【摘要】：目的為研究結(jié)核分枝桿菌RD1區(qū)編碼PE/PPE蛋白家族中的PE 35和PPE 68基因的多態(tài)性,并評(píng)估其基因多態(tài)性對(duì)免疫識(shí)別的影響。方法筆者從本實(shí)驗(yàn)室保存的來自國內(nèi)不同地區(qū)的2346株結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群臨床分離株中,選取代表不同Spoligotyping類型的161株臨床分離結(jié)核分枝桿菌菌株,基因擴(kuò)增后進(jìn)行序列比對(duì),比較其在T細(xì)胞抗原表位的差異。結(jié)果在161株菌株中,23株顯示有PE 35基因多態(tài)性,8株有PPE 68基因多態(tài)性。在PE 35基因中,除了菌株JL06018的突變外的其余突變都導(dǎo)致其T細(xì)胞抗原表位的改變。PPE 68基因中,62個(gè)T細(xì)胞表位中有58個(gè)(占93.5%)發(fā)生了改變。非北京家族PE 35基因的突變率明顯高于北京家族(P0.05),而PPE 68基因突變雖是非北京家族高于北京家族,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論 PE 35和PPE 68的編碼基因存在明顯的多態(tài)性,并很有可能導(dǎo)致蛋白功能的明顯改變。此外,這2個(gè)蛋白的人類T細(xì)胞表位是高度可變的,提示這2種蛋白可能通過參與分化選擇來逃避宿主免疫。北京家族可能比非北京家族更容易被宿主T細(xì)胞識(shí)別,進(jìn)而更容易傳播。
[Abstract]:Objective to study the polymorphism of PE 35 and PPE 68 genes in the PE/PPE protein family of Mycobacterium tuberculosis RD1 region and to evaluate the effect of the polymorphism on immune recognition. Methods from 2346 strains of Mycobacterium tuberculosis complex isolated from different regions in our laboratory, 161 clinical isolates representing different Spoligotyping types were selected and sequenced after gene amplification. The differences in T cell epitopes were compared. Results among 161 strains, 23 showed polymorphism of PE 35 gene and 8 showed polymorphism of PPE 68 gene. In the PE 35 gene, all the mutations except the mutation of strain JL06018 resulted in the alteration of T cell epitope. 58 (93.5%) of 62 T cell epitopes of the PPE 68 gene were changed. The mutation rate of PE 35 gene in non-Beijing family was significantly higher than that in Beijing family (P0.05), while the mutation rate of PPE 68 gene was higher in non-Beijing family than in Beijing family, but the difference was not statistically significant. Conclusion there are significant polymorphisms in the coding genes of PE 35 and PPE 68, which may lead to obvious changes in protein function. In addition, the human T cell epitopes of these two proteins are highly variable, suggesting that these two proteins may be involved in the selection of differentiation to avoid host immunity. Beijing families may be more easily identified by host T cells than non-Beijing families, and thus more easily transmitted.
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.81401647) 國家科技重大專項(xiàng)(No.2013ZX10003006,2013ZX10003002-001)~~
【分類號(hào)】：R378.911

【共引文獻(xiàn)】

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2 曾范利;王文玉;宋紀(jì)偉;時(shí)坤;李健明;劉東旭;劉楊;杜銳;;鹿結(jié)核分枝桿菌流行株Rv3874-Rv3875融合基因的克隆及原核表達(dá)[J];經(jīng)濟(jì)動(dòng)物學(xué)報(bào);2014年04期

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4 馬力通;李s，

本文編號(hào)：2282138