次代表大會暨第十一次學術研討會論文集[C];2011年

3 張文寶;張壯志;石保新;李軍;古麗努爾;由弘;吐爾洪;哈斯也提;王進成;;犬抗細粒棘球絳蟲感染的免疫效果初試[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜寄生蟲學分會第九次學術研討會論文摘要集[C];2006年

4 張文寶;張壯志;石寶新;李軍;古麗努爾;由弘;吐爾洪;哈斯也提;王進成;;犬抗細粒棘球絳蟲感染的免疫效果初試[A];全國人畜共患病學術研討會論文集[C];2006年

5 石保新;張壯志;王進成;李欣;雒燕;張文寶;;愛普銳克-食肉動物自動吞食片對犬細粒棘球絳蟲驅(qū)除試驗[A];第二屆全國人畜共患病學術研討會論文集[C];2008年

6 李文桂;周必英;;細粒棘球絳蟲重組Bb-Eg95-EgA31疫苗誘導小鼠免疫應答的研究[A];中華醫(yī)學會第五次全國艾滋病、病毒性丙型肝炎暨全國熱帶病學術會議論文匯編[C];2011年

7 張亞樓;溫浩;馬旭東;苗玉清;陳雪鴻;;家犬糞便中的細粒棘球絳蟲PCR檢測方法的建立[A];全國人畜共患病學術研討會論文集[C];2006年

8 張文寶;李軍;由弘;張壯志;古努爾·吐爾遜;AlexLoukasa;DonaldP.McManusa;;表達細粒棘球絳蟲成蟲不同發(fā)育階段的基因家族[A];全國人畜共患病學術研討會論文集[C];2006年

9 巫劍;張壯志;石保新;張文寶;王進成;古努爾;岳城;張旭;;細粒棘球絳蟲感染犬及EgM9蛋白免疫犬引起的免疫應答研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜寄生蟲學分會第六次代表大會暨第十一次學術研討會論文集[C];2011年

10 米曉云;袁麗英;張壯志;石保新;阿布都;阿依努爾;張玲;阿布里克木;王進成;岳城;張文寶;;細粒棘球絳蟲——原頭蚴在兩種細胞培養(yǎng)液中體外培養(yǎng)[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學分會成立大會暨第一次學術研討會論文集[C];2008年

相關重要報紙文章 前2條

1 記者 胡德榮;我學者破譯細粒棘球絳蟲基因密碼[N];健康報;2013年

2 四川疾病預防控制中心寄生蟲病預防控制所所長 邱東川　記者 陳永杰;城市寵物不易傳染“包蟲病”[N];北京科技報;2012年

相關博士學位論文 前3條

1 馬秀敏;新疆細粒棘球絳蟲基因多態(tài)性及實驗診斷學研究[D];新疆醫(yī)科大學;2007年

2 王瑩;細粒棘球絳蟲排泄分泌抗原免疫學特征及功能研究[D];中國疾病預防控制中心;2012年

3 周必英;細粒棘球絳蟲重組Bb-Eg95-EgA31疫苗構(gòu)建及其免疫機制研究[D];重慶醫(yī)科大學;2010年

相關碩士學位論文 前10條

1 王絢;細粒棘球絳蟲果糖二磷酸醛縮酶的生物信息學分析及其表達、純化和酶活性的檢測[D];蘭州大學;2013年

2 賈海英;細粒棘球絳蟲pET30a-EgA31-Eg95重組質(zhì)粒構(gòu)建及鑒定[D];新疆醫(yī)科大學;2009年

3 肖云峰;細粒棘球絳蟲原頭蚴在青蒿素干預下的基因轉(zhuǎn)錄譜分析[D];新疆醫(yī)科大學;2014年

4 李君良;細粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學研究及生物信息學分析[D];寧夏醫(yī)科大學;2013年

5 王慧;細粒棘球絳蟲硫氧還蛋白過氧化物酶基因的克隆、表達及鑒定[D];新疆大學;2008年

6 張立民;細粒棘球絳蟲基因工程疫苗候選分子EgA31的原核表達及免疫學鑒定[D];汕頭大學;2003年

7 巫劍;細粒棘球絳蟲感染犬及EgM9蛋白免疫犬引起的免疫應答研究[D];新疆農(nóng)業(yè)大學;2010年

8 朱佑明;細粒棘球絳蟲重組BCG-Eg95疫苗構(gòu)建及其免疫機制研究[D];重慶醫(yī)科大學;2006年

9 巨艷;細粒棘球絳蟲原頭蚴mRNA測序及表達譜分析[D];寧夏醫(yī)科大學;2013年

10 朱明星;細粒棘球絳蟲原頭蚴mRNA測序及生物信息學分析[D];寧夏醫(yī)科大學;2013年

，

本文編號：2514538