河北省腸道病毒71型的病原特征研究
本文選題:手足口病 + 腸道病毒71型 ; 參考:《河北醫(yī)科大學》2009年碩士論文
【摘要】: 目的: 1了解河北省腸道病毒71型(EV71)在手足口病(HFMD)實驗室診斷病例和重癥病例中的感染情況,為進行HFMD的流行病學調(diào)查以及預防控制提供科學依據(jù)。 2分析河北省EV71分離株的基因型別,為采取針對性的控制措施,完善我國EV71的基因型和亞型分類資料,及時監(jiān)測本地區(qū)的EV71流行株以及進行疫苗的研制打下基礎。 方法: 1通過流行病學調(diào)查,采集HFMD臨床診斷病例的咽拭子、皰疹液、糞便、腦脊液和血清標本。 2針對腸道病毒(EV)5′端非編碼區(qū)保守基因序列以及EV71 VP1區(qū)基因序列設計EV通用引物和EV71型特異引物,通過RT-PCR擴增檢測HFMD臨床診斷病例的標本,瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物。 3將RT-PCR檢測為EV71陽性的HFMD實驗室診斷病例標本接種RD細胞分離病毒;選用EV71型特異引物通過RT-PCR對出現(xiàn)細胞病變(CPE)的標本進行毒株鑒定,挑選18株EV71陽性的毒株作為河北省EV71的代表株。 4針對EV71的VP1區(qū)全核苷酸序列設計引物,用RT-PCR擴增18株EV71代表株的VP1區(qū),純化回收PCR擴增產(chǎn)物并測定其序列,用DNASTAR軟件進行核苷酸序列同源性分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,對河北省EV71代表株的基因亞型進行分析。 結(jié)果: 1采用RT-PCR法共檢測HFMD臨床診斷病例1005份標本,594份標本EV陽性,陽性率為59.1%,293份標本EV71陽性,陽性率為29.2%。其中共檢測皰疹液標本138份,59份EV71陽性,陽性檢出率為42.8%;糞便標本7份,2份EV71陽性,陽性檢出率為28.6%;咽拭子標本840份,232份EV71陽性,陽性檢出率為27.6%;腦脊液和血清標本中均未檢出EV71。 2可以從不同時間采集的HFMD臨床診斷病例標本中檢出EV71,其采集的時間分布為:從咽拭子標本中檢出的時間分布為0-10天,中位數(shù)為2天;從皰疹液標本中檢出的時間分布為0-11天,中位數(shù)為2天;從糞便標本中檢出的時間分布為3-5天,中位數(shù)為4天。 3將RT-PCR檢測為EV71陽性的HFMD實驗室診斷病例201份標本接種RD細胞進行病毒分離,出現(xiàn)CPE的標本經(jīng)RT-PCR鑒定,其中74份為EV71陽性,分離率為36.8%。糞便標本接種95份,分離38份,分離率為40.0%;咽拭子標本接種70份,分離19份,分離率為27.1%;皰疹液標本接種31份,分離17份,分離率為54.8%;腦脊液標本接種5份,沒有分離出EV71毒株。 4 522例HFMD實驗室診斷病例中,244例為EV71感染者,感染率為46.7%,其中217例為輕癥病例,占EV71感染者的88.9%,具有HFMD的一般表現(xiàn):發(fā)熱和皮疹;27例為重癥病例,占EV71感染者的11.1%,具有神經(jīng)系統(tǒng)和呼吸系統(tǒng)的并發(fā)癥。 5 522例HFMD實驗室診斷病例中,482例為輕癥病例,其中217例為EV71感染者,感染率為45.0 %;40例為重癥病例,其中27例為EV71感染者,感染率為67.5%。 6在EV71感染者中,男性156例,占EV71感染者的63.9%,女性88例,EV71感染者的36.1%,男性:女性為1.77:1,男性EV71感染率為46.4%,女性EV71感染率為47.3%;EV71感染者中年齡最小為4月,最大為17歲,其中0歲組有1例感染者,占總感染人數(shù)的0.4%,1~3歲組167例,占總感染人數(shù)的68.4%,4~6歲組65例,占總感染人數(shù)的26.7%,7~17歲組11例,占總感染人數(shù)的4.5%;在職業(yè)分布中,以散居兒童為主,占78.81%,幼托兒童占16.02%,學生占4.83%,其它占0.34%。 7河北省18株EV71代表株之間VP1區(qū)核苷酸序列同源性為95.2%~100%;與臺灣分離株VP1區(qū)同源性在88.8%~90%之間,與浙江省、上海市、深圳市、重慶市、北京市和阜陽市分離株VP1區(qū)同源性較高,在94.6%~99.4%之間;與A、B基因型代表株VP1區(qū)同源性差異較大,分別在81.4%~83.1%、83.8%~85.1%之間,與C基因型代表株VP1區(qū)同源性比較接近,在88.1%~98.4%之間;與已知基因型C1、C2、C3、C4代表株的同源性分別在89.5%~91.4%、89.1%~90.2%、88.1%~89%、96.3%~98.4%之間。 8 EV71毒株基因分型及系統(tǒng)進化樹分析表明,河北省代表株為C4亞型,與中國大陸分離株的流行一致。 結(jié)論: 1 RT-PCR可以直接檢測HFMD臨床診斷病例的標本,可用于HFMD病原的早期快速診斷。 2標本類型不同,EV71的陽性檢出率不同,皰疹液標本的EV71陽性檢出率高于咽拭子標本的檢出率;常規(guī)檢測中也可用糞便標本來檢測EV71病毒;最好采集發(fā)病一周之內(nèi)的皰疹液、咽拭子和糞便標本來檢測EV71。 3皰疹液、咽拭子和糞便標本均可接種RD細胞分離EV71病毒,皰疹液標本的病毒分離率高于咽拭子標本的分離率。 4 EV71病毒是HFMD實驗室診斷病例的主要病原之一,能夠引起輕癥病例和重癥病例的發(fā)生,以輕癥病例為主,而且重癥病例的EV71感染率高于輕癥病例的EV71感染率。 5男性和女性均可感染EV71發(fā)生HFMD,EV71的感染率無性別差異;1~3歲組兒童是EV71感染的主要人群,4~6歲組次之,以散居兒童為主。 6 EV71毒株基因分型及系統(tǒng)進化樹分析表明,河北省代表株為C4亞型,與中國大陸分離株的流行一致。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:河北醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2009
【分類號】:R725.1;R373
【參考文獻】
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,本文編號:2081138
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