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我國不同地域煙曲霉臨床分離株基因型分析

發(fā)布時間:2018-12-12 06:07
【摘要】:背景:近年來,隨著院內(nèi)嚴(yán)重免疫缺陷患者數(shù)量的增加,侵襲性曲霉病已成為血液病房、器官移植中心及重癥監(jiān)護病房患者死亡的主要原因,曲霉已成為僅次于念珠菌的一個重要的致病菌。而在致病曲霉中煙曲霉(A.fumigatus)是最主要的致病菌。由于不同國家和地區(qū)存在不同的優(yōu)勢致病菌株,采用分子系統(tǒng)學(xué)的方法對各個地區(qū)的致病煙曲霉進行研究有助于確定致病株流行特征與曲霉種群的關(guān)系。目的:1)以我國北京、上海、福建及河北臨床分離到的煙曲霉為研究對象,分別通過形態(tài)學(xué)、鏡下特點、溫度試驗及β-tubulin分子生物學(xué)方法鑒定后,再對煙曲霉進行CSP基因分型,從而了解我國不同地域致病煙曲霉臨床分離株分布情況。2)檢測臨床分離到的煙曲霉對不同抗真菌藥物的體外敏感性,為臨床治療和采取預(yù)防措施提供有意義的線索和指導(dǎo),并比較不同基因型之間及不同地區(qū)之間的煙曲霉的體外抗真菌藥物敏感性是否有差異。 方法:本研究對我國北京、上海、福建及河北收集到的112株煙曲霉臨床分離株分別進行形態(tài)學(xué)、溫度試驗及分子生物學(xué)測序鑒定后,再對煙曲霉進行細(xì)胞表面蛋白(Cell surface protein,CSP)基因分型。本研究所用到的形態(tài)學(xué)方法主要包括觀察培養(yǎng)菌落形態(tài)、培養(yǎng)后經(jīng)乳酸酚棉蘭染色鏡檢。溫度試驗:將通過形態(tài)學(xué)方法初步鑒定出的煙曲霉菌株點植于馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(Potato dextroseagar,PDA)上分別置于48℃、45℃、42℃及37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3-7天,觀察菌落是否生長,從而鑒定至不同的分支。本研究采用玻璃珠破壁、酚-氯仿-異戊醇抽提法提取基因組DNA,然后對β-tubulin進行PCR擴增,并對該區(qū)進行測序,應(yīng)用mega5.0軟件對測序所得DNA堿基序列進行編輯,與Genbank數(shù)據(jù)庫中的序列比對,以此鑒定曲霉菌種,最后對鑒定出的煙曲霉進行CSP基因分型,從而了解我國不同地域致病煙曲霉臨床株分布情況。同時參照2003年美國臨床實驗室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(National committee for clinical laboratory standards,NCCLS)制定的產(chǎn)孢絲狀真菌抗真菌藥物敏感性試驗方案(M38-A)測定伏立康唑、伊曲康唑及兩性霉素B對煙曲霉的最低抑菌濃度(Minimal InhibitoryConcentration,MIC),以探討不同基因型煙曲霉與抗真菌藥物的敏感性關(guān)系,同時比較不同地區(qū)的煙曲霉對抗真菌藥物的敏感性是否有差異。 結(jié)果:112株臨床分離到的曲霉菌株在PDA的菌落特征和顯微鏡下特征均符合煙曲霉特征,所有菌株在48℃均能生長,并經(jīng)β-tubulin測序,與Genbank中多株煙曲霉序列相比呈98%以上一致性,表明都為經(jīng)典煙曲霉。經(jīng)典煙曲霉經(jīng)CSP引物擴增后均生成單一條帶約610bp,采用國際標(biāo)準(zhǔn)化命名體系進行CSP分型,共分為11個基因型,較多為t04A, t03和t01,其中1個為新型。對新發(fā)現(xiàn)的基因型菌株進行生物學(xué)特性的深入研究發(fā)現(xiàn)其菌落形態(tài)、生長速度、最適生長溫度與其他菌株并無顯著差別。同時發(fā)現(xiàn)福建有12株t10型,另外僅上海和北京各發(fā)現(xiàn)一株t10型。7種不同基因型煙曲霉對伏立康唑、伊曲康唑及兩性霉素B的敏感性差異無統(tǒng)計學(xué)意義,而我國南方地區(qū)與北方地區(qū)臨床分離到的煙曲霉對伊曲康唑的敏感性有統(tǒng)計學(xué)意義。 結(jié)論:我國不同地域致病煙曲霉的基因型存在地域差異,t10型主要在南方氣候較暖地區(qū)居多,提示了t10型可能在亞熱帶地區(qū)常見。不同基因型的煙曲霉對抗真菌藥物的敏感性無統(tǒng)計學(xué)意義,,但我國南方地區(qū)與北方地區(qū)臨床分離到的煙曲霉對伊曲康唑的敏感性存在差異。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R379

【參考文獻】

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本文編號:2374063

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