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中國少數(shù)民族基因組DNA樣本庫的建立和CYP2D6在維吾爾族人群的多態(tài)性分布

發(fā)布時間:2018-11-14 21:14
【摘要】:[目的與意義] 隨著中國社會政治和經(jīng)濟的發(fā)展,各民族融合日益加劇,純系少數(shù)民族遺傳資源日漸珍貴。特別是少數(shù)民族遺傳資源外流初露端倪,亟需加大少數(shù)民族遺傳資源的保護工作。故此,我們建立包含中國56個民族遺傳信息的大樣本的基因組DNA樣本庫,以充分保存和保護現(xiàn)有的遺傳資源。這些遺傳資源可以為人類提供種族的起源,進化及遷徙等信息,同時對于開展基于遺傳因素的藥效學(xué)和藥物代謝動力學(xué),甚至一些遺傳疾病發(fā)生機制的研究有極重要的意義。 近年來,遺傳藥理學(xué)的研究成為了醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究的熱點,尤其是遺傳因素與藥物不良反應(yīng)的發(fā)生之間的研究,世界各國都給予了不同程度的關(guān)注和重視。 藥物代謝酶的多態(tài)性的存在,是導(dǎo)致藥物藥效和不良反應(yīng)個體差異的主要原因。我國各少數(shù)民族人群均有自己獨特的遺傳特質(zhì),勢必會導(dǎo)致同一藥物在不同民族人群產(chǎn)生不同的療效,甚至發(fā)生不良反應(yīng)。因此,了解各民族藥物代謝水平的差異是優(yōu)化治療劑量,減少藥物不良反應(yīng)以及推廣少數(shù)民族傳統(tǒng)藥物的關(guān)鍵因素之一。 有分析顯示,由P450的多態(tài)性造成的不良反應(yīng)占藥物不良反應(yīng)總數(shù)的86%。細(xì)胞色素P4502D6 (CYP2D6)是一種重要的最具多態(tài)性的藥物代謝酶之一,代謝了臨床上約20-30%的藥物,由CYP2D6的多態(tài)性導(dǎo)致的藥物不良反應(yīng)和藥物代謝差異已有較多的報道。 本研究旨在建立中國少數(shù)民族基因組DNA樣本庫,保護現(xiàn)有少數(shù)民族遺傳資源基礎(chǔ)上,利用維吾爾族基因組DNA樣本庫,通過現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù),對藥物代謝酶基因CYP2D6在維吾爾族人群中的多態(tài)性分布規(guī)律進行了檢測,為今后對該基因在維吾爾族中的代謝活性差異研究提供強有力的科學(xué)依據(jù)。 [研究方法] 在中央民族大學(xué)新入學(xué)學(xué)生中,通過調(diào)查問卷,詢問三代內(nèi)民族情況的方法,篩選三代以內(nèi)無外族通婚史的少數(shù)民族健康成年人,在知情同意的原則下,按照臨床采血標(biāo)準(zhǔn)進行采血,通過非離心柱法提取全血基因組DNA。按照人類遺傳資源標(biāo)準(zhǔn)編碼統(tǒng)一編號,并通過瓊脂糖凝膠電泳及紫外分光光度計測定,剔除斷裂及降解的DNA,剔除純度較低樣本,超低溫保存,建立了中國少數(shù)民族基因組DNA樣本庫。 在此基礎(chǔ)上,通過分段克隆的方法,克隆CYP2D6全基因及其9個外顯子序列。通過直接測序法對各樣本進行了序列測定,利用DNAMAN, Primer5.0等生物學(xué)軟件,對測序結(jié)果進行了生物信息學(xué)分析。檢測了CYP2D6編碼序列在維吾爾族人群中的SNP及單倍體型分布頻率。 [研究結(jié)果] 1.中國少數(shù)民族DNA樣本庫的建立 已經(jīng)建成的DNA樣本庫目前包括朝鮮族、蒙古族、傣族、哈薩克族、維族、苗族、回族、藏族、土家族、彝族、侗族、羌族、壯族、瑤族、德昂族、納西族、錫伯族、白族、柯爾克孜滿族、哈尼族、布依族、仡佬族、畬族、黎族、水族、阿昌族、漢族、烏孜別克族、裕固族等30多個民族的765個基因組DNA樣本。 2.CYP2D6在中國維吾爾族人群中的多態(tài)性分布 我們在中國維吾爾族人群中篩查到13個未報導(dǎo)的等位基因型和2個已報導(dǎo)的等位基因型。13個未報導(dǎo)的等位基因的在中國維吾爾族人群中的分布頻率介于5%到10%之間。已報導(dǎo)的等位基因分別是CYP2D6*2和CYP2D610D,它們的分布頻率分別為10%和15%。 [結(jié)論] 1.初步建成中國少數(shù)民族基因組DNA樣本庫。 2.CYP2D6基因在中國維吾爾族人群的多態(tài)性分布頻率與該基因在漢族及已報導(dǎo)的其他民族中的分布特點存在顯著差異。
[Abstract]:[Purpose and significance] With the development of China's social and political and economic development, the integration of all ethnic groups is increasing, and the genetic resources of the pure ethnic minorities are becoming more and more Precious. In particular, the outflow of the genetic resources of the minority nationalities is out of the way, and it is urgent to increase the protection of the genetic resources of the minority nationalities Therefore, we have set up a library of genomic DNA samples containing a large sample of 56 national genetic information in China to fully preserve and protect the existing genetic Resources. These genetic resources can provide information on the origin, evolution and migration of the human race, and it is very important to conduct research on the dynamics of genetic factors and the dynamics of drug metabolism, even some of the mechanisms of genetic disease In recent years, the research of genetic pharmacology has become a hot spot in the field of medicine, especially between the genetic factors and the occurrence of adverse drug reactions, and all the countries of the world have given different degrees. Attention and attention. The existence of the polymorphism of the drug metabolizing enzyme is the drug effect and the adverse reaction. The main cause of the body difference is that all ethnic groups in our country have their own unique genetic characteristics, which will lead to different curative effects of the same drug in different ethnic groups. There is even an adverse reaction. Therefore, it is understood that the difference in the drug metabolism level of each ethnic group is to optimize the treatment dose, reduce the adverse reaction of the drug, and promote the traditional medicine of the ethnic minority. One of the key factors in the study. The analysis shows that the adverse reaction caused by the polymorphism of the P450 The total number of adverse reactions is 86%. Cytochrome P4502D6 (CYP2D6) is an important one of the most polymorphic drug metabolizing enzymes, metabolizes about 20-30% of the drug in clinic, and the drug reaction and drug caused by the polymorphism of CYP2D6 The main purpose of this study is to establish a library of genomic DNA of ethnic minorities in China, to protect the genetic resources of the existing minorities, and to use the DNA sample of the Uighur genome. By means of the modern molecular biology technology, the polymorphism distribution of the drug metabolizing enzyme gene CYP2D6 in the Uighur population is detected, and the metabolic activity of the gene in the Uygur population in the future is provided. differential research and supply A strong scientific basis.[Study Method] In the newly-enrolled students of the Central National University, through the questionnaire, the method of the three-generation internal-ethnic situation is asked, and the minority healthy adults who have no history of intermarriage within three generations are screened. Under the principle of consent, according to the clinical blood collection standard the whole blood genomic DNA is extracted by a non-centrifugal column method, the whole blood genomic DNA is coded according to the human genetic resource standard, In this paper, the genomic DNA sample library of China's national minorities is established. Methods The whole gene of CYP2D6 and its 9 exons were cloned. The samples were sequenced by direct sequencing, and the DNA MAN and Primer5 were used. Bioinformatics analysis of the results of the sequencing was carried out by the biological software such as 0. The coding of CYP2D6 was detected. The sequence is in the Uighur. SNPs in the family and the frequency of the haplotype distribution[Study Results] 1. The DNA sample library of China's national minority DNA sample library has been built, including Korean, Mongolian, Dai, Kazak and Uighur., the Miao, the Hui, the Tibetan, the Tujia, the Yi, the Dong, the Qiang, the Zhuang, the Chinese, the German, the Naxi, the Sibo, the Bai, the Kirk, the Manchu, the Hani, the Buyi, the family, the family, the family, the Li, the water, the Achang, 765 of more than 30 nationalities, such as the Han, the Uzbek, the Yugu, etc. Genomic DNA sample. 2. The polymorphism of CYP2D6 in the Chinese Uighur population. We screened 13 unreported allelic and 2 reported alleles in the Chinese Uighur population. genotype The distribution of 13 unreported alleles in the Chinese Uighur population ranged from 5% to 10%. The reported allele scores Don't be CY P2D6 * 2 and CYP2D610D, their distribution The frequency is 10% and 15%, respectively.[Conclusion] 1. The genomic DNA sample library of China's national minorities is preliminarily constructed. 2. CYP2D6
【學(xué)位授予單位】:中央民族大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號】:R394

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本文編號:2332335

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