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細(xì)菌群體感應(yīng)信號(hào)分子合成酶AmbB的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2018-10-15 18:16
【摘要】:隨著臨床上抗生素的廣泛使用,細(xì)菌已出現(xiàn)耐藥性,因此尋找新的抗感染途徑已成為當(dāng)今研究的熱點(diǎn)。群體感應(yīng)(quorum sensing, QS)作為細(xì)菌間傳遞信號(hào)的重要方式,可釋放自誘導(dǎo)物分子來(lái)調(diào)控多種毒力因子的釋放以及細(xì)菌的致病性。如今,QS已經(jīng)成為新型、抗耐藥菌藥物設(shè)計(jì)的重要靶標(biāo),因該藥物不影響細(xì)菌生長(zhǎng)只抑制QS調(diào)控的致病行為,理論上不會(huì)引起細(xì)菌的耐藥性。 銅綠假單胞菌是一種可引起呼吸道感染、肺炎等疾病的條件致病菌,其存在三種基于信號(hào)分子的QS系統(tǒng):las、rhl和pqs系統(tǒng)。其中,las系統(tǒng)處于核心地位,它可以調(diào)控rhl和pqs的基因表達(dá)。但是,隨著對(duì)銅綠假單胞菌QS系統(tǒng)的深入研究發(fā)現(xiàn),las在群體感應(yīng)調(diào)節(jié)中的核心地位并不是絕對(duì)的。研究顯示非核糖體肽合成酶AmbB參與合成一種新型QS信號(hào)分子IQS,它在環(huán)境壓力下(如低磷環(huán)境)取代las進(jìn)而對(duì)rhl、pqs系統(tǒng)進(jìn)行調(diào)控。本論文擬通過(guò)生物化學(xué)的方法,結(jié)合X射線晶體學(xué)的研究手段對(duì)AmbB蛋白的C端結(jié)構(gòu)域進(jìn)行研究,以期從結(jié)構(gòu)生物學(xué)角度闡釋群體感應(yīng)信號(hào)分子IQS的產(chǎn)生機(jī)制,亦或?yàn)榻窈笕后w感應(yīng)抑制劑的研發(fā)提供理論基礎(chǔ)。 本研究結(jié)果包括:1.成功構(gòu)建表達(dá)載體,并利用原核系統(tǒng)表達(dá)蛋白,已獲得大量高純度AmbBc蛋白;2.篩選到10種AmbBc晶體生長(zhǎng)條件,經(jīng)優(yōu)化成功得到用于衍射的單晶;3.收集到分辨率高達(dá)2.5A的數(shù)據(jù);4.成功制備重金屬衍生物及硒代甲硫氨酸晶體;5.通過(guò)定點(diǎn)突變引入甲硫氨酸增強(qiáng)反常散射信號(hào)解決相位問(wèn)題,目前蛋白結(jié)構(gòu)已成功解析。
[Abstract]:With the widespread use of antibiotics in clinic, bacteria have become resistant to infection, so finding new ways to resist infection has become a hot research topic. As an important way of transmitting signals between bacteria, colony sensing (quorum sensing, QS) can release self-inducer molecules to regulate the release of many virulence factors and the pathogenicity of bacteria. Nowadays, QS has become an important target for the design of new drug resistant bacteria, because the drug does not affect the growth of bacteria, only inhibit the pathogenic behavior of QS regulation, so it will not cause drug resistance of bacteria in theory. Pseudomonas aeruginosa is a kind of conditional pathogen which can cause respiratory tract infection, pneumonia and other diseases. There are three signal molecule based QS systems: las,rhl and pqs. Among them, the las system is at the core, it can regulate the gene expression of rhl and pqs. However, with the further study of the QS system of Pseudomonas aeruginosa, it is found that the core position of las in the regulation of population induction is not absolute. It has been shown that non-ribosomal peptide synthase (AmbB) is involved in the synthesis of a novel QS signaling molecule, IQS, which replaces las under environmental pressure (e.g. low phosphorus environment) and regulates the rhl,pqs system. In this paper, the C-terminal domain of AmbB protein was studied by means of biochemistry and X-ray crystallography, in order to elucidate the mechanism of IQS production from the point of view of structural biology. Or for the future research and development of group induction inhibitors to provide a theoretical basis. The results of this study include: 1. The expression vector was successfully constructed and expressed in prokaryotic system. A large number of high purity AmbBc proteins were obtained. Ten kinds of AmbBc crystal growth conditions were selected and the single crystals used for diffraction were obtained successfully. 3. Data with a resolution of up to 2. 5 A were collected; 4. 4. Preparation of heavy Metal Derivatives and selenomethionine crystals; 5. The phase problem is solved by introducing methionine enhanced anomalous scattering signal by site-directed mutation, and the protein structure has been successfully analyzed.
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R3411

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2273416

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