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A群輪狀病毒TaqMan RT-PCR檢測(cè)方法的建立

發(fā)布時(shí)間:2018-12-17 22:10
【摘要】:目的建立以特異性熒光探針為特點(diǎn)的Taqman熒光定量RT-PCR方法,對(duì)輪狀病毒A群核酸進(jìn)行檢測(cè)。方法根據(jù)輪狀病毒A群基因組保守序列設(shè)計(jì)引物和探針,建立并分析TaqMan RT-PCR的重復(fù)性、特異性、敏感性;以所建立的方法對(duì)128例病毒性腹瀉患者糞便標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),同時(shí)以基因測(cè)序進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果所建立的TaqMan RT-PCR檢測(cè)方法對(duì)輪狀病毒A群具有很好的特異性和重復(fù)性,靈敏度達(dá)到101拷貝/μl。128例糞便標(biāo)本中,輪狀病毒A群的檢出率為18.0%,與基因測(cè)序比對(duì)結(jié)果相符。結(jié)論構(gòu)建的輪狀病毒A群TaqMan RT-PCR檢測(cè)方法快速、特異且靈敏,可用于臨床病原診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
[Abstract]:Objective to establish a Taqman fluorescence quantitative RT-PCR method based on specific fluorescence probe to detect rotavirus group A nucleic acid. Methods Primer and probe were designed according to the conserved sequence of rotavirus A genome to establish and analyze the repeatability, specificity and sensitivity of TaqMan RT-PCR. The fecal specimens of 128 patients with viral diarrhea were detected by the established method and verified by gene sequencing. Results the TaqMan RT-PCR method was specific and reproducible to rotavirus group A, and the sensitivity reached 101 copies / 渭 l.128 fecal specimens. The detection rate of rotavirus group A was 18.0%. The results were consistent with the results of gene sequencing. Conclusion the constructed method for detecting rotavirus group A TaqMan RT-PCR is rapid, specific and sensitive, and can be used for clinical diagnosis and epidemiological investigation.
【作者單位】: 湖州市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:湖州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013GY15)
【分類(lèi)號(hào)】:R373

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2384863

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